湖南省高校创新平台开放基金(13K063)
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
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- 相关机构：湖南农业大学湖南杂交水稻研究中心北京首佳利华科技有限公司更多>>
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 水稻Cu/Zn-SOD基因的克隆、表达及生物信息学分析被引量：3
- 2018年
- 为了探究水稻铜锌超氧化物岐化酶基因(OsCu/Zn-SOD)的功能,以水稻品种日本晴(Oryza sativa japonica)为材料,采用同源克隆法获得OsCu/Zn-SOD,并对其进行表达及生物信息学分析。结果表明,OsCu/Zn-SOD基因cDNA序列为606 bp,编码152个氨基酸,CDS区459 bp,碱基组成A为22.7%、T为24.4%、G为29.4%、C为23.5%。OsCu/Zn-SOD蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水;二级结构中以无规则卷曲和延伸链结构为主,三级结构同源建模成功,主要是螺旋和转角;亚细胞定位OsCu/Zn-SOD主要分布在细胞质中,推测可能在翻译、运输结合和能量代谢过程中发挥重要作用,无跨膜结构域,无信号肽;该蛋白序列中存在8个丝氨酸磷酸化,4个苏氨酸磷酸化位点。进化分析表明,克隆的OsCu/Zn-SOD氨基酸序列与玉米、短柄草的同源关系较近,具有较高的保守性,与小立碗藓的同源关系较远。RT-PCR分析表明,OsCu/Zn-SOD基因在各组织中均有表达,水稻孕穗期中茎的表达最高,其次分别为叶和穗,根中表达量最低。本研究为进一步研究OsCu/Zn-SOD在水稻抗逆中的作用提供了重要的帮助。
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- 关键词：水稻克隆生物信息学分析
- 水稻锌指蛋白基因OsBBX22响应热胁迫的功能分析被引量：4
- 2018年
- 利用RNA干涉技术研究水稻锌指蛋白基因OsBBX22的生物学功能,为探讨OsBBX22响应热胁迫的机制、培育抗逆水稻、减轻高温对水稻的损害奠定基础。通过观察转基因突变体植株和野生型植株在热胁迫下的表型差异,分析OsBBX22生物学功能;采用半定量PCR和荧光定量PCR检测OsBBX22以及相关的热激转录因子（HSF）、热激蛋白（HSP）基因在转基因突变体株系中的表达水平;通过原位组织化学检测过氧化氢在野生型、转基因突变体株系叶片中的定位和积累情况。结果表明,在0-5 h热胁迫条件下,与野生型株系相比,OsBBX22的表达在转基因突变体植株中明显下调;而野生型OsBBX22受热信号诱导,随着热激时间的增加,OsBBX22的表达量呈先上升后下降的趋势,且在热激1 h时表达量最高。相关的HSF和HSP也受热信号诱导,野生型株系中的HSFA2a、HSFA7、HSP16.9和HSP100表达量均比转基因突变体株系高,且在热激1 h时,HSFA2a、HSP16.9和HSP100表达量最高,而HSFA7在热激3 h时表达最高。热胁迫3 h,经DAB染色,转基因突变体株系叶片上出现的红褐色斑点主要集中于叶脉和受损伤部位,且明显多于野生型。锌指蛋白基因OsBBX22在水稻苗期热胁迫应答中具有重要的作用,野生型株系抗热能力明显高于OsBBX22抑制表达转基因株系;HSFA2a、HSFA7、HSP16.9和HSP100可能参与了OsBBX22介导的水稻耐热调控。
- 骆鹰谢旻谢旻张超王伟平万向元万向元饶力群
- 关键词：热胁迫热激转录因子热激蛋白
- 粳稻糖基转移酶Ⅰ基因家族全基因组鉴定及功能分析
- 2022年
- 糖基转移酶Ⅰ(GTⅠ)家族是糖基转移酶中的一类,其主要功能涉及黄酮类化合物糖基的转移、淀粉和蔗糖的合成等。为揭示GTⅠ基因家族在粳稻生长发育以及抗逆中的作用,为粳稻GTⅠ基因家族成员的功能研究提供基础,为水稻的品种改良和提高水稻耐高温提供思路,采用生物信息学方法鉴定出30个GTⅠ基因家族成员,并分析了粳稻GTⅠ基因家族成员的基因结构、蛋白质理化性质、染色体定位及基因进化、系统发育关系、保守结构域和蛋白质三维结构建模等。结果显示,粳稻的30个GTⅠ基因家族成员在水稻12条染色体上均有分布,其基因结构、保守基序和遗传进化相对保守,家族成员启动子均预测到脱落酸响应元件,家族蛋白质的三维结构保守含有6个β-折叠和7个α-螺旋。通过转录组数据与实时荧光定量分析,GTⅠ基因家族大部分成员对高温胁迫的响应出现在高温处理后第6小时,其中OS-GT29表达量呈持续高表达。GTⅠ基因家族在拟南芥和粳稻功能存在相似。
- 周镇中罗彪骆鹰夏敏汪启明饶力群
- 关键词：粳稻基因家族生物信息学
- MicroRNA参与植物耐受非生物胁迫的研究进展被引量：1
- 2013年
- MicroRNA(miRNA)作为一种基因表达的内源性负调控因子广泛存在于植物中,通过与响应非生物胁迫有关基因的mRNA互补配对从而在转录后水平调控基因表达。miRNA在植物耐受非生物胁迫方面发挥着重要作用。综述了miRNA参与植物耐受低氮、低磷、缺硫、干旱、温度、氧化、重金属等不同非生物胁迫的分子机制及作用方式,并对其可能的作用机理作出展望。
- 胡双帅进汪启明饶力群
- 关键词：植物非生物胁迫基因调控
