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国家自然科学基金(31072023)

作品数:9 被引量:13H指数:2
相关作者:康相涛孙桂荣李国喜韩瑞丽王乐乐更多>>
相关机构:河南农业大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目国家农业科技成果转化资金项目更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 9篇农业科学
  • 4篇生物学

主题

  • 4篇基因
  • 2篇通路
  • 2篇通路分析
  • 2篇下丘
  • 2篇下丘脑
  • 2篇丰度
  • 2篇靶基因
  • 2篇MIRNA
  • 1篇蛋鸡
  • 1篇蛋鸡生产
  • 1篇凋亡
  • 1篇凋亡相关
  • 1篇凋亡相关基因
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇益生素
  • 1篇增殖
  • 1篇肉质
  • 1篇肉质性状
  • 1篇生物信息

机构

  • 8篇河南农业大学

作者

  • 7篇孙桂荣
  • 7篇康相涛
  • 5篇李国喜
  • 4篇王乐乐
  • 4篇韩瑞丽
  • 3篇白义春
  • 2篇田亚东
  • 2篇李红
  • 1篇李明
  • 1篇陈其新
  • 1篇黄艳群
  • 1篇郭军蕊
  • 1篇徐亚铂
  • 1篇贾丽娟
  • 1篇赵强
  • 1篇王圣
  • 1篇张虎
  • 1篇闫峰宾
  • 1篇王乐

传媒

  • 3篇中国生物化学...
  • 2篇中国农业科学
  • 1篇河南农业科学
  • 1篇饲料广角
  • 1篇中国畜牧杂志
  • 1篇Journa...

