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国家重点基础研究发展计划(2011CB109300)

作品数：28 被引量：235H指数：10
相关作者：姜慧芳陈玉宁任小平黄莉廖伯寿更多>>
相关机构：中国农业科学院油料作物研究所南京农业大学中南民族大学更多>>
发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
相关领域：农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 28篇中文期刊文章

领域

  • 25篇农业科学
  • 7篇生物学

主题

  • 11篇基因
  • 9篇油菜
  • 8篇花生
  • 7篇甘蓝
  • 6篇甘蓝型
  • 6篇甘蓝型油菜
  • 5篇性状
  • 4篇芝麻
  • 4篇QTL
  • 3篇相关性状
  • 3篇连锁图
  • 3篇基因家族
  • 3篇SSR标记
  • 2篇蛋白
  • 2篇遗传连锁图
  • 2篇种质
  • 2篇芸薹
  • 2篇芸薹属
  • 2篇进化分析
  • 2篇抗性

机构

  • 19篇中国农业科学...
  • 5篇南京农业大学
  • 3篇中南民族大学
  • 2篇华中农业大学
  • 1篇甘肃省农业科...
  • 1篇甘肃农业大学
  • 1篇南阳师范学院
  • 1篇河西学院

作者

  • 9篇任小平
  • 9篇陈玉宁
  • 9篇姜慧芳
  • 8篇黄莉
  • 6篇周小静
  • 6篇刘胜毅
  • 6篇廖伯寿
  • 6篇董彩华
  • 5篇于景印
  • 4篇童超波
  • 4篇黄军艳
  • 3篇袁午舟
  • 2篇唐梅
  • 2篇晏立英
  • 2篇程晓晖
  • 2篇吕培军
  • 2篇李锋
  • 2篇郭旺珍
  • 2篇张天真
  • 2篇张晓杰

传媒

  • 10篇作物学报
  • 9篇中国油料作物...
  • 1篇植物营养与肥...
  • 1篇中国农业科技...
  • 1篇中国农业科学
  • 1篇遗传
  • 1篇南京农业大学...
  • 1篇西北植物学报
  • 1篇Scienc...
  • 1篇Journa...
  • 1篇Journa...

