您的位置: 专家智库 > >

国家教育部博士点基金(20060626003)

作品数:11 被引量:82H指数:6
相关作者:李学伟朱砺李明洲李强陈磊更多>>
相关机构:四川农业大学国家工程研究中心学研究院更多>>
发文基金:国家教育部博士点基金长江学者和创新团队发展计划四川省教育厅青年基金更多>>
相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 8篇农业科学
  • 4篇生物学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 6篇基因
  • 3篇脂肪
  • 3篇脂肪沉积
  • 3篇基因差异
  • 3篇基因差异表达
  • 3篇肌肉生长
  • 2篇多态
  • 2篇多态性
  • 2篇多态性分析
  • 2篇遗传多态
  • 2篇遗传多态性
  • 2篇遗传多态性分...
  • 2篇嫩度
  • 2篇克隆
  • 2篇基因克隆
  • 2篇发育性
  • 2篇发育性变化
  • 1篇蛋白
  • 1篇调控网络
  • 1篇胰岛素样

机构

  • 9篇四川农业大学
  • 4篇国家工程研究...
  • 2篇学研究院

作者

  • 9篇朱砺
  • 9篇李学伟
  • 8篇李明洲
  • 5篇陈磊
  • 5篇李强
  • 4篇滕晓坤
  • 3篇郭玉姣
  • 3篇帅素容
  • 3篇肖华胜
  • 2篇唐国庆
  • 1篇肖杰文
  • 1篇刘海峰
  • 1篇姜延志

传媒

  • 1篇中国科学(C...
  • 1篇中国农业科学
  • 1篇Curren...
  • 1篇生理科学进展
  • 1篇遗传
  • 1篇中国生物化学...
  • 1篇自然科学进展
  • 1篇畜牧兽医学报
  • 1篇生物工程学报
  • 1篇Scienc...

