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水稻新型潜在冷调节蛋白的生物信息学预测与分析: 2011年; 冷调节蛋白是一类抗寒相关蛋白,其种类十分广泛。几种水稻冷调节蛋白也曾在水稻中被发现,但是目前深入了解的水稻冷调节蛋白种类较少。作者运用生物信息学方法,用已知的冷调节蛋白作为电子探针,预测出16种水稻新型潜在冷调节蛋白,并且使用NCBI-conserved domains、SWISS-MODEL和ExPASY ProtParam tool等在线软件预测它们的功能结构域和二、三级结构以及氨基酸组成,对其作为冷调节蛋白潜在家族成员的真实性、可靠性做出理论上的判断。分析表明,这16种水稻新型潜在冷调节蛋白,符合冷调节蛋白的一些基本的结构特征,具有其他冷调节蛋白相同的功能结构域,为这16种蛋白属于水稻冷调节蛋白家族提供了一些理论依据。; 王鹏飞任相亮陈曦王荣富马飞; 关键词：冷害生物信息学水稻

一个新的水稻白化转绿突变体G_9的特性研究被引量：9: 2010年; 利用60Coγ射线离体诱变籼稻光温敏核不育系广占63S,获得一个新的白化转绿突变体G9。该突变体从出苗到4叶1心期,叶色表现出明显的白化现象,从第4新生叶开始,新老叶片开始转为正常绿色,到6叶1心时秧苗完全转绿;在2叶期,其叶片叶绿素含量极少,随着叶色转绿,叶绿素含量开始显著增加,4叶期约为亲本的1/4,而至6叶期,突变体和亲本的总叶绿素含量无显著差异。遗传分析表明,该突变体的叶色白化转绿变异受一对隐性核基因控制。用144个SSR标记分析了突变体和亲本的SSR组型,未发现两者之间存在差异,说明该突变体确系诱发突变而来,两者存在很好的近等基因特性。对G9/AM6的F4代的农艺性状进行比较,发现突变基因对幼苗总根数、白根数、最长根长度和苗期株高均有显著影响;对植株分蘖能力、成熟期株高、单穗实粒数、结实率、千粒重、单株产量均有显著影响,而对有效穗数无明显影响。; 李瑞清武立权舒庆尧赵海军吴殿星王荣富; 关键词：水稻叶绿体

C_3和C_4植物中PEPC的生物信息学分析被引量：2: 2011年; PEPC是C4光合途径中的关键酶之一,为研究C3和C4植物PEPC功能上的差异,利用一系列的生物信息学软件分别分析了4种C3和C4植物PEPC基因编码蛋白的氨基酸组成、等电点、结构域、二级结构、空间结构等性质,并进行两类植物蛋白质的比对。结果表明,PEPC基因编码蛋白为不稳定蛋白质;二级结构主要是以无规则卷曲为主。同时揭示出C3和C4植物PEPC存在一定差异。用ESyPred3D的建模服务器进行PEPC结构的三维建模,预测得到一个同源性较高的蛋白质结构数据1JQO chain A,同源性为99.7%,从而构建目标序列的三级结构。利用PROCHECK对建模结果进行检测,模拟得到的玉米PEPC蛋白质的三维结构的氨基酸残基有94.2%位于Ramachandran点图中合理区域,模拟得到的玉米PEPC的三维结构是可靠的。; 吴梅张边江杨平王荣富陈全战; 关键词：C3植物 C4植物 PEPC 生物信息学

水稻不同亲本组合对F1代糙米氨基酸含量的影响被引量：2: 2012年; 采用日立L-8800氨基酸分析仪测定了4个中籼稻不育系、8个中籼稻恢复系及由此配制的10个杂交稻F1代糙米氨基酸含量。结果表明,杂交稻F1稻米各组合间氨基酸含量有一定差异,10个F1中,以明两优6号、绿敏S/4HZ021和绿敏S/凤恢35氨基酸总量和必需氨基酸含量最高,绿敏S/4HZ021赖氨酸含量最高,明两优6号亮氨酸含量最高;F1代氨基酸总量和必需氨基酸含量(色氨酸未测)均高于双亲含量;母本中以绿敏S为好,用此母本选配的杂交组合氨基酸总量和必需氨基酸含量相对较高,绿102S为母本的组合在所有组合中最低;父本对F1代氨基酸含量影响受母本所控制,需考虑配合力等因素。; 沙渺李娟王荣富武立权张德文; 关键词：杂交稻亲本氨基酸

Ⅱ型单纯疱疹病毒糖蛋白D的晶体结构解析(英文): 2011年; Ⅱ型单纯疱疹病毒（HSV-2）糖蛋白D（Glycoprotein D,gD）在介导该病毒入侵到宿主细胞中起着关键作用。为了更好地研究gD在病毒侵入过程中的作用机制,利用杆状病毒表达系统表达了gD胞外部分区域（1~285 aa）,通过Ni-NTA亲和层析以及分子排阻层析纯化后,得到的带His标签的分泌型可溶蛋白,用悬滴法对该蛋白进行了晶体筛选,获得了高质量的晶体。晶体生长条件为0.1 mol/L Hepes缓冲液（pH 7.2）,5%（V/V）2-甲基-2,4-戊二醇（MPD）,10%PEG10000,18℃。晶体能够衍射到1.8℃,属于P21空间群,晶胞参数为a=63.6,b=55.4,c=65.3,β=96.3°。该晶体的获得将为进一步研究gD的结构提供了基础,也为gD等同类囊膜蛋白的表达、纯化及结构研究提供了重要的参考。; 陈竹君逯光文齐建勋许翔张娜严景华王荣富; 关键词：杆状病毒表达系统纯化

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安徽省高校省级自然科学研究项目(KJ2010ZD04)