年份

  • 2篇2013
  • 3篇2012
  • 4篇2011
9 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
鸡miR-181a靶基因的生物信息学分析
2011年
对鸡miR-181a的靶基因进行了预测及相关生物信息学分析,为深入研究miR-181a生物学功能提供理论指导。利用TargetScan 5.1与PicTar 2种计算方法对miR-181a进行靶基因预测,交集的基因集合分别进行GO富集分析和KEGG分析。结果预测到交集靶基因有137个下游靶基因,GO富集分析结果表明,137个靶基因涵盖于生物学过程、细胞组成、分子功能3个分类。KEGG分析结果表明,靶基因富集于神经营养因子信号通路、长时程增强效应通路等与代谢有关的通路。
孙桂荣张虎康相涛陈其新李红王乐
关键词:通路分析生物信息学
鸡miR-181a组织的表达谱及其转录调控区域被引量:2
2012年
【目的】分析鸡miR-181a的转录起始位点,并分析其在1日龄和成年鸡不同组织中的表达谱,以期为研究miR-181a的功能奠定基础。【方法】采用qPCR技术构建miR-181a在1日龄和成年鸡肝脏、脾脏、肺、小肠、大脑、小脑、下丘脑、脑干、胸腺、心脏和肾脏组织中的表达谱。用version(1.83)分析miR-181a的保守性,并采用ENCODE数据库进行miR-181a转录起始位点和启动子区域的分析。【结果】①采用qPCR检测miR-181a在鸡下丘脑中的表达量和高通量测序的结果一致,1日龄下丘脑中的表达量显著低于成年鸡的表达量(P<0.05);②miR-181a在11个组织中均有表达,且在1日龄和成年鸡脾脏、肺、小肠、大脑、小脑、下丘脑、脑干、胸腺、心脏和肾脏组织的表达量差异显著(P<0.05),而在肝脏中表达量的差异不显著(P>0.05);③miR-181a的前体miR-181a-1上游区域有一个启动子区和一个潜在的转录起始位点;④miR-181a-1的转录调控区域内存在的多个转录因子,转录因子主要有NFKB,c-Fos等。【结论】鸡miR-181a的表达有组织和时序差异,其成熟序列在脊椎动物中十分保守,上游有一个转录起始位点及启动子区。
孙桂荣李明康相涛李国喜田亚东韩瑞丽白义春
关键词:转录起始位点
鸡miR-148a的组织表达及其发育调控功能预测分析被引量:2
2013年
为了解鸡miR-148a组织表达谱和潜在发育调控功能,采用茎-环定量RT-PCR检测了固始鸡5个发育阶段、15种组织中miR-148a的表达,利用Pictar和TargetScan算法预测了miR-148a的靶基因,并对预测靶基因分别进行了Gene Ontology分析和通路分析.结果显示,miR-148a的表达具有明显的时序特征,胚胎期各组织中的表达水平明显低于出壳后;miR-148a在出壳后的大脑、小脑、延脑、腺胃、小肠、肝、胰和胸肌等器官组织中的表达水平随着发育进程被显著上调;miR-148a预测靶基因在胚胎器官形态发生、血细胞生成、消化道形态发生、心血管发育、感觉器官发育、肠发育、骨骼系统发育、后脑发育、呼吸系统发育、免疫系统发育、淋巴器官等发育过程显著富集.总之,鸡miR-148a为广泛性表达miRNA,可能参与鸡诸多器官组织发育过程的调控.
李国喜闫峰宾王乐乐贾丽娟孙桂荣康相涛
关键词:功能分析
鸡miR-9不同组织表达差异及其功能预测分析被引量:2
2011年
miRNA在动物生长发育过程中有重要作用.本文采用定制茎环反转录引物,利用实时荧光定量PCR技术构建miR-9在鸡2个阶段11个组织中的表达谱,同时用TargetScan5.1与PicTar两种计算方法对其进行靶基因预测,交集的基因集合分别进行GO(gene ontology)富集分析和生物通路富集分析.结果表明,采用实时定量PCR检测的miR-9在鸡下丘脑中的表达量和高通量测序结果一致;采用实时定量PCR在对不同组织定量结果表明,miR-9在0日龄鸡的肾脏、下丘脑、腿肌和大脑中高丰度表达,在成年鸡表达量较高为大脑、腿肌、心脏、小脑和下丘脑.在同一组织的0日龄和成年鸡中表达呈现时序性,除肝脏的表达量差异不显著,其他10个组织miR-9表达量差异显著(P<0.05).预测到交集靶基因有160个.涉及到多个KEGG通路和GO富集中.GO分类结果显示,这些基因分布于63个群中,其中基因超过45个基因群集有26个群,与代谢有关的群有11个.其它与发育、调控等过程有关.在KEGG通路分析中,显著的通路有细胞骨架调控、细胞增殖和分化有关的通路(P<0.01)等5个通路.表明miR-9基因的表达有组织和时序特异性,靶基因参与细胞代谢、生长发育和调控.这些结果为进一步验证miR-9基因在在脑中调控生长发育过程中的作用奠定了基础.
孙桂荣李国喜康相涛田亚东白义春韩瑞丽黄艳群
关键词:MIR-9通路分析
Effect of Beak Trimming Stress on the Apoptosis and Its Related Protein Expression of Chicken Spleen
2012年
Beak trimming was a part of routine husbandry for poultry industry,which was the most efficient and economic way to reduce the incidence of cannibalism.However,the controversy about young chicken trimming still exits and it was drawing more concern recently along with the popular of animal behavior and welfare theory.To evaluate the influence of beak trimming on young chicken spleen development and find the key regulators of the spleen development,in this study,the electron microscope technique,flow cytometry and immunohistochemical techniques were used to investigate the effects of beak trimming stress on the spleen development.The result of electronic microscope showed that significant stress response could be found in chicken spleen cells after beak