年份

  • 10篇2008
11 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
长白猪和太湖猪不同生长阶段脂肪中肉质和胴体性状相关基因的表达谱分析被引量:4
2008年
动物个体的皮下脂肪厚度(subcutaneous fat thickness,SFT)和肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量取决于活体内脂肪酸合成与氧化竞争的动态平衡点.利用包含140个与猪脂肪沉积、代谢和肌肉生长密切相关基因的Oligo功能分类基因芯片检测了脂肪型的太湖猪和瘦肉型的长白猪在1,2,3,4和5月龄间背部皮下脂肪中这些基因的动态表达变化,发现长白猪有25个基因在月龄间的表达差异达显著水平(P<0.05),且包含23个基因的"参与脂肪或类固醇代谢的酶和调节蛋白"基因分组在品种间具有极显著意义(P<0.01).提示两猪种脂肪沉积能力的巨大表型差异可能与这些基因的差异表达规律密切相关.STEM聚类分析显示长白猪和太湖猪各有两个表达模式分别具有极显著(P<0.01)和显著性意义(P<0.05),但太湖猪基因表达谱比较分散,占主导优势的表达模式没有长白猪明显.提示太湖猪脂肪细胞内参与相关代谢活动的基因间的调控关系较长白猪复杂.基于动态贝叶斯模型构建的基因调控网络从一定程度上反映了两猪种在脂肪沉积代谢相关生理生化活动方面存在的明显差异,可从中挖掘相关性状潜在的关键特征基因.此外,对5个差异表达基因的荧光定量RT-PCR验证显示两种实验方法结果的相关系数平均高达0.874±0.071.以上结果筛选出了对于猪脂肪相关性状可能具有重要影响并值得深入研究的一些基因,初步揭示了生长发育过程中脂肪细胞基因表达调控的分子互作机制.
李明洲朱砺李学伟帅素容滕晓坤肖华胜李强陈磊郭玉姣王金勇
关键词:脂肪基因差异表达
脂肪型和瘦肉型猪肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达分析和调控网络构建被引量:8
2008年
骨骼肌细胞和脂肪细胞在生长发育过程中受到的微效多基因间的互作调控机制是决定猪胴体和肉质等相关数量性状的分子基础.利用包含140个与猪肌肉生长和脂肪沉积密切相关基因的Oligo功能分类芯片检测了脂肪型的太湖猪和瘦肉型的长白猪在初生及生后5月龄间背最长肌中这些基因的动态表达变化,发现长白猪分别有18和22个基因,太湖猪分别有3和7个基因在月龄间的表达差异达极显著(P<0.01)和显著水平(P<0.05).聚类结果显示先降后升、逐渐上升和逐渐下降、逐渐上升分别是长白猪和太湖猪在初生至5月龄间最具代表性的基因表达模式(P<0.01),其中正调控肌纤维生长和脂肪酸合成的基因主要表现为逐渐上调,而抑制细胞增殖和正调控脂肪酸β氧化的基因则主要表现为逐渐下降.基于动态Bayes模型构建的基因调控网络从一定程度上揭示了两品种在肌肉生长和脂肪沉积等生理生化活动方面的明显差异,可从中挖掘相关性状潜在的关键特征基因.此外,对5个差异表达基因的荧光定量RT-PCR验证显示两种检测方法所获结果的相关系数平均高达0.876±0.095.以上结果筛选出了对于猪胴体和肉质性状可能具有重要影响和具有深入研究价值的基因,为阐明肌肉生长和脂肪沉积的分子互作机制奠定了基础.
李明洲李学伟朱砺滕晓坤肖华胜帅素容陈磊李强郭玉姣
关键词:肌肉生长脂肪沉积基因差异表达基因调控网络
猪脂肪组织中IGF2和IGFBP3基因表达的发育性变化及其品种差异被引量:22
2008年
采用荧光定量PCR技术分析长白猪和太湖猪背部皮下脂肪组织中胰岛素样生长因子2和胰岛素样生长因子结合蛋白3基因在30、60、90、120和150日龄时表达水平的发育性变化。结果表明:(1)品种内日龄间比较,长白猪IGF2mRNA在30日龄时的表达量极显著高于其他日龄(P<0.01),之后逐渐下降,至120日龄降到最低,150日龄时又明显上升;太湖猪IGF2mRNA在30~60日龄的表达量较高,90日龄降至最低,120日龄迅速回升,之后又有所下降。两品种IGFBP3mRNA表达的发育性变化模式基本相同,30日龄时表达量最高,60日龄显著下降(P<0.05),之后趋于平缓但略有波动。(2)品种间同日龄比较,120日龄时太湖猪IGF2mRNA的表达量极显著高于长白猪(P<0.01),150日龄时太湖猪IGFBP3的表达量极显著低于长白猪(P<0.01),其余日龄间两品种差异均不显著(P>0.05)。研究结果提示:猪脂肪组织IGF2和IGFBP3基因表达存在明显的发育性变化和品种差异;IGF2基因表达水平的降低可能与脂肪细胞的增殖有关。
郭玉姣唐国庆李学伟朱砺李明洲
关键词:脂肪组织
猪Cathepsin B基因cDNA分子克隆、序列分析及遗传多态性分析被引量:4
2008年
采用RT-PCR结合克隆测序的方法,从猪肌肉组织总RNA中克隆出了猪组织蛋白酶B(Cathepsin B,CTSB)基因的cDNA序列,并推导出其编码的氨基酸序列。猪CTSB基因开放阅读框(ORF)全长1008 bp,编码335个氨基酸。同源性分析结果表明,猪与人、鼠、牛的CTSB基因cDNA编码区(CDS)同源性分别为85%、81%、90%,推测的氨基酸序列同源性分别为81%、79%、91%。利用同源性结合序列特征预测表明该蛋白具有信号肽和前肽序列。蛋白质结构同源建模分析表明,该蛋白具有木瓜蛋白酶家族的典型空间结构,包括1个底物结合凹槽和3个相互靠近的活性位点。另外采用PCR-SSCP方法,在147头个体中分析了CTSB基因第6内含子内的SS-CP位点多态性,检测到3个等位基因6种基因型。FF基因型个体的各项嫩度指标最高,其最大剪切力与硬度值分别为6.56 kg和23.55 kg.s,极显著地高于EE和EF基因型个体(P<0.01),平均剪切力为4.85 kg,显著地高于EF基因型个体(P<0.05)。
陈磊李学伟朱砺李强李明洲
