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国家自然科学基金(30671361)

作品数：11 被引量：25H指数：4
相关作者：陈集双吴鹏杜志游廖乾生朱丽萍更多>>
相关机构：浙江理工大学浙江大学湖南农业大学更多>>
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相关领域：农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 10篇期刊文章
  • 3篇会议论文

领域

  • 9篇农业科学
  • 4篇生物学

主题

  • 8篇花叶
  • 8篇花叶病
  • 8篇花叶病毒
  • 8篇黄瓜
  • 8篇黄瓜花叶病
  • 8篇黄瓜花叶病毒
  • 5篇侵染
  • 5篇DSRNA
  • 3篇克隆
  • 3篇分离物
  • 2篇侵染性
  • 2篇侵染性克隆
  • 2篇全序列
  • 2篇全序列分析
  • 2篇株系
  • 2篇基因
  • 2篇RNA3
  • 2篇CP
  • 2篇RDRP
  • 1篇蛋白

机构

  • 13篇浙江理工大学
  • 2篇浙江大学
  • 1篇湖南农业大学
  • 1篇仲恺农业技术...

作者

  • 13篇陈集双
  • 4篇吴鹏
  • 4篇廖乾生
  • 3篇曾蓉
  • 3篇杜志游
  • 3篇朱丽萍
  • 2篇李力强
  • 2篇张华荣
  • 2篇刘伟侠
  • 1篇刘歆
  • 1篇陈斐斐
  • 1篇乔爱民
  • 1篇李露露
  • 1篇谢礼
  • 1篇严师节
  • 1篇陈亮
  • 1篇郎秋蕾
  • 1篇陈燕飞
  • 1篇张建光
  • 1篇陈绍宁

