中国热带农业科学研究院科技基金(Rky0709)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
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- 海南苦楝丛枝病植原体核糖体蛋白基因片段序列分析被引量：1
- 2008年
- 【目的】利用分子生物学方法分析采自海南儋州的苦楝丛枝病植原体核糖体蛋白(rp)基因,从亚组水平上确定苦楝丛枝病植原体的分类地位。【方法】利用植原体核糖体蛋白基因通用引物对rpF1/rpR1,应用PCR技术对苦楝丛枝病植原体的核糖体蛋白基因进行扩增,对其核苷酸序列进行测定并分析。【结果】通过PCR扩增得到约1.2 kb的特异片段,测序结果表明该片段长1 240 bp,包括rps19基因的3′区域,rpl22和rps3基因的全部区域。进一步分析发现,该片段与苦楝丛枝病贵州株系(Chinaberry witches'-broom,CWB-GZh)的亲缘关系最近,核苷酸同源性达99.9%。基于核糖体蛋白基因核苷酸序列,构建了海南苦楝丛枝病植原体与其他18个已知分类地位植原体的系统分类树状图,结果表明,引起海南苦楝丛枝病的植原体与16SrⅠ-B亚组植原体越南苦楝黄化、苦楝丛枝贵州株系和苦楝丛枝云南株系在同一条进化枝上。【结论】报道了海南苦楝丛枝病植原体的核糖体蛋白基因序列,海南苦楝丛枝病植原体属于16SrⅠ-B。
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- 关键词：植原体核糖体蛋白基因
- 海南长春花小叶病植原体16S rDNA基因片段的比较分析被引量：2
- 2008年
- 从海南儋州地区的长春花上采集了表现小叶症状,疑似植原体感染的病样,利用植原体16S rDNA通用引物对Rl6mF2/Rl6mR1,应用PCR技术从该样品的总DNA提取物中扩增到预期大小的特异片段(约1.4kb),该片段的序列分析及系统关系树构建的结果表明,该片段与16Sr I组中的植原体同源率均达到99%以上,而与其它组的植原体16S rDNA序列的同源率均低于96%,与16SrⅠ组植原体缬草黄化、翠菊黄化、桑萎缩和玉米丛矮等在同一条进化枝上。故初步认为引起海南长春花小叶病的植原体应归属于16Sr I组,将其暂命名为长春花小叶植原体海南株系(Periwinkle little leaf phytopla smastrain Hainan,PLL-Hn)。
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- 关键词：植原体RDNA