年份

  • 2篇2016
  • 5篇2015
  • 6篇2014
  • 6篇2013
  • 5篇2012
  • 4篇2011
共 28 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
源于栽培种花生的EST-SSR引物对野生花生扩增的多态性被引量：8
2012年
以花生属86份野生近缘种和3份栽培种为材料,利用从栽培种花生中开发设计的EST-SSR引物,分析其对野生花生扩增的有效性,探讨EST-SSR引物用于花生资源遗传多样性研究的适用性。随机选取235对EST-SSR引物进行筛选,223对EST-SSR引物均扩增出条带,有效性为94.89%,其中能检测到多态性的53对引物在89份资源中共扩增出238条带,包括206条多态性带。每对引物能扩增出1～12多态性带,平均3.89条,多态性指数为0.044～4.040,平均1.173。统计分析结果表明,89份花生种质材料间的平均相似系数为0.685,变异范围为0.442～0.976,在遗传距离为0.408处,分成2大组9小组,栽培种花生被聚在花生区组中,相同区组的材料基本被聚在一起,A.duranensis与栽培种花生(A.hypogaea L.)的关系较近,聚类结果与花生属的植物学分类基本一致。对含油量和基因型数据相关性分析和t检验发现,POCR437-180/170等6对标记可以作为含油量相关分析标记筛选的后备标记。用这6对标记的引物序列搜索cDNA文库和BLAST库,发现引物POCR437序列对应丙二酸单酰-CoA-ACP转酰酶和酰基载体蛋白的编码基因,这2种蛋白质参与脂肪酸的合成。
唐梅陈玉宁任小平黄莉周小静严海燕姜慧芳
关键词：野生花生EST-SSR聚类分析
高产高油花生新品种中花16及其亲本荚果相关性状的SSR标记鉴定
2014年
阐释荚果相关性状的遗传基础是改良花生品种产量的重要前提。本研究以高产高油新品种中花16及其2个直接亲本和6个间接亲本为材料,对荚果性状及其相应SSR标记进行鉴定。结果表明,中花16的荚果长、百果重和百仁重低于其直接亲本8130和中花5号,但高于全部供试8个亲本的平均值;荚果宽和种子宽大于直接亲本和间接亲本的对应值;种子长高于直接亲本和8个亲本的平均值。通过136对多态性SSR引物鉴定表明,中花16具有直接亲本8130的64.1%和中花5号87.3%的条带,且中花16还具有一些直接亲本中不存在而在间接亲本中存在的一些条带。综合分析SSR标记带型和表型数据,鉴定出5个与百果重相关、4个与百仁重相关、3个与荚果长相关、3个与种子长相关的候选分子标记。综合分析表明,直接和间接亲本中与大果性状相关的标记IPAHM606-1、IPAHM531-1、GA8-2、1B9-4和HAS0428-2条带在育种过程中传递给了中花16。
成良强黄莉任小平陈玉宁周小静姜慧芳雷永黄家权晏立英廖伯寿
关键词：花生品种高产高油
白菜型冬油菜抗寒相关性状的遗传分析被引量：11
2016年
【目的】了解白菜型冬油菜抗寒相关性状的遗传方式,为油菜抗寒性的遗传育种提供一定的理论依据。【方法】以6个抗寒性不同的白菜型冬油菜品种(系)为亲本材料,按照GriffingⅠ配制完全双列杂交组合,将亲本和F_1种植后测定抗寒性相关的性状以获得试验数据。采用QGAStation软件中的加性-显性遗传模型和MINQUE(1)法,对白菜型冬油菜越冬率及11个理化性状的遗传方差分量比率、遗传相关性、亲本加性效应、组合显性效应和遗传率以及杂种优势进行分析。【结果】越冬率、POD活性、SOD活性、可溶性糖含量、相对电导率、叶绿素含量、蒸腾速率和气孔导度的遗传主要以加性效应为主,显性效应影响较小;CAT活性、丙二醛含量、可溶性蛋白含量和净光合速率则主要以显性效应为主。在基因型和表现型的相关分析上,越冬率与CAT活性、POD活性、SOD活性、可溶性蛋白含量、可溶性糖含量、叶绿素含量、蒸腾速率、气孔导度和净光合速率呈极显著正相关,与丙二醛含量和相对电导率则呈极显著负相关。陇油7号和陇油8号在越冬率、CAT活性、POD活性、SOD活性、可溶性蛋白含量、可溶性糖含量、叶绿素含量、蒸腾速率、气孔导度和净光合速率上的加性效应均呈正值,表明陇油7号和陇油8号可用作提高后代抗寒性的亲本。显性效应分析表明,陇油7号×GY和陇油7号×陇油8号是抗寒性强的组合。狭义遗传率以SOD活性、相对电导率、蒸腾速率和越冬率的表现最好,分别为74.63%、59.06%、57.49%和56.87%,CAT活性最低,为2.83%。CAT活性、可溶性蛋白含量和净光合速率3个抗寒相关性状具有很强的群体平均优势和群体超亲优势。【结论】越冬率、SOD活性、相对电导率和蒸腾速率适宜在早代选择,亲本评价分析指出,陇油7号的一般配合力高,可作为冬油菜抗寒性改良的首选亲本。
刘林波孙万仓刘自刚武军艳方彦李学才曾秀存杨刚董云陈奇方园袁金海
关键词：冬油菜加性效应显性效应
ICRISAT花生微核心种质农艺性状和黄曲霉抗性关联分析被引量：20
2012年
以国际半干旱热带地区作物研究所(ICRISAT)花生微核心种质146份资源为材料,鉴定农艺性状和黄曲霉抗性,用26对SSR引物检测多态性位点,在分析连锁不平衡、群体结构和Kinship的基础上进行关联分析。连锁不平衡的分布显示R2平均值为0.185,表明26对SSR引物扩增的120个位点之间具有较低的连锁不平衡程度。群体结构分析结果将146份花生品种分为2个亚群,分别对应疏枝亚种和密枝亚种,与植物学分类和遗传分化分析的结果基本一致。关联分析表明,共有39个位点与10个农艺性状(株高、总分枝数、第一分枝数、小叶宽、结果分枝数、百果重、出仁率、单株生产力、种子长、种子宽)相关联,表型变异解释率为1.50%～20.34%,16个SSR位点与黄曲霉侵染病情指数、黄曲霉产毒量相关联,表型变异解释率为5.23%～17.19%,与农艺性状、黄曲霉抗性同时相关联的SSR位点有13个。关联位点的等位变异效应分析表明,10个农艺性状和2个黄曲霉抗性性状共有63个增效等位变异和47个减效等位变异,并发掘了ICG6022等携有优良等位变异的载体品种。
