广州市科技计划项目(12C14071654)
- 作品数：2 被引量：10H指数：2
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- 相关机构：广东省农业科学院更多>>
- 发文基金：广东省农科院院长基金广州市科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 兜兰查尔酮合成酶基因的克隆与表达分析被引量：8
- 2012年
- 以同色兜兰为试材,采用RT-PCR和RACE方法从花中获得一个兜兰查尔酮合酶基因(chalconesynthase,CHS)的cDNA全长,命名为PcCHS,GenBank登录号JQ030889。序列分析表明,PcCHS全长1 424 bp,包含106 bp的5′非编码区、133 bp的3′非编码区和一个长度为1 185 bp编码394个氨基酸的开放阅读框。氨基酸序列分析显示,PcCHS具有CHS家族保守的功能活性位点和特征多肽序列。序列比对表明,PcCHS与兰科植物的蝴蝶兰、文心兰和石斛兰等的CHS蛋白有很高的同源性。系统进化分析显示,PcCHS与兰科植物的CHS分支2的蛋白亲缘关系比较近。表达分析表明,PcCHS在花芽发育过程中均有表达,在花中的表达量最高,其次是蕊柱,再次是苞叶、子房、花瓣和萼片,在唇瓣中表达量最低,在根、叶和花茎中几乎检测不到。
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- 关键词：兜兰查尔酮合成酶基因基因克隆基因表达
- 兜兰二氢黄烷酮醇-4-还原酶基因的克隆及其表达特性被引量：3
- 2012年
- 克隆同色兜兰二氢黄烷酮醇-4-还原酶基因DFR,分析其序列特征,了解其在不同组织部位的表达情况。采用RT-PCR和RACE技术从花中克隆DFR的全长cDNA,用生物信息学方法分析序列特征,并用半定量RT-PCR研究其在不同组织的表达。分离到DFR,该cDNA全长1267bp,具有1个1074bp的完整开放阅读框,编码357个氨基酸。序列分析表明,该DFR蛋白含有1个NADB_Rossmann superfamily保守结构域,1个NADP(H)结合域和1个底物特异性结合域,其与文心兰、石斛兰和大花蕙兰等的DFR同源性在75%～80%。系统进化树显示,该DFR蛋白与兰科植物的DFR蛋白亲缘关系比较近。半定量RT-PCR表明,该DFR在成熟花和营养叶中的表达量最高,在子房、苞叶、萼片和花瓣中的表达量相当,在唇瓣中的表达量次之,在蕊柱中的表达量较唇瓣中的低,在花茎中的表达量最低,在根中几乎检测不到。原核表达结果表明,该DFR在大肠杆菌中获得表达。从兜兰中克隆到花色代谢途径中的关键酶基因DFR,该基因可能参与调控花色素的合成。
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- 关键词：兜兰RT-PCR
