辽宁省教育厅基金(05L027)
- 作品数：3 被引量：7H指数：2
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- 相关机构：大连大学更多>>
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- 相关领域：一般工业技术医药卫生理学更多>>
- 圆柱形纳米孔道内受限溶液I_2/Ar的分子动力学模拟研究被引量：4
- 2008年
- 利用分子动力学模拟方法,考察了受限于圆柱形纳米孔道内I2/Ar溶液的振动传能及扩散动力学.计算得到了溶质振动弛豫时间T1、溶剂轴向扩散系数Dz随孔道半径变化的规律.结果表明:T1随着孔道半径的增大而减小;而Dz随着孔道半径的增大而增大;与预期的一致,随着孔道半径的增大,孔道的限制作用逐渐减小,T1与Dz趋近于相应的非受限溶液体相值.此外,通过考察溶质、溶剂与孔道的相互作用,在原子、分子层次上揭示了限制作用对传能与传质影响的机制.
- 胡凡郑学仿李钦宁李慎敏
- 关键词：分子动力学模拟
- 人体端粒中(3＋1)混合结构G-四链体稳定性的分子动力学模拟被引量：3
- 2009年
- 利用分子动力学模拟方法,考察了人体端粒中(3+1)混合结构G-四链体的结构及稳定性问题.讨论了配位K+离子、药物分子(端粒抑素)和溶剂水分子对G-四链体的Hoogsteen氢键结构、π-π堆积作用的影响.研究表明,K+离子与鸟嘌呤碱基上O6原子的配位作用减弱了对角鸟嘌呤间O6-O6的静电排斥作用,使得相邻的四个鸟嘌呤能够以Hoogsteen氢键结合的方式形成具有近平面结构的稳定G-四平面.另一方面,G-四平面间、G-四平面与药物分子间的π-π堆积作用降低了G-四链体复合物的总能,有利于其稳定存在.此外,溶剂水分子主要分布在G-四链体的TTA环、骨架和糖环的周围,使其位移涨落增大;然而,在3ns动力学模拟中,由于水分子没有进入到G-四链体的空腔中,溶剂水对G-四平面的结构影响不明显.
- 沈新媛吕洋李慎敏
- 关键词：Π-Π堆积作用分子动力学模拟
- 混合量子-经典动力学方法研究反胶团水池中Ⅰ_2分子的振动频率位移被引量：1
- 2009年
- 结合Monte Carlo模拟技术,提出了一种反胶团溶液的快速数学建模新方法.利用量子-经典动力学模拟方法,考察了I2分子受限于两个不同尺寸的反胶团水池中振动频率的诱导位移及谱分布.结果表明,相比于体相水,受限于反胶团水池中I2分子的诱导位移表现为蓝移,且蓝移大小随水池尺寸变化不大.通过对I2分子与周围环境相互作用的分解分析,得到了水池水、表面活性剂以及有机溶剂分子对I2分子振动频率诱导位移的瞬态贡献,揭示了I2分子振动弛豫的微观作用机制.此外,对于受限水池中水分子的诱导贡献及空间分布的研究表明,I2分子振动频率位移的诱导贡献主要来自于第一溶剂层,它是由4个水分子蓝移贡献和2个水分子红移贡献组成.
- 周爱松周立川李慎敏
- 关键词：反胶团谱分布