黄莉任小平张晓杰陈玉宁姜慧芳
关键词：花生微核心种质SSR标记
Molecular Cloning and Characterization of Three Novel Genes Related to Fatty Acid Degradation and Their Responses to Abiotic Stresses in Gossypium hirsutum L.被引量：1
2013年
Fatty acid metabolism is responsible not only for oilseed metabolism but also for plant responses to abiotic stresses. In this study, three novel genes related to fatty acid degradation designated GhACX, Gh4CL, and GhMFP, respectively, were isolated from Gossypium hirsutum acc. TM-1. The phylogenetic analysis revealed that amino acid sequences of GhACXand GhMFP have the highest homology with those from Vitis vinifera, and Gh4CL has a closer genetic relationship with that from Camellia sinensis. Tissue- and organ-specific analysis showed that the three genes expressed widely in all the tested tissues, including ovules and fiber at different developing stages, with expressed preferentially in some organs. Among them, GhACX showed the most abundant transcripts in seeds at 25 d post anthesis （DPA）, however, GhMFP and Gh4CL have the strongest expression level in ovules on the day of anthesis. Based on real-time quantitative RT-PCR, the three genes were differentially regulated when induced under wounding, methyl jasmonate （MeJA）, cold, and abscisic acid （ABA） treatments. The characterization and expression pattern of three novel fatty acid degradation related genes will aid both to understand the roles of fatty acid degradation related genes as precursor in stress stimuli and to elucidate the physiological function in cotton oilseed metabolism.
DONG JiaWEI Li-binHU YanGUO Wang-zhen
Vector cleaner:一种新的去除测序目的基因载体序列的方法被引量：2
2014年
Sanger测序法测序目的基因常包含有目的基因和载体序列,为了快速去除测序目的基因载体序列,提出了一种新的目的基因载体序列去除方法并开发了程序Vector cleaner。首先利用该程序批量读取引物信息和目的基因测序序列;其次,程序在所读取的引物序列上建立引物半长的滑动窗口来产生种子,通过计数种子与测序序列的匹配次数,定位引物位置和删除引物两侧的载体序列;最后,程序通过比较上游引物序列和其反向互补序列分别与测序序列匹配种子数,判断和转换正义链。使用Vector cleaner对12条GhVIN1基因测序序列进行去载体测试,并与Seqclean和SeqMan软件相比较。结果表明:Vector cleaner能有效去除棉花GhVIN1基因测序载体序列,识别并翻译反义链序列。与Seqclean和SeqMan软件相比较,Vector cleaner正确率高,敏感性强。Vector cleaner、SeqMan和Seqclean所测试序列的总序列数正确率分别为100%、100%和91.6%,总碱基正确率分别为99.90%、99.00%和94.33%。与同类软件比较,Vector cleaner更适合实验人员批量去除测序目的基因载体序列,具有准确率高、敏感性强、自动翻译反义链的特点。
赵汀周宝良
关键词：VECTORCLEANERPERL语言
花生遗传图谱构建及黄曲霉抗性相关QTL被引量：8
2015年