关键词:基因克隆嫩度
猪背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达和主成分分析被引量:11
2008年
骨骼肌细胞和脂肪细胞在分化生长速度上相对竞争的平衡点是猪肉质和胴体性状的决定因素.利用Oligo功能分类芯片检测了瘦肉型的长白猪和脂肪型的太湖猪在初生、1、2、3、4和5月龄间背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的动态表达变化.差异表达分析结果显示,在初生至5月龄的品种间分别有15、16、11、13、18和20个基因的表达差异倍数大于2倍.品种内的方差分析表明,长白猪分别有18和22个基因,太湖猪分别有3和7个基因在月龄间的表达差异达极显著(P<0.01)和显著水平(P<0.05).主成分分析结果显示,先降后升是两品种内最具代表性的基因表达模式,且长白猪和太湖猪分别有7和6个基因的表达模式明显偏离其他基因,提示其可能受到了重要的调控.此外,5个差异表达基因的荧光定量RT-PCR验证结果均与芯片结果呈正相关趋势.以上结果筛选出了对于猪肉质和胴体性状可能具有重要影响,值得深入研究的一些候选基因,为深入研究生长发育过程中参与肌纤维生长和脂肪酸合成关键基因的表达变化规律和互作调控机制提供了基础数据.
李明洲李学伟朱砺滕晓坤肖华胜李强陈磊
关键词:基因芯片基因差异表达主成分分析
雌性藏猪不同生长发育阶段肌肉生长和脂肪沉积相关基因的表达模式被引量:7
2008年
本研究利用包含140个与猪肌肉生长和脂肪沉积密切相关基因的Oligo功能分类基因芯片检测了藏猪在2、4、6和8月龄间背最长肌中这些基因的表达量变化,并在2月龄时与脂肪型的太湖猪和瘦肉型的长白猪进行比较。ANOVA分析结果表明:2-8月龄间藏猪分别有10和7个基因的表达差异达极显著(P<0.01)和显著水平(P<0.05);2月龄时藏猪体重极显著低于长白猪(P<0.01)和显著低于太湖猪(P<0.05),而藏猪肌纤维面积却为最大,但品种间差异未达显著水平(P>0.05);2月龄时3个品种间分别有15和13个基因的表达差异达极显著(P<0.01)和显著水平(P<0.05)。STEM聚类分析结果表明:直线下降和上升是藏猪在2-8月龄间最具代表性的基因表达模式(P<0.01)。另外,5个差异表达基因的荧光定量RT-PCR验证结果与基因芯片结果的Person相关系数平均高达0.856±0.109。提示:藏猪在2-8月龄间骨骼肌生长发育强度较肌内脂肪合成沉积占优势,2月龄时藏猪脂肪酸合成相关基因的表达水平较其他两品种低,而脂肪酸β氧化和肌纤维生长相关基因的表达水平较高,与其在高原独特的自然生态环境和全放牧散养的饲喂方式下长期形成的品种特性相符。
李明洲李学伟帅素容朱砺刘海峰王金勇蒋忠荣滕晓坤
关键词:藏猪肌内脂肪
猪Cystatin B基因cDNA克隆及遗传多态性分析被引量:8
2008年
【目的】研究猪肉嫩度性状候选基因-半胱氨酸蛋白酶抑制素B(Cystatin B,CSTB)基因对肌肉宰后嫩化的作用,为研究嫩度性状的遗传机理提供理论基础。【方法】采用RT-PCR结合克隆测序的方法,从猪肌肉组织总RNA中克隆到猪CSTB基因cDNA序列,并推导出其编码的氨基酸序列。采用PCR-RFLP方法,分析了84头猪CSTB基因多态性及其与嫩度性状的关联性。【结果】CSTB基因开放阅读框全长294bp,编码98个氨基酸。同源性分析结果表明,猪与人、鼠、牛的CSTB基因cDNA编码区(CDS)同源性分别为81%、85%和89%,推测氨基酸序列同源性为83%、76%和85%。蛋白质结构同源建模分析表明,该蛋白与人、鼠Cystatin B类似,具有stefin类蛋白酶抑制剂的典型空间结构,包括5条平行的β-sheet和负责与被抑制酶结合的楔形边缘。在CSTB基因第二内含子内PvuⅡ酶切位点检测到了AA、AB和BB这3种基因型,关联性分析表明AA基因型个体的各项嫩度指标均极显著低于另2种基因型的个体(P<0.01),最大剪切力为5.11kg,硬度值为19.31kg·s、平均剪切力为3.26kg。【结论】CSTB基因在不同物种间具有较高同源性,猪CSTB基因多态性与猪肉嫩度性状显著相关。
陈磊李学伟朱砺李强李明洲
关键词:CYSTATINB基因基因克隆嫩度
利用功能分类基因芯片研究不同品种猪脂肪中特定基因的发育性变化被引量:3
2008年
利用Oligo功能分类基因芯片检测了瘦肉型的长白猪和脂肪型的太湖猪在1、2、3、4和5月龄间背部皮下脂肪中脂肪沉积代谢和细胞生长调控相关基因的动态表达变化。差异表达分析结果显示1~5月龄的品种间分别有10、6、11、8和19个基因的表达差异倍数大于2倍,且长白猪有25个基因在不同月龄间的表达差异达显著水平(P<0.05)。其中血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)、组织蛋白酶K(CTSK)、异柠檬酸脱氢酶2(NADP^+)(IDH2)、脂蛋白脂酶(LPL)、苹果酸酶1(MEI)、硬酯酰辅酶A去饱和酶(SCD)和解藕联蛋白2(UCP2)这7个基因不仅在同月龄的品种间和品种内的不同月龄间差异表达,主成分分析结果也显示其表达模式明显偏离其他基因,提示受到了特殊的调控。聚类分析结果显示1~5月龄间长白猪中正调控脂肪酸代谢基因的表达量逐渐上调,太湖猪中参与细胞生长调控基因的表达量平缓波动且变化幅度相对较小。另外,5个差异表达基因的荧光定量RT-PCR验证结果均与芯片结果呈正相关趋势。结果成功筛选出了对猪胴体和肉质性状可能具有重要影响并值得深入研究的一些候选基因,初步揭示了相关基因的表达变化规律,为了解生长发育过程中脂肪酸合成与水解的动态平衡过程提供了基础数据。
李明洲李学伟朱砺姜延志唐国庆
关键词:脂肪基因表达谱
促性腺激素释放激素受体的结构及其生物学功能被引量:12
2008年