传媒

  • 3篇科技通报
  • 2篇生物化学与生...
  • 2篇辽宁师范大学...
  • 2篇园艺学报
  • 2篇中国植物病理...
  • 1篇中国农业科学

年份

  • 1篇2011
  • 2篇2009
  • 4篇2008
  • 6篇2007
共 11 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
黄瓜花叶病毒CB7株系引起心叶烟坏死反应与RNA2相关被引量：4
2007年
采用RT-PCR获得黄瓜花叶病毒CMV-CB7株系全长基因组cDNA,经克隆测序发现该CMV的RNA1、2和3分别为3356nt、3045nt和2218nt(序列登录号为:EF216866、DQ785470和EF216867).CMV-CB7基因组cDNA克隆体外转录RNA接种心叶烟引起坏死症状,而CMV-Fny则产生典型花叶.由CMV-CB7和CMV-Fny基因组RNA相互交换而构建6个假重组型病毒(C1C2F3、C1F2C3、F1C2C3、F1F2C3、F1C2F3和C1F2C3)活性分析表明:CMV-CB7基因组RNA2决定其在寄主上的症状反应.嵌合型RNA2(RNA2F5C3和RNA2C3F5)的寄主侵染活性测定表明:2b基因或RNA23′端非编码序列决定CMV-CB7在心叶烟坏死症状.RNA印迹分析结果显示:CMV-CB7和CMV-FnyF5C3引起寄主坏死与基因组RNA积累没有直接关系.
廖乾生杜志游张华荣朱丽萍吴鹏陈集双
关键词：黄瓜花叶病毒坏死RNA2
侵染白菜的黄瓜花叶病毒分离物基因组的全序列分析被引量：5
2008年
对浙江省杭州地区白菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis var.commuis Tsenet Lee.)上获得的CMV分离物(CMV-CTL)进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示:CMV-CTL的RNA1(Gen-Bank序列号:EF213023)全长为3357个核苷酸(nt),编码993个氨基酸(aa)的1a蛋白;RNA2(Gen-Bank序列号:EF213024)全长为3047nt,编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:EF213025)全长为2217nt,编码278aa的MP蛋白和218aa的CP蛋白。序列相似性分析表明,CMV-CTL与CMV亚组B中株系IA相似性最高,RNA1、RNA2和RNA3与该株系的相似性分别为91·3%、91·3%和93·6%。CP基因和RNA3的5′NTR核酸序列系统发生树分析表明,CMV-CTL与中国大多数CMV分离物一样,属于CMV亚组IB。
曾蓉陈燕飞严师节黎定军陈集双
关键词：黄瓜花叶病毒白菜基因组序列
萝卜中一种新dsRNA的全长cDNA克隆及序列分析
2008年
从‘一点红’萝卜（Raphanus sativus-root‘Yidianhong’）叶片中提取dsRNA，应用SPAT方法对各dsRNA条带进行cDNA克隆并测序，除获得先前报道的5条序列（RasR1～RasR5）以外，还得到一条新的全长序列，将其定名为RasR6（EU285027）。序列分析结果表明：RasR6全长为1778bp，其正义链编码1个由502个氨基酸组成、分子量约为55．1kD的蛋白质。该序列与前人报道的双分病毒科5个病毒序列具有相似性，且它们均编码双分病毒科病毒的外壳蛋白（eapsidprotein，CP）。核苷酸序列比对结果显示：RasR6与同时来源于萝b的RasR1和RasR2的5′UTR序列高度同源，且其3′末端具有polyA结构，而与RasR3、RasR4和RasR5的UTR则没有明显的相似性。因此，推测RasR6与RasR1、RasR2同属于双分病毒RasV1（Raphanus sativus virus 1），可能与RasR2共同编码该病毒的CP或作为RasV1的卫星RNA存在。
李露露李力强乔爱民陈亮陈集双
关键词：萝卜双链RNARAPHANUSSATIVUS
侵染蚕豆的双链RNA病毒的克隆及其功能分析
2009年
在自然感病的蚕豆中检测到2条主要dsRNA条带(dsRNA1和dsRNA2),采用改进的单引物扩增法(modified single primer amplification technique,M-SPAT)获得其全长cDNA,克隆测序后,与GenBank中的已知序列进行分析比对,结果显示:它们编码的蛋白分别与已经报道的野豌豆潜隐病毒(Vicia crypticvirus,VCV)的复制酶(RNA-dependent RNAploymerase,RdRp)和外壳蛋白(capsid protein,CP)的相似度分别为99%和100%。序列进化树分析进一步表明:dsRNA1与dsRNA2组成野豌豆潜隐病毒中国分离物的基因组。
刘伟侠陈集双
关键词：蚕豆DSRNA基因克隆
黄瓜花叶病毒辣椒分离物侵染性克隆构建被引量：4
2008年
【目的】鉴定引起辣椒产生褪绿黄化症状的病原物,构建侵染性克隆。【方法】大田辣椒样品通过ELISA检测,结合病毒外壳蛋白SDS-PAGE及病毒RNA分析,初步确定辣椒中病原物为黄瓜花叶病毒(CMV)Phy株系。以辣椒病毒粒子RNA为模板,采用含T7启动子的不同正向引物通过RT-PCR扩增CMV-Phy全长基因组RNA1、RNA2和RNA3。PCR产物经过双酶切后连接到pUC118载体,并分别比较5种(DH5α、HB101、JM109、LE392和NM522)感受态细胞的转化效率。体外转录CMV-Phy的基因组cDNA克隆(pUC-P1、pUC-P2和pUC-P3)成RNA分子(P1P2P3),分析其转录效率和侵染活性。P1P2P3与CMV的卫星RNA进行假重组,进一步确定CMV-Phy侵染性克隆的成功构建。【结果】引起辣椒产生褪绿黄化症状病原物为CMV,携带卫星RNA;心叶烟接种辣椒病毒粒子后同样产生褪绿黄化症状。HB101感受态细胞最适合CMV-Phy基因组转化。