国家重点实验室开放基金(SKLVBF200905)
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 相关作者：张德礼桑青王芬宋宝兴郭娟娟更多>>
- 相关机构：西北农林科技大学中国农业科学院更多>>
- 发文基金：国家重点实验室开放基金国家自然科学基金“十二五”国家科技计划农村领域更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 基于蛋白质相互作用网络挖掘物种内的功能相似蛋白质被引量：3
- 2011年
- 本文基于图论(graph theory)思想挖掘功能相似蛋白质。将蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction network,PPI)转化为图,使用1-hop方法把相互作用网络拆分为子图。应用最短路径法,依次把拆分得到的每一个子图与所有子图进行两两比对,寻找最优比对结果,挖掘物种内有相似功能的蛋白质。应用该方法对构建的人类蛋白质相互作用网络进行比对,共挖掘到1081对功能相似蛋白质。该方法的特点是数据量偏小、较可靠。计算结果中还出现了一些序列相似度较低、用序列比对的方法难以挖掘到的功能相似蛋白质。通过对结果的分析可以发现,趋同进化和同源有时很难区分。本实验的全部数据、程序和结果可在网站http://bina.biositemap.com上查询。
- 宋宝兴桑青王芬张德礼
- 关键词：同源蛋白质相互作用网络
- 兔抗猪CD163蛋白多克隆抗体制备及鉴定被引量：1
- 2012年
- 为制备兔抗猪CD163多克隆抗体,采用RT-PCR方法从猪PAM RNA中扩增CD163胞质外区部分基因SRCR4-5,克隆至pGEX-6p-1原核表达载体,在IPTG诱导下获得约50 000以包涵体形式表达的重组蛋白。WesternBlotting分析表明,表达产物能够被GST单抗所识别。用该重组蛋白免疫兔制备多抗血清,经间接ELISA检测,多抗血清效价可达105,流式检测发现可与Marc-145和PAM上的天然CD163分子相互作用。抗体阻断试验证明制备的多抗血清可以部分阻断PRRSV感染。本试验为进一步研究PRRSV与受体-CD163相互作用机制打下了基础。
- 郭娟娟彭金美彭金美安同庆冷超良吴江宫大庆陈家锃杨永倩田志军
- 关键词：抗体
