安徽省高校省级自然科学研究项目(KJ2011B169)
- 作品数:3 被引量:16H指数:3
- 相关作者:陈黎万志兵王言言曹玲玲陈燕更多>>
- 相关机构:黄山学院更多>>
- 发文基金:安徽省高校省级自然科学研究项目安徽省高等学校优秀青年人才基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 菊花EST-SSR分析及标记开发被引量:4
- 2013年
- 为了开发菊花的分子标记,对7 087条菊花EST进行拼接,得到275个contigs,发现50个SSR位点;在拼接的contigs中SSR平均密度为每2 854.3 bp含有1个SSR。三核苷酸重复基元的SSR类型最多,占总数的50.00%;在二碱基重复中,最主要的优势重复基元是AC和AG;三碱基中CAT和CCA为优势重复基元;四碱基、五碱基重复类型中,(TTTN)n和(ATTTN)n重复基元为对应优势基元;这些优势重复基元中富含碱基A和T,菊花EST序列中高度变异的微卫星(长度>20 bp)约占2.00%。根据得到的菊花EST-SSR,共设计出428对引物,并选取了28对SSR引物对黄山贡菊基因组DNA进行PCR扩增,其中有27对引物扩增成功。
- 万志兵陈燕闫莹莹陈黎
- 关键词:表达序列标签简单重复序列菊花
- 黄山贡菊组织培养与快速繁殖技术研究被引量:5
- 2013年
- 以黄山贡菊的茎尖、叶片及根为外植体,进行了黄山贡菊芽的诱导、继代增殖培养、瓶外生根壮苗试验。结果表明MS+6-BA2mg/L+0.1NAAmg/L是诱导黄山贡菊芽形成的最佳培养基,茎尖诱导率最高达95%;MS+6-BA2mg/L+0.01NAAmg/L是黄山贡菊芽继代增殖的最佳培养基,增殖系数达13.2;在生产上,可采用试管苗瓶外生根方法进行黄山贡菊的快速繁殖。
- 陈黎万志兵曹玲玲
- 关键词:黄山贡菊外植体
- 菊花EST-SNP的发掘与特征分析被引量:7
- 2013年
- 下载GenBank数据库中已公布的菊花EST序列7 087条,利用GS De nove Assembler软件进行叠连群构建,EST序列构建275个叠连群,长度共计142 713 bp,发现候选SNP位点214个,SNP平均出现频率为0.15%,共有52个contigs含有SNP位点,每个contig含有4.12个SNP位点,一个contig含有的SNP位点数最多的是40个,40.39%的contigs只含有1个SNP位点;不同叠连群所含SNP位点的数量差异较大,且转换类型明显高于颠换类型;Contigs的总长度是142 713 bp,平均666.9 bp含有1个SNP位点。另外,还应用Primer Premier5.0,按照引物设计要求,共设计出1 322对EST-SNP引物。
- 万志兵王言言陈黎
- 关键词:菊花单核苷酸多态性分子标记