广东省教育部产学研结合项目(2009B090300281)
- 作品数:4 被引量:9H指数:2
- 相关作者:郑磊王前曾方银龙燕曹楠楠更多>>
- 相关机构:南方医科大学南方医院广州市妇女儿童医疗中心更多>>
- 发文基金:广东省教育部产学研结合项目南方医科大学南方医院院长基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 光滑假丝酵母菌感染实时荧光定量PCR检测方法的建立被引量:1
- 2012年
- 目的:建立、优化快速检测临床标本中光滑假丝酵母菌的实时荧光定量PCR方法,并评价其临床应用价值。方法:以光滑假丝酵母菌ITSⅡ基因的一段高度保守序列为扩增靶序列,合成引物和探针,并与pMD19-T构建重组质粒作为标准品,建立检测光滑假丝酵母菌的实时定量荧光PCR方法。从线性范围、重复性、敏感性、特异性等4个方面对反应体系进行方法学评价。用建立的实时荧光定量PCR方法对1 042例临床标本(包括血液、尿液、痰液、胸水、支气管肺泡灌洗液)进行检测,并与真菌培养法进行比较。结果:建立的光滑假丝酵母菌实时荧光定量PCR方法的灵敏度可达10 CFU/ml;与人类基因组、细菌及其他真菌无交叉阳性反应。重复检测样本,其循环阈值的试验内及试验间变异系数均小于10%。用于临床标本检测时共检出96份阳性标本,与真菌培养法(检出93份阳性标本)的一致性好(Kappa值为0.925)。结论:实时荧光定量PCR方法检测光滑假丝酵母菌灵敏度高、特异性及重复性好;可直接用于各种临床标本中光滑假丝酵母菌的检测,能大大缩短报告时间,为临床诊断提供可靠依据。
- 龙燕郑磊曾方银王前
- 关键词:真菌光滑假丝酵母菌实时荧光定量PCR
- 热带假丝酵母菌实时荧光定量PCR检测方法的建立及临床应用初步评价被引量:2
- 2012年
- 目的建立、优化快速检测临床标本中热带假丝酵母菌的实时荧光定量PCR方法 ,并对其临床应用进行初步评价。方法用自行设计的高效引物、探针检测5种临床标本中的热带假丝酵母菌,对该方法的敏感性、特异性进行评价,并与真菌培养法进行比较。结果检测临床标本中热带假丝酵母菌的灵敏度可达10 copies/ml,与人类基因组、细菌及其他真菌无交叉阳性反应。与真菌培养法的检测一致性好(Kappa值为0.916,P<0.01)。结论实时荧光定量PCR检测热带假丝酵母菌灵敏度高、特异性强,可直接用于各种临床标本中热带假丝酵母菌的检测,而且可大大缩短报告时间,为临床诊断提供可靠依据。
- 龙燕郑磊曾方银杨红玲王前
- 关键词:热带假丝酵母菌实时荧光定量PCR
- 结核分枝杆菌喹诺酮类耐药基因研究进展被引量:3
- 2012年
- 日益增多的耐喹诺酮类结核分枝杆菌给结核病疫情的控制带来了巨大挑战,深入研究结核分枝杆菌喹诺酮类耐受机制便成为应对挑战的关键。药物靶基因突变是导致结核分枝杆菌喹诺酮类耐受的主要因素,近年来该方面的研究逐步受到重视并取得了一些进展,本文特对此进行述评。
- 王前郑磊
- 关键词:结核分枝杆菌
- 真菌通用引物结合高分辨熔解曲线分析检测鉴定常见曲霉菌被引量:4
- 2012年
- 目的探索一种能够快速检测鉴定临床常见侵袭性曲霉菌病原的新型分子生物学方法。方法以真菌核糖体RNA基因的内转录间隔区2为靶基因,在5.8S、28S rRNA基因上设计泛真菌通用引物,扩增临床常见曲霉菌。同时用新生隐球菌基因组DNA、人基因组DNA及临床常见细菌基因组DNA进行引物特异性检测。将通用真菌引物扩增产物进行高分辨熔解曲线分析。以新鲜提取的烟曲霉基因组DNA为模板按照1∶10的比例梯度稀释,进行敏感性检测。检测7个浓度梯度的烟曲霉基因组DNA。结果设计的真菌通用引物可以扩增临床常见的4种曲霉菌及新生隐球菌,但与人基因组DNA和临床常见细菌基因组DNA无扩增反应,检测限可低至1.5 pg/μl,且4种曲霉菌及新生隐球菌扩增产物的熔解曲线不同。该方法敏感性和特异性均较好。结论利用真菌通用引物的扩增产物结合高分辨熔解曲线分析可以达到检测鉴定临床常见4种曲霉菌的目的,此方法对侵袭性曲霉菌的快速检测鉴定具有重要意义。
- 曹楠楠平宝红司徒博郑磊曾方银孙德华王前
- 关键词:曲霉菌