广西壮族自治区自然科学基金(2013GXNSFBA019122)
- 作品数：3 被引量：21H指数：2
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- 相关机构：上海海洋大学学研究院更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金公益性行业(农业)科研专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目更多>>
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- 白斑综合征病毒广西株缺失区基因的比较分析被引量：8
- 2014年
- 为了解广西养殖凡纳滨对虾中白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的感染流行情况,并探讨WSSV广西株缺失区ORF23/24基因的遗传进化差异及其与各地WSSV毒株间的遗传进化关系,2010年5月至2013年9月在广西凡纳滨对虾主产区北海、钦州和防城港共采集306份患病虾样品,应用世界动物卫生组织(OIE)推荐的套式聚合酶链式反应(nested-PCR)方法进行WSSV检测;选取第一轮PCR为阳性的53份样品进行缺失区ORF23/24基因的PCR扩增,并将12份阳性PCR产物进行克隆、序列测定与比较分析。结果显示:306份患病虾样品中有82份为WSSV感染阳性,阳性率为26.8%;12株WSSV广西株缺失区ORF23/24基因大小均为2 096 bp,相对于此区域最为完整的WSSV-TW株,广西株均在中间缺失了10 970 bp;12株WSSV广西株的缺失区ORF23/24基因差异小,核苷酸同源性均在99.6%以上,仅存在少数碱基的替换,没有缺失和插入,其中BH-3、QZ-1、FCG-1和FCG-2的核苷酸序列完全一致;基于缺失区构建的系统发育进化树显示,WSSV广西地方株在遗传上相距较近,全部与印度株IN-05-Ⅰ聚在一个大的分支,而与台湾株、中国株及韩国株在遗传上相距较远。研究表明,WSSV感染在广西凡纳滨对虾主要养殖地区存在一定程度的流行;广西WSSV毒株缺失区ORF23/24基因的变异类型为中间大片段缺失,各毒株间无明显的地域和时间差异;WSSV广西株与印度株IN-05-Ⅰ的遗传进化关系最近。
- 童桂香黎小正韦信贤杨先乐张益峰吴祥庆叶欣宇黄国秋
- 关键词：凡纳滨对虾白斑综合征病毒
- 凡纳滨对虾白斑综合征病毒广西株变异区基因的比较分析被引量：2
- 2014年
- 对凡纳滨对虾白斑综合征病毒(White spot syndrome virus,WSSV)广西株变异区ORF14/15基因序列进行比较分析,了解WSSV广西株遗传进化差异及其与各地WSSV毒株间的遗传进化关系。考虑地理和时间因素选取2010年5月至2013年7月采自广西凡纳滨对虾主要养殖地区北海、钦州和防城港的40份WSSV阳性的凡纳滨对虾样品,PCR扩增、克隆样品中WSSV的ORF14/15基因并对其进行序列测定与比较分析。40份样品中有25份的ORF14/15基因被成功克隆和测序,其中22株为619bp,3株为620bp;相对于此区域最为完整的TH-96-Ⅱ株,25株WSSV广西株的ORF14/15基因均在中间缺失了5 949bp,仅剩5′端的190bp和3′端的429bp(430bp),与印度株IN-05-Ⅰ缺失大小和位置相同;在变异区25株WSSV广西株中有16株核苷酸序列同源性为100%,其余毒株间的同源性也在97.9%以上,仅存在单个碱基的变异;基于变异区构建的系统进化树显示,WSSV广西地方株在遗传上相距较近,全部与印度株IN-05-Ⅰ聚在一个大的分支,而与目前发表的其他毒株均相距较远。广西养殖凡纳滨对虾中流行的WSSV毒株变异区ORF14/15基因的变异类型为中间大片段缺失,广西各地流行的WSSV毒株间无明显的地域和时间差异;WSSV广西株与印度株IN-05-Ⅰ的遗传进化关系最近。
- 童桂香黎小正韦信贤叶欣宇吴明媛秦振发兰柳春周靓婧
- 关键词：凡纳滨对虾白斑综合征病毒
- 广西凡纳滨对虾IHHNV感染情况的调查与分析被引量：13
- 2013年
- 【目的】了解凡纳滨对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒（IHHNV）在广西的分布、流行特点及趋势，为研究制定广西对虾IHHN的综合防控措施提供参考。【方法】根据广西凡纳滨对虾养殖情况，分别在北海市、钦州市、防城港市设立监测区，每个监测区设3-5个监测点，2010-2012年每年5月和9月进行两次采样，应用PCR对采集样品进行IHHNV检测，阳性产物送至宝生物工程（大连）有限公司测序，并与NCBI数据库中的IHHNV序列进行比对。【结果】2010年共检测凡纳滨对虾298份，IHHNV阳性率62.1%；2011年共检测凡纳滨对虾300份，IHHNV阳性率44.3%；2012年共检测凡纳滨对虾299份，IHHNV阳性率32.1%；3年的检测结果均以北海市的IHHNV感染率最高。2010、2011和2012年虾苗和中成虾的IHHNV阳性率分别为49.6%和72.1%、35.5%和49.2%、27.3%和36.9%。2010、2011和2012年5月和9月的IHHNV阳性率分别为53.2%和71.8%、35.2%和50.6%、21.6%和37.0 %。【结论】2010-2012年IHHNV在广西凡纳滨对虾主要养殖地区均有不同程度的流行，且中成虾IHHNV阳性率高于虾苗，每年9月的IHHNV阳性率高于5月，但广西近年通过严格控制亲虾品质及引进无病毒感染种苗，凡纳滨对虾品质已得到提升，IHHNV感染呈逐年下降的趋势。
- 童桂香韦信贤吴伟军吴祥庆黄国秋黄玉柳叶欣宇黎小正
- 关键词：凡纳滨对虾IHHNV阳性率
