浙江省科技攻关计划(2005C23085)
- 作品数:5 被引量:14H指数:2
- 相关作者:褚武英钱荣华耿梅梅于涟毛芝娟更多>>
- 相关机构:中国科学院亚热带农业生态研究所浙江大学长沙大学更多>>
- 发文基金:浙江省科技攻关计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 大黄鱼α-珠蛋白cDNA的克隆及其特性分析被引量:5
- 2005年
- 采用3'末端快速扩增法,首次从大黄鱼中克隆到564bp的血红蛋白α亚基cDNA。该序列包含435bp的开放读码框和126bp的3'末端非编码区,编码144个氨基酸的多肽。计算其可能的相对分子质量为15 930D,等电点为9.27,推导的氨基酸序列与其它13种鱼及人血红蛋白α亚基进行同源性比较,其同源性在35.7% ̄70.3%之间,它与同属真口鱼纲的草鱼、大西洋鲑鱼、金鱼、虹鳟、金枪鱼、电鳗等的同源性较高,而与肉鳍鱼纲的肺鱼及板鳃纲的鲨鱼的同源性较低,而且发现该序列在CD5(第48位)处插入了一个独特的甘氨酸残基,在近端与血红素结合的F8(第90位)的组氨酸高度保守。
- 褚武英于涟毛芝娟张崇文钱荣华
- 关键词:大黄鱼珠蛋白克隆
- 美国红鱼生长激素基因的克隆及其遗传进化分析被引量:2
- 2008年
- 采用PCR方法从美国红鱼肝脏中扩增出美国红鱼生长激素基因。该基因序列长为1 497 bp,与5个已报道的鲈亚目鱼类生长激素基因结构比较发现,他们的外显子和内含子之比均为6∶5,而且相对应的6个外显子大小一致。用Clustal X软件对美国红鱼和其他13种鲈形目鱼类生长激素基因序列进行比对,选取同源性较高的551 bp的编码区序列构建NJ和MP系统进化树,结果发现由其构建的MP和NJ树与根据形态特征构建的系统发育树基本一致,特别是在鲈形目鱼类科间及科以上分类阶元的系统发育研究方面比较一致。研究结果表明鱼类生长激素基因序列能够较真实反映近缘鱼类之间的关系,是进行鲈形目鱼类系统进化分析的较好遗传标志。
- 耿梅梅王文策石常友张建社吴信褚武英
- 关键词:美国红鱼石首鱼科鲈形目生长激素基因系统发育树
- 美国红鱼珠蛋白链的分离及其和α-珠-β蛋白基因的克隆被引量:2
- 2007年
- 通过含Triton X-100的酸性聚丙烯酰胺电泳法从美国红鱼(Sciaenopes ocellatus)血液中分离到4条β-珠蛋白链和2条α-珠蛋白链,其中β和β链是主要β-珠蛋白链,α链是主要α-珠蛋白链。美国红鱼α-珠蛋白基因cDNA开放读码框由435个核苷酸组成,编码144个氨基酸的多肽。与大黄鱼α-珠蛋白一样,美国红鱼α-珠蛋白在C与E螺旋间隔区也插入了一个独特的甘氨酸残基。美国红鱼β1-珠蛋白基因cDNA开放读码框由447个核苷酸组成,编码148个氨基酸的多肽。美国红鱼α-和β-珠蛋白基因拥有典型的珠蛋白基因结构,由3个外显子组成,中间间隔着2个内含子。美国红鱼β2-珠蛋白基因内含子1有一段TTA重复序列,此序列插入可能使内含子原有的功能发生改变或丧失。
- 褚武英耿梅梅钱荣华李铁军姚康印遇龙陈立祥
- 关键词:美国红鱼珠蛋白基因克隆内含子
- 大黄鱼紧密连锁的α-和β-珠蛋白基因间序列功能分析被引量:1
- 2008年
- 姚康王文策耿梅梅吴信李铁军褚武英
- 关键词:大黄鱼PCR珠蛋白基因间序列
- 溶藻弧菌铁调蛋白基因的克隆、表达及其特征分析被引量:4
- 2007年
- 铁为一切有机体所必需。对铁摄取与利用的调控在细菌生长和铁毒性中起重要作用。在革兰氏阴性细菌中,铁摄取调节蛋白(Fur)主管铁的代谢。溶藻弧菌是人和海洋动物共感染的一种主要病原弧菌。本研究克隆表达了溶藻弧菌的fur基因,并分析了其相关特征。该基因序列全长994 bp,其中包含450 bp的开放读码框,编码150个氨基酸残基的蛋白,推导的相对分子量为16.78 kD.在编码序列的上下游,RBS序列-、10序列-、35序列和二个潜在的转录终止子分别得到确定,但没有发现存在于大肠杆菌fur基因中的"铁盒子"。氨基酸序列的中段从G46位至D104位,为高度保守区域,其中包括含组氨酸丰富铁结合模型(H3-D-H-L-V-C-L-D-C-G)。SDS-PAGE分析表明,fur基因可在大肠杆菌中大量表达,带His-Tag的重组融和蛋白经镍亲和层析得到纯化,Western-blot分析结果显示,Fur蛋白具有免疫反应性。为进一步研究Fur蛋白的结构与功能打下基础。
- 钱荣华于涟毛芝娟褚武英张崇文
- 关键词:溶藻弧菌克隆