国家高技术研究发展计划(2007AA09Z415)
- 作品数:8 被引量:38H指数:3
- 相关作者:洪葵庄令阮继生徐小雄林海鹏更多>>
- 相关机构:中国热带农业科学院海南大学中国科学院更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- CTAB法提取野野村菌基因组DNA被引量:13
- 2010年
- 针对用常规方法难以提取野野村菌基因组DNA的问题,通过选用添加甘氨酸的不同培养基和不同培养时间获得的菌丝体,采用液氮研磨结合CTAB法提取野野村菌DNA,电泳检测及计算OD260/OD280值。结果表明,在添加0.3%甘氨酸的麦芽汁-酵母膏(YE)培养基中振荡培养培养3d的菌丝体适合于DNA提取,用CTAB法获得的基因组DNA,长度约为20kb,且OD260/OD280在1.8左右,达到基因组DNA-DNA杂交的要求。
- 王凡洪葵
- 关键词:DNA提取CTAB法
- 耐热小双孢菌212030的初步鉴定及抗菌活性评价被引量:2
- 2009年
- 采用腐殖酸培养基,从海南文昌红树林中海芒果的根际土壤分离得到一株小双孢菌212030。该菌株在45℃下的生长速度比在28℃的生长速度要快,属兼性嗜热菌。菌株212030的耐盐度为0~5%,不添加NaCl的时候生长最佳。通过16S rDNA基因序列分析,菌株212030与Microbispora amethystogene JCM 3021T的相似率最高,为98.9%。菌株212030发酵液对聚团肠杆菌、金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌均有抑制作用。
- 徐小雄林海鹏庄令洪葵
- 关键词:抗菌活性
- 高效液相色谱法测定红树林放线菌DNA的(G+C)mol%含量被引量:1
- 2009年
- 应用高效液相色谱法测定了放线菌的(G+C)mol%,并就有关分析条件和DNA水解条件进行了优化选择。以Escherichia.coli DH5α作为标准菌株,实验室分离鉴定的8株红树林放线菌作为待测菌株,采用流动相为20mmol/LKH_2PO_4缓冲液(pH 5.6):甲醇(体积比90:10),检测波长为260 nm,流速为1 ml/min,柱温为35℃,分析时间15 min对4种碱基进行分离。结果表明:标准碱基溶液的pH值、流动相的组成和pH值是影响各碱基色谱峰分离和峰形的主要因素。在优化选择的条件下测定,DNA碱基分离效果好,无杂峰干扰,以峰面积计算得到标准菌株Escherichia coli DH5α的(G+C)mol%为54.9694%与已经报道的差异不显著;待测菌株的(G+C)mol%均在菌株所在科或属下的(G+C)mol%范围内;采用酸水解放线菌的DNA可缩短鉴定时间,步骤简明。实验结果充分显示高效液相色谱法测定放线菌(G+C)mol%快速、准确、结果稳定,是放线菌分类鉴定的一种可靠方法。
- 曲直洪葵
- 关键词:高效液相色谱
- 深海链霉菌选择性分离及活性菌株16S rRNA聚类分析被引量:3
- 2009年
- 选择性分离深海链霉菌,检测其抗肿瘤细胞,抗金黄色葡萄球(Staphylococcus aureus ATCC 51650),抗PTP1B和抗caspase-3活性,对活性菌株做165 rRNA聚类分析。用8种选择性培养基分离培养,检测活性和构建活性菌株16S rRNA聚类分析图。共分离到90株链霉菌,其中在RH培养基上分离到的菌株数量和类群最多,占38.9%,次之为GS1和OA培养基,而M5培养基未分离到菌株;共筛选到活性菌株44株,有抗肿瘤活性14株,抗金黄色葡萄球菌22株,抗PTP1B活性19株和抗caspase-3活性2株,其中16株至少有两种活性;16S rRNA聚类分析结果表明44株活性菌株分布在4个clade,分别是S.coelicolor,S.pactum,S.stramineus和S.restomycificus clade,以S.coelicolor和S.restomycificus clade为主,分别占66.0%和11.1%。在常温,常压下可分离培养到大量高活性和活性多相样性的深海键霉菌,RH培养基最适用于分离深海链霉菌。
- 庄令庄令谢睛宜林海鹏洪葵
- 关键词:活性筛选RRNA
- 24株深海链霉菌耐(嗜)盐性及抗MRSA活性的初步研究被引量:1
- 2009年
- 对24深海链霉菌的耐(嗜)盐性及抗MRSA活性筛选,结果显示,耐NaCl盐浓度在10%以上的有23株,中等嗜盐菌2株,16株具有抗MRSA活性,占66.7%。表明深海链霉普遍能耐受10%以上的NaCl浓度,而且大多在高盐浓度下代谢抗MRSA活性物质。
- 庄令庄令洪葵
- 关键词:抗MRSA
- 微生物资源的生物勘探被引量:3
- 2010年
- 从传统资源研究方法和"meta-技术"两方面阐述了微生物勘探的必要性,介绍微生物勘探的主要内容与研究方法,讨论微生物勘探对微生物资源研究的意义与价值及其发展趋势。
- 谢晴宜洪葵
- 关键词:未培养微生物微生物资源
- 从红树植物根际土壤选择性分离小双孢菌被引量:11
- 2009年
- 从海南文昌采集23种红树植物的根际土壤,采用GA、HV作为选择性分离培养基,添加复合维生素、放线菌酮、制霉菌素和重铬酸钾,结合适当的预处理:干热120°C60min或干热100°C60min及1%氯胺-T处理30min,平板稀释涂布法(10-1、10-2、10-3)分离其中的小双孢菌。共分离得到199株放线菌,通过培养特征及显微形态观察,发现其中有链霉菌147株、非链霉菌52株。选择7株链霉菌和28株非链霉菌进行了16SrRNA基因序列分析,结果显示19株菌属于小双孢菌属,7株属于链霉菌属,4株属于野野村菌属,2株属于小单孢菌属,1株属于链孢囊菌属,1株属于阿萨诺氏菌属,1株属于小单孢菌科。结果表明红树林根际土壤中蕴含着丰富的小双孢菌资源。
- 徐小雄林海鹏阮继生洪葵
- 关键词:红树植物根际土壤
- 高效液相色谱和气相色谱在放线菌分类鉴定中的应用被引量:4
- 2009年
- 随着新菌株不断被分离及已有的大量菌株,快速、准确的分类鉴定及高效排重对微生物资源开发日益重要,而快速发展的色谱技术使之逐渐成为可能。以标准菌株和标准品优化了色谱技术中的高效液相色谱(HPLC)和气相色谱(GC)在放线菌的DNA(G+C)mol%、甲基萘醌和脂肪酸中的鉴定方法及测定参数。优化的色谱鉴定方法不但有利于各个指征的分析更快,更精确,也有利于高效排重,甚至也可检验已有的分类鉴定是否正确而纠正错误属、种的划分。
- 曲直阮继生洪葵
- 关键词:化学分类高效液相色谱甲基萘醌