创制抗黄曲霉种质并建立相关分子标记辅助选择技术是深化抗性遗传改良的基础。本研究以源于对黄曲霉具有不同抗性的花生品种中花10号（感病种质）与ICG12625（抗性种质）杂交构建的重组自交系（RIL）群体为材料,通过重复接种鉴定,发现所涉及重组自交系群体的黄曲霉抗性存在很大分化,遗传分析结果显示,侵染和产毒抗性均符合2对主基因＋多基因遗传模型;获得侵染指数较低的RIL家系1个（QT401）,毒素浓度较低的家系4个（QT344、QT389、QT477和QT483）。通过对RIL群体的多态性检测并应用Joinmap3.0软件,构建了1张由458个SSR标记位点组成、包含20个连锁群、总长为1165.45cM的遗传连锁图。结合抗性鉴定数据,应用WinQTLCart2.0软件的复合区间作图（CIM）法,获得了6个与黄曲霉侵染抗性相关的QTL和10个与产毒抗性相关的QTL,贡献率在6.34%-12.00%之间。
李前波杨春燕黄莉任小平王后苗陈玉宁周小静姜慧芳雷永晏立英廖伯寿
关键词：花生黄曲霉抗性遗传连锁图QTL
甘蓝型油菜ACCase、DGAT2和PEPC基因对氮素用量的应答被引量：5
2012年
氮肥是生长发育需要的重要营养元素之一。为了研究氮肥对油菜蛋白与油脂含量以及其合成相关基因表达水平的影响,本研究以品种中双11和Parter(德国)为材料,检测N 0、90、180和270 kg/hm2氮肥水平下种子含油量和蛋白质含量,并检测ACCase,DGAT2和PEPC基因在施氮肥(N 180 kg/hm2)和未施氮肥植株不同发育时期种子中的表达水平。结果发现,随施氮量增加,含油量降低,蛋白质含量增加,且Parter含油量下降程度明显高于中双11。授粉后7～25 d,ACCase和DGAT2的表达水平在两个品种施氮和未施氮条件下均无明显变化;授粉后31d,施氮与未施氮相比,两个基因在中双11中的表达量分别下降1倍和12倍,而在Parter中的表达量均上升约1倍。在施氮条件下,PEPC基因在两个品种的表达高峰期均提前,中双11由授粉后31 d提前到13 d,Parter由13 d提前到7 d,说明3个基因对氮肥的响应存在基因型的差异。
闫贵欣陈碧云许鲲高桂珍吕培军伍晓明李锋李俊
关键词：甘蓝型油菜基因表达水平
一个棉花GDSL脂肪酶基因的克隆与功能分析被引量：3
2013年
GDSL脂肪酶与GXSXG脂肪酶是2个重要的脂肪酶亚家族。其中,GDSL家族脂肪酶具有水解酶活性,能水解多种酯类物质。本试验根据新乡小吉无绒无絮(XinWX)和无绒有絮(XinFLM)近等基因系纤维起始期29K芯片竞争杂交结果,选择了一个在纤维起始期具有极显著表达差异的EST序列(GenBank登录号为DR458916),以该序列信息为探针,利用电子克隆方法并进行cDNA及基因组全长基因PCR扩增、测序验证,克隆获得一个陆地棉GDSL脂肪酶基因(GhGDSL;GenBank登录号为KC186125)。该基因ORF长1065bp,编码354个氨基酸,含有5个外显子和4个内含子。该基因在二倍体棉种基因组中含一个拷贝,在四倍体棉种基因组中含2个拷贝。序列比对显示该基因在四倍体棉种的2个亚组中独立进化,且D亚组比A亚组变异大。染色体定位显示该基因2个拷贝分别位于A4(Chr.4)和D4(Chr.22)染色体上。定量RT-PCR结果表明,GhGDSL在开花后3～10d的纤维组织中表达量高,其中在海7124中表达高峰在8DPA,在TM-1中表达高峰从5DPA持续到10DPA。利用[(TM-1×Hai7124)×TM-1]的BC1S1群体开展GhGDSL功能与纤维、种子品质性状关联分析,发现该基因A亚组的拷贝与种子脂肪含量存在显著相关(P=0.048);D亚组的拷贝与种子蛋白含量存在极显著相关(P=0.008)。推测GhGDSL基因功能与种子中脂肪、蛋白代谢相关,同时也参与纤维伸长过程。
佟祥超王丽曼胡文静张雪颖张天真郭旺珍
关键词：克隆基因定位棉花
中国花生地方品种与育成品种的遗传多样性被引量：17
2011年
以中国花生小核心种质中涉及来源于中国本土的145份地方品种和67份育成品种为材料,应用SSR技术从206对SSR引物中筛选出25对扩增效果好的多态性引物进行检测,并对其进行遗传多样性分析比较。结果表明：（1）地方品种与育成品种各具有特殊带型及各自独特的遗传特性。相似系数和多态性信息量均表明,地方品种的多样性比育成品种丰富,其中：地方品种之间的相似系数为0.57~0.99,平均0.795,多态性信息量0.530 0;育成品种之间的相似系数0.63~0.99,平均0.810,多态性信息量0.463 3。地方品种与育成品种之间的平均相似系数为0.794,变异范围0.56~0.99。（2）对不同生态区来源的分析表明,除黄河流域外其他各生态区地方品种的观测等位基因数和遗传多样性指数（分别为2.740 7~3.518 5和0.816 4~0.879 4）均比育成品种的对应值（分别为1.701 2~2.145 6和0.482 9~0.802 2）大,并以长江流域生态区地方品种的观测等位基因数和遗传多样性指数最大,分别为3.518 5和0.879 4。（3）聚类分析结果表明,花生核心种质中,中国本土资源分为3个品种群,即地方品种密枝亚种群、地方品种疏枝亚种群和育成品种群,与花生的亚种分类一致。（4）通过遗传多样性分析,鉴定出一批遗传差异较大的材料,其中zhh1398与zhh0041的遗传差异最大,相似系数为0.56,为花生品种的遗传改良及作图群体的构建奠定了基础。
姜慧芳任小平陈玉宁张晓杰黄家权廖伯寿
关键词：花生育成品种SSR遗传多样性
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