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排序方式：

油菜次生休眠种子转录组的RNA-seq分析被引量：3: 2014年; 油菜种子次生休眠特性是油菜产区自生苗长期留存并持续危害的主要原因,也是转基因油菜环境安全评估的重要性状.为探讨该性状的分子生态学特征,本研究以强次生休眠油菜品种的成熟种子为材料,对次生休眠前种子(CK)和次生休眠后种子(SD)的转录组进行了RNA-seq分析.2份样本测序所得的有效数据均超过了4 Gb,并从头拼接出序列长度?100 bp的转录本314261个,其中29740个转录本的序列长度?500 bp.根据功能注释信息,在?500 bp的长序列转录本中有1641个成员被分类到24种COG类群,有16515个成员被GO分类到2648个功能节点.在P?0.001显著性水平和2倍以上RPKM变化条件下,鉴别出452个代表性的长序列差异表达转录本,其中343个成员有序列高度相似的拟南芥同源基因对应.数据显示,绝大多数ABA,GA合成代谢和信号转导基因能从休眠种子转录组中找到同源转录本,但它们的表达水平在样本间多无显著差异.综合GO富集、KEGG富集以及种子休眠调控基因同源转录本的差异表达信息,脂肪酸代谢信号有可能参与到油菜种子次生休眠的诱导发生.本研究结果对于认识油菜自生苗发生规律和评估转基因油菜环境安全性具有重要意义.; 刘福霞赵祥强张丽华唐瑭卢长明陈桂敏王兴龙卜翠萍赵祥祥; 关键词：油菜转录组测序

油菜外源抗除草剂基因的分子检测被引量：1: 2013年; 依托"淮安市转基因农产品检测技术公共服务平台",参考国家有关标准设计引物和探针,通过普通PCR和实时荧光PCR技术,对3个未知油菜样品进行外源抗草胺膦BAR基因和抗草甘膦GOX基因的检测。结果表明:油菜品种A为普通的非转基因油菜,油菜品种B为转抗草胺膦基因油菜,油菜品种C为转抗草甘膦基因油菜。该研究为转基因油菜的检测与生物安全管理提供技术支持。; 赵祥祥陈桂敏刘福霞唐瑭卜翠萍赵祥强; 关键词：油菜抗除草剂转基因检测 PCR

成熟油菜次生休眠种子RNA的快速高效提取方法被引量：4: 2013年; 针对成熟油菜次生休眠种子富含多糖和多酚、老健组织部分富含RNA酶、生理活性低等特点,通过选用RNAplant plus reagent植物总RNA提取试剂,添加β-巯基乙醇抑制RNA酶活性、防止酚类物质氧化,应用醋酸钠去除多糖类物质对RNA的影响,以及缩短抽提时间等措施,建立成熟油菜次生休眠种子RNA的快速高效提取方法。结果表明:采用本方法提取的RNA D260nm/D280nm为1.92～2.05,28SrRNA和18SrRNA条带清晰而完整,且无明显降解,可以应用于后续的mRNA分离、建库和高通量转录组测序。; 赵祥祥刘福霞唐瑭赵祥强王兴龙卢长明; 关键词：油菜种子 RNA提取

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江苏省自然科学基金(BK2011410)