采用ISSR分子标记技术对华仁杏Armeniaca cathayana D.L.Fu et al.3个杂交组合(A:H1×H2,B:H1×X1,C:H1×X2)的亲本及杂交一代(F1)进行了遗传分析。从100条ISSR引物中筛选出稳定多态的8条引物,共得到52个扩增位点,其中44个具有多态性,多态性位点百分率达84.62%。在华仁杏3对杂交组合中,组合B的F1子代同母本的遗传相似系数平均为0.6601,高于其亲本间的遗传相似系数0.6078,同父本的遗传相似系数平均为0.5882,低于其亲本间的遗传相似系数。组合A和组合C的F1子代同父本、母本之间的遗传相似系数平均值都低于其各自亲本间的遗传相似系数。同时3个杂交组合F1的有效等位基因数、期望杂合度、shannon多样性指数都高于两亲本间的。这表明华仁杏3个杂交组合的F1子代都产生了明显的的遗传变异,遗传多样性水平得到了提高。