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上海市科委国际合作基金(075407001)

作品数：1 被引量：10H指数：1
相关作者：徐昭张晨虹李旻华蔚颖赵立平更多>>
相关机构：复旦大学上海交通大学更多>>
发文基金：上海市科委国际合作基金更多>>
相关领域：生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇群结构
  • 1篇菌群结构

机构

  • 1篇复旦大学
  • 1篇上海交通大学

作者

  • 1篇张梦晖
  • 1篇赵立平
  • 1篇华蔚颖
  • 1篇李旻
  • 1篇张晨虹
  • 1篇徐昭

传媒

  • 1篇中国微生态学...

年份

  • 1篇2010
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用被引量：10
2010年
目的探究将基于短串频度的CVTree方法用于反映菌群结构的16S rRNA基因的454高通量测序数据分析的可行性,为快速分析高通量菌群结构数据提供新的方法。方法对一个四世同堂的中国家庭7名成员肠道菌群和不同基因型及饮食类型的小鼠肠道菌群用454高通量方法获得16S rRNA基因的V3区的测序数据,用CVTree的方法进行菌群结构的比较分析。结果通过选取合适的短串长度,CVTree的方法能准确检测到各样本间的聚类关系,其结果与之前文献报道的基于Unifrac算法的结果相一致。结论CVTree能快速、有效地处理16S rRNA基因的454高通量测序数据,实现对不同菌群结构相似性的比较分析。
华蔚颖徐昭张梦晖李旻张晨虹赵立平
关键词：菌群结构
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