促性腺激素释放激素受体(GnRHR)属于类视紫红质G-蛋白结合受体(GPCRs)家族的成员。当促性腺激素释放激素(GnRH)与GnRHR结合后,一系列细胞内信号通路被激活从而调节和表达各种生物学功能。本文对GnRHR的基因结构、分子结构、信号调节及生物学功能等进行了综述。
肖杰文李学伟朱砺
关键词:促性腺激素释放激素促性腺激素释放激素受体生物学功能
Expression profiling analysis for genes related to meat quality and carcass traits during postnatal development of backfat in two pig breeds被引量:1
2008年
The competitive equilibrium of fatty acid biosynthesis and oxidation in vivo determines porcine sub-cutaneous fat thickness(SFT) and intramuscular fat(IMF) content.Obese and lean-type pig breeds show obvious differences in adipose deposition;however, the molecular mechanism underlying this phenotypic variation remains unclear.We used pathway-focused oligo microarray studies to examine the expression changes of 140 genes associated with meat quality and carcass traits in backfat at five growth stages(1―5 months) of Landrace(a leaner, Western breed) and Taihu pigs(a fatty, indigenous, Chinese breed).Variance analysis(ANOVA) revealed that differences in the expression of 25 genes in Landrace pigs were significant(FDR adjusted permutation, P<0.05) among 5 growth stages.Gene class test(GCT) indicated that a gene-group was very significant between 2 pig breeds across 5 growth stages(PErmineJ<0.01), which consisted of 23 genes encoding enzymes and regulatory proteins associ-ated with lipid and steroid metabolism.These findings suggest that the distinct differences in fat deposition ability between Landrace and Taihu pigs may closely correlate with the expression changes of these genes.Clustering analysis revealed a very high level of significance(FDR adjusted, P<0.01) for 2 gene expression patterns in Landrace pigs and a high level of significance(FDR adjusted, P<0.05) for 2 gene expression patterns in Taihu pigs.Also, expression patterns of genes were more diversified in Taihu pigs than those in Landrace pigs, which suggests that the regulatory mechanism of micro-effect polygenes in adipocytes may be more complex in Taihu pigs than in Landrace pigs.Based on a dy-namic Bayesian network(DBN) model, gene regulatory networks(GRNs) were reconstructed from time-series data for each pig breed.These two GRNs initially revealed the distinct differences in physiological and biochemical aspects of adipose metabolism between the two pig breeds;from these results, some potential key genes could be identified.Quantitative, real-ti
LI MingZhou1, ZHU Li1, LI XueWei1, SHUAI SuRong1, TENG XiaoKun2, XIAO HuaSheng2, LI Qiang1, CHEN Lei1, GUO YuJiao1 & WANG JinYong3
关键词:PIGADIPOSEMICROARRAYGENEANALYSISGENE
共1页<1>
聚类工具0