trimming.Cell volume became larger,chromatin of cell nuclear agglutinated conglobation,cytoplasm formed more vacuole,and mitochondria emerged vacuolization phenomenon in splenic lymphocyte after beak trimming.From the flow cytometry,the lymphocyte of spleen in the control group and experimental group were mainly in G1 phase,and the remaining small amount was in S and M phases.Of interest,the number of the lymphocyte which are in G1 phase within immune organ in the experimental group were more than that in the control group,but the number of cells in S and M phases were less than that in the control group.And beak trimming decreased the lymphocytes proliferation index of spleen.Inmmuohistochemical result showed that the beak trimming stress did not affect the expression sites of two apoptosis-related genes,Bcl-2 and Bax,in the spleen.But the expression level of Bcl-2 decreased while Bax increased in chicken immune organs after beak trimming.Furthermore,the beak trimming increased spleen cell apoptosis with a time-dependant style.Our findings may make a contribution to the active precaution of stress response.
SUN Gui-rongLI YanKANG Xiang-taoTIAN Ya-dongZHANG HuLI Kui
关键词:细胞凋亡相关基因脾淋巴细胞增殖
鸡下丘脑高丰度miR-101的组织表达谱与功能预测分析
2013年
【目的】全面了解鸡下丘脑高丰度miR-101的组织表达情况和潜在生物学功能,为揭示下丘脑调控鸡机体能量平衡的分子机制奠定基础。【方法】采用茎-环定量RT-PCR方法检测miR-101在固始鸡4个发育阶段、13种组织中的表达,利用Pictar算法预测miR-101的靶基因并对预测靶基因分别进行Gene Ontology分析、通路分析和分层富集。【结果】miR-101的表达具有明显的时序特征和组织特异性,胚胎期各组织中的表达水平明显高于出壳后,脑部各组织中的表达水平明显高于其它被检测的组织,并在14胚龄下丘脑以及17胚龄小肠和腿肌中高丰度富集;miR-101的预测靶基因在生物学调节、代谢过程、发育过程和细胞过程等基本生物学过程中显著富集;针对神经系统发育的生物信息学分析显示,miR-101调控功能主要涉及脑发育、神经元分化、神经发生调节、神经胶质细胞分化和星形胶质细胞分化等生物学过程。【结论】miR-101为脑部组织高丰度表达miRNA,在脑发育相关的许多生物学过程中可能发挥重要的调节作用。
李国喜王乐乐孙桂荣康相涛
关键词:组织表达谱靶基因
固始鸡1日龄和36周龄下丘脑高丰度差异性MiRNA的鉴定及功能预测分析被引量:3
2012年
为鉴定鸡下丘脑发育相关特异性表达miRNA,基于固始鸡1日龄和36周龄下丘脑小RNA的Solexa测序数据,共鉴定到266种2个发育阶段共表达的miRNA,其中157种miRNA的表达水平被显著下调,22种被显著上调.聚类分析显示,鸡下丘脑高丰度差异性miRNA主要集中于let-7、mir-181、mir-30、mir-99、mir-1和mir-17等基因家族.另外,预测了10种高丰度差异性miRNA的靶基因,并进行了相应的GO分析和KEGG通路分析.结果显示,预测靶基因在发育过程、代谢过程、细胞过程和生物学过程调节等4个生物学过程以及细胞周期、粘着斑、TGF-beta信号通路和MAPK信号通路等通路中显著富集.研究结果为进一步揭示miRNA调控鸡下丘脑发育的分子机制提供了有益线索.
李国喜孙桂荣王乐乐韩瑞丽康相涛
关键词:固始鸡下丘脑差异表达分析
不同益生素对蛋鸡生产性能的影响被引量:2
2011年
选用36周龄的固始鸡4栋共4000只,以每栋1000只为一组,随机编号后分为对照组和试验组。对照组饲喂基础日粮;试验1组在基础日粮中添加0.05%868益生宝,试验2组在基础日粮中添加0.01%产酶益生素,试验3组添加优菌素1:200饮水。结果表明,与对照组相比,各组产蛋率差异均不显著(P>0.05),但试验1组、2组产蛋率降低较多;试验1、2、3组蛋合格率差异显著(P<0.05);对死淘率影响不显著(P>0.05);蛋壳质量及鸡舍内异味都有所改善。综合可知优菌素在一定程度上可提高鸡群产蛋合格率,降低死淘率,且在一定程度上可改善鸡舍的空气环境及鸡粪的含水量。
李红王乐乐王圣郭军蕊
关键词:益生素蛋鸡
鸡CFL2基因3′UTR多态性与肉质性状的关联分析被引量:3
2011年
以固始鸡×安卡鸡F2代资源群为研究对象,利用PCR-RFLP方法检测鸡CFL2基因3′UTR多态性,并将不同基因型与肉质性状进行相关性分析。结果表明:在鸡CFL2基因3′UTR区预测到5个microRNA靶位点。在CFL2基因3′UTR区发现G577A位点,该位点为KpnⅠ自然酶切位点,表现为GG、AA和GA 3种基因型,基因型频率分别为0.589、0.349和0.061,经χ2适合性检验,该位点在群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态。该突变位点对鸡的腿肌肌纤维密度和肌纤维直径具有显著影响(P<0.05)。结果显示,CFL2基因对鸡的腿肌肌纤维性状有一定影响,同时为该基因的标记辅助育种和进一步研究提供参考。
赵强孙桂荣韩瑞丽白义春徐亚铂康相涛
关键词:肉质性状PCR-RFLP
共1页<1>
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