CMV-Phy基因组及其卫星RNA的大小如下:RNA1为3356nt、RNA2为3048nt和RNA3为2220nt,卫星RNAPz-satRNA为384nt(序列登陆号分别为:DQ402477,DQ412731,DQ412732EF363688)。CMV-Phy的cDNA克隆体外转录在5′端添加G有利于提高转录效率,但影响其侵染活性;P1P2P3在苋色藜和心叶烟产生的症状与其病毒粒子产生的症状相一致。除了Pz-satRNA,P1P2P3还能作为T1-satRNA、Rs-satRNA和Tsh-satRNA辅助病毒;T1-satRNA可加重CMV-Phy在心叶烟症状反应,而其它3个卫星RNA则对此起减弱作用。【结论】以病毒粒子RNA为模板,采用touch-upPCR扩增参数在1个反应管中同时获得CMV-Phy基因组RNA1、RNA2和RNA3;CMV-PhyRNA1、RNA2和RNA3的5′端添加1个G最有利于侵染性克隆构建。
廖乾生杜志游张华荣吴鹏朱丽萍陈集双
关键词：黄瓜花叶病毒侵染性克隆
黄瓜花叶病毒2b蛋白对寄主光合速率和叶绿体结构的影响被引量：8
2007年
黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)2b蛋白作为重要致病因子的角色在茄科模式植物上已为广泛描述,但其致病机理尚未廓清.从寄主叶绿体结构和光合特征的角度探索了病毒侵染过程中2b蛋白对心叶烟(Nicotiana glutinosa)的影响.首先利用PCR方法导入突变位点,构建了2b蛋白不表达的人工突变体Fny-CMV!2bpro,然后通过平行接种野生型Fny-CMV和Fny-CMV"2bpro,分析二者侵染后心叶烟的症状表现、叶绿素含量、光合速率以及叶绿体超微结构变化.结果显示:接种30天,Fny-CMV侵染的心叶烟表现重花叶、畸形和矮化症状,植株的光合速率和叶绿素含量显著降低,叶绿体形态和结构发生明显病变.但是,Fny-CMV#2bpro侵染的心叶烟植株仅表现轻微花叶或不表现明显症状,与健康对照相比,其光合速率和叶绿素含量没有显著差异,叶绿体形态和结构亦未出现明显病变.由此可见,野生型病毒侵染导致的相对低的光合速率和叶绿素含量,与2b蛋白引起的叶绿体形态和结构的破坏有一定的相关性.RNA杂交分析结果显示:2b蛋白的致病性与CMV子代RNA在寄主体内的积累量有关,不表达2b蛋白使得CMV基因组RNA1和RNA2含量显著下降,其亚基因组RNA4(编码CP蛋白)含量降低尤为显著.
陈斐斐杜志游刘歆谢礼陈集双
关键词：黄瓜花叶病毒光合速率叶绿体结构
侵染半夏的黄瓜花叶病毒RNA3全序列分析及侵染性克隆构建
2008年
对从我国甘肃省天南星科植物半夏上获得的黄瓜花叶病毒分离物(CMV-PGs)的RNA3进行全长克隆和序列分析及侵染性克隆构建.结果表明:CMV-PGsRNA3序列全长2179nt,与CMV-Fny株系RNA3的同源性为83.1%.选取已报道CMV株系的38个RNA3全长序列,根据CP核苷酸序列进行同源性比较,系统进化树分析表明:CMV-PGs属于亚组ⅠB,但是相对独立.进一步构建CMV-PGsRNA3的侵染性克隆,通过体外转录获得具有侵染活性的RNA转录本,将CMV-PGsRNA3的侵染性转录本与CMV-FnyRNA1和RNA2的侵染性转录本混合接种烟草,成功获得假重组体F1F2P3.
陈集双尹雪鸿
关键词：半夏黄瓜花叶病毒全序列分析侵染性克隆
黄瓜花叶病毒小青菜分离物RNA3全长序列分析被引量：2
2007年
对侵染十字花科小青菜的黄瓜花叶病毒YN分离物(CMV-YN)RNA3进行全长克隆和序列分析.CMV-YNRNA3全长2 220 nt,分别编码279个氨基酸的3a蛋白和218个氨基酸的CP.序列同源性比较结果如下:CMV-YNRNA3核苷酸及其编码蛋白的氨基酸序列与亚组IA株系CMV-Fny、亚组IB株系CMV-Nt9、亚组II株系CMV-Q的同源性,RNA3序列分别为92.7%、96.7%、74.2%,3a蛋白氨基酸序列分别为96.4%、98.6%、83.2%,CP氨基酸序列分别为97.7%、98.2%、83.1%.该结果表明CMV-YN与亚组IB株系CMV-Nt9的同源关系更密切.对CP核苷酸序列的系统进化树分析表明:CMV-YN归属于亚组IB.本研究为首次报道侵染我国十字花科植物的CMV基因组序列.
陈集双吴鹏
关键词：十字花科黄瓜花叶病毒全长克隆
番茄保守性microRNA及其对病毒侵染的反应
microRNA（miRNA）是一类在真核生物中广泛存在、对基因表达具有调控作用的内源性的一类小分子 RNA。Sanger miRbase 9．0数据库收录了从拟南芥（Arabidopsis thaliana）、大豆 （...
陈集双张建光郎秋蕾廖乾生曾蓉陈绍宁
关键词：番茄黄瓜花叶病毒MIRNA
文献传递
杭州地区玉米病毒病dsRNA序列分析被引量：1
2011年
从杭州地区采集花叶症状的玉米,抽提双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA),用单引物扩增方法(Single primer amplification technique,SPAT)对dsRNA进行RT-PCR扩增,获得了三条dsRNA片段的cDNA克隆并测定全序列。核苷酸水平上,三条片段(长度分别为1801bp、2193bp和3164bp)分别与水稻黑条矮缩病毒(Rice black-streaked dwarf virus,RBSDV)的第十(AF227205)、第七(AJ297428)和第五(AJ409147)号片段序列存在高达98%的同源性,与玉米粗缩病毒(Maize rough dwarffijivirus,MRDV)相应片段序列同源性最高为88%。在氨基酸水平上,推测的氨基酸序列也与RBSDV相似性较高,而与MRDV的相似性较低。序列同源性分析结果表明:三条片段来源于RBSDV。因此,该地区发生的玉米病毒病病原是水稻黑条矮缩病毒而不是玉米粗缩病毒。
赵洪斌唐香山陈集双
关键词：DSRNA克隆水稻黑条矮缩病毒
全选 清除 导出
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