中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(SJB1009)
- 作品数：3 被引量：4H指数：1
- 相关作者：商海红巩万奎王少干袁有禄王涛更多>>
- 相关机构：中国农业科学院棉花研究所华中农业大学西南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 三个陆地棉水孔蛋白基因的克隆与表达分析被引量：1
- 2013年
- 从陆地棉SSH-cDNA文库的测序结果中得到一条具有完整ORF的陆地棉水孔蛋白基因序列,将其命名为GhAQP2。以该基因编码的氨基酸序列为探针,在棉花EST数据库经同源搜索得到2个相似性较高的EST,利用RACE技术获得其全长cDNA序列,将其基因命名为GhAQP3和GhAQP4。基因结构分析发现GhAQP2和GhAQP3各有4个外显子,3个内含子;GhAQP4有3个外显子,2个内含子。生物信息分析表明3个基因编码蛋白均含有6个跨膜区,2个NPA结构域,其氨基酸序列具备MIP超家族典型的蛋白保守区序列特征。多序列比对发现3个基因的氨基酸序列与其他物种PIP2类水孔蛋白氨基酸序列具有很高的同源性。qRT-PCR分析表明,GhAQP2在纤维伸长后期优势表达,GhAQP3在下胚轴和子叶中高表达,GhAQP4在纤维伸长前期优势表达,推测3个基因在不同的组织中发挥作用。GhAQP2在20DPA优势表达,为研究该基因在纤维伸长向次生壁加厚期转化过程中的表达调控提供了重要信息。
- 李伟商海红王少干范森淼李俊文刘爱英石玉真龚举武巩万奎王涛白志川袁有禄
- 关键词：棉纤维水孔蛋白基因
- 陆地棉开花后20d纤维抑制性消减文库的构建及分析
- 2012年
- 本研究以高比强度纤维材料0-153和转基因抗虫棉sGK9708为亲本构建的高代重组自交系群体(F6:9)中选育出的高比强度纤维品系(69307)作为材料,利用抑制性消减杂交技术,以15DPA纤维为driver、20DPA纤维为tester,成功构建出陆地棉开花后20d纤维的cDNA消减文库。通过蓝白斑筛选、菌落PCR及反向Northern技术最终筛选出差异表达的阳性克隆340个。通过对阳性克隆测序及序列分析,共得到115个单一序列,其中35个重叠群,80个单拷贝。利用Blast2GO等对差异表达基因进行生物信息学分析,结果表明这些差异表达基因广泛参与糖类、脂类、氨基酸等物质的代谢,以及纤维素生物合成、细胞壁合成与修饰、氧化还原、细胞信号转导等生物学过程。
- 王少干商海红计志斌闫恒超李俊文刘爱英石玉真龚举武巩万奎王涛袁有禄
- 关键词：棉花棉花纤维次生壁纤维强度抑制性消减杂交
- 棉花纤维次生壁加厚期基因的表达谱分析被引量：3
- 2011年
- 本研究以高纤维强度材料0-153和转基因抗虫棉sGK9708为亲本构建的高代重组自交系群体(F6:8)中纤维强度具有显著差异的两个系(高强材料69307和低强材料69362)作为材料,利用cDNA芯片技术,对纤维次生壁加厚阶段(15DPA和20DPA)的基因表达谱进行研究。共检测到差异表达基因3383个,占cDNA芯片基因序列的11.59%;并从中选择4个代表性基因利用荧光定量PCR进行验证,其表达模式与芯片数据一致,证明芯片结果可靠。通过次生壁加厚期标志基因的表达模式研究发现,两个材料纤维发育过程不同步,高强纤维材料比低强纤维材料晚进入次生壁加厚期。利用Blast2GO软件对差异表达基因进行富集分析表明,在15DPA到20DPA,寡糖或多糖等碳水化合物、类苯基丙烷和类黄酮合成等次生代谢、氧化还原、细胞信号转导等生物学过程中相关基因出现显著性富集。而且,这些差异表达基因在两个材料中的表达模式具有时间差异性。这种表达模式的差异可能是影响棉纤维强度性状的重要原因之一。本研究为棉纤维次生壁加厚相关基因的克隆奠定了基础,同时也为深入挖掘棉纤维品质性状重要基因,并将其用于棉纤维品质性状的改良奠定了基础。
- 计志斌商海红闫恒超王少干李俊文刘爱英石玉真龚举武巩万奎王涛袁有禄
- 关键词：棉花CDNA芯片表达谱纤维强度
