国家自然科学基金(30240056)
- 作品数：4 被引量：29H指数：3
- 相关作者：梁宋平谢锦云李建玲陈主初冯雪萍更多>>
- 相关机构：湖南师范大学中南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划湖南省科技厅重点项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 肿瘤蛋白质组学的研究进展
- 蛋白质组学作为后基因组时代研究的一个重要内容,已广泛深入到生命科学和医药学的各个领域,其理论和技术的发展完善为肿瘤的研究带来了新的思维方式和研究领域．它不仅可以从组织或细胞蛋白质整体水平这一全新角度来研究肿瘤发病机理,而...
- 肖志强
- 关键词：肿瘤蛋白质组蛋白质组学
- 文献传递
- 大腹园蛛(Araneus ventricosus)粗毒双向电泳及质谱分析被引量：3
- 2004年
- 以大腹园蛛粗毒为材料,用固相pH梯度等电聚焦IPG(immobilizedpHgradient,)和SDS-PAGE(sodiumdodecylsulfatepolyacrylamidegelelectrophoresis)获得蛋白质组双向电泳图谱,经Bio-Rad公司的PDQUEST软件进行图像分析,检测到500个左右的蛋白质点.对其图谱的部分蛋白质点酶解后使用Micromass公司的ES-I-Q-TOF进行了鉴定.得到了质量较好的MS/MS数据,然后将其在MS-Fit中的genepeptide数据库和Mascot的Swissprot中进行搜索从而对蛋白质点进行鉴定.目前初步获得5个组分的鉴定结果.
- 柳亦松谢锦云梁宋平
- 关键词：大腹园蛛SDS-PAGE双向电泳
- 人肺鳞癌组织的血清蛋白质组学的比较分析被引量：13
- 2005年
- 采用以肿瘤免疫学与蛋白质组学(proteomics)研究技术有机地结合为基础的血清蛋白质组学研究体系(serologicproteomeanalysis ,SERPA)筛选肺癌分子标志物.对10例人肺鳞癌组织,应用双向凝胶电泳(two dimensionalelectrophoresis ,2 DE)技术对同一肺鳞癌组织的细胞总蛋白同时进行电泳后获得3张相同的凝胶,其中一块2 DE凝胶经银染显色作为平行胶,其余两块2 DE凝胶经电转膜将凝胶中的蛋白质转至硝酸纤维素(NC)膜上,然后分别与肺癌患者的自身血清以及正常对照血清进行Western印迹分析,获取Western印迹反应图谱.经计算机图像分析识别差异反应的蛋白质,然后与平行胶比较找出相应的差异反应蛋白质点.获得了分辨率较高的人肺鳞癌组织与患者的自身血清以及正常对照血清的Western印迹反应图谱;图像分析共识别36±8个差异反应的蛋白质;在平行胶上找到了匹配的差异反应蛋白质点.对2 0个差异蛋白质点进行了肽质指纹图分析,鉴定出14个与细胞生长增殖、细胞代谢、细胞周期调控、信号转导等有关的肺鳞癌相关抗原.通过血清蛋白质组技术对肺鳞癌组织进行的研究,建立了分辨率较高的人肺鳞癌组织与患者的自身血清以及正常血清的Western印迹反应图谱,成功鉴定14个肺鳞癌相关抗原,为进一步筛选用于肺鳞癌诊断。
- 李萃肖志强章晓鹏陈主初吴晓英冯雪萍张鹏飞李建玲易红梁宋平
- 关键词：人肺鳞癌血清蛋白质组双向凝胶电泳MALDI-TOF-MS
- 小鼠肝质膜蛋白质的生物信息学研究被引量：2
- 2005年
- 随着高通量蛋白质组研究技术的发展,使用生物信息学方法对鉴定出的蛋白质进行批量的物理化学性质和功能属性的研究显得越来越重要.对2-DE分离的小鼠肝质膜中鉴定的209个蛋白质运用生物信息学方法进行了一系列的功能属性分析,包括统计分析ProtParam软件计算出的209个蛋白质的理论相对分子质量、等电点以及疏水值的分布情况,使用TMHMM预测蛋白质的跨膜区数目,运用系统发生谱方法预测蛋白质相互作用网络,根据其相互作用网络预测部分未知蛋白质的功能.
- 刘珍张丽军谢锦云梁宋平
- 关键词：生物信息学物理化学性质蛋白质相互作用
- Comparative Proteome Analysis of Human Lung Squamous Carcinoma Tissue被引量：11
- 2006年
- 客观：与高分辨率建立二维的电气泳动侧面；从人的肺的重制度有鳞的癌织物；配对的正常肿瘤邻近的支气管的上皮，；识别微分表示由使用 proteome 分析的联系肿瘤的蛋白质。方法：有 20 人的肺的比较 proteome 分析有鳞的癌纸巾；邻近肿瘤的配对的正常支气管的上皮被执行。人的肺的全部的蛋白质有鳞的癌织物；配对的正常肿瘤邻近的支气管的上皮借助于使不能调动的 pH 被分开基于坡度的二维的胶化电气泳动(2-DE ) ；染色的银。微分表示蛋白质被分析；然后到飞行团分光术(MALDI-TOF-MS ) 的帮助矩阵的激光解吸附作用 / 电离时间识别了。结果：(1 ) 人的肺的解决得好的、可再现的 2-DE 模式有鳞的癌；邻近的正常支气管的上皮被获得。为肿瘤织物， 3 胶化的平均的点是 1567 ± 4 6，；4 看到的 1436 ± 5 与 91.6% 的平均匹配率被匹配。为控制， 3 胶化的平均的点是 1349 ± 5 8，；5 看到的 1228 ± 3 与 91.03% 的平均匹配率被匹配。匹配的点的平均位置偏差是在 IEF 的 0.924 ± 0 .128 公里方向，；在 SDS 页方向的 1.022 ± 0 .205 公里；(2 ) 6 看到的 1178 ± 5 的一个总数在 20 人的肺的电泳地图之间被匹配有鳞的癌纸巾；配对正常肿瘤邻近的支气管的上皮。76 差别表示了蛋白质被屏蔽；(3 ) 68 微分蛋白质被 PMF 识别，一些蛋白质是 oncogenes 的产品，；涉及房间的规定的其它骑车；信号转导变异；(4 ) 以便验证识别结果的可靠性， 3 蛋白质 mdm2 的表示， c-jun；EGFR，它与肺被相关有鳞的癌，被免疫检测组织化学的染色；西方的污点分析。结果揭示了那 mdm2， c-jun；EGFR 在肺是起来调整的有鳞的癌而他们在邻近的正常支气管的上皮是下面调整的，正常的肺纸巾；煽动性的假肿瘤，它与我们的 proteome 分析一致结果。结论：人的肺的解决得好的、可再现的 2-DE 模式有鳞的癌�
- LI CuiTANG Can＇eDUAN ChaojunYI HongXIAO ZhiqiangCHEN Zhuchu
- 关键词：肿瘤组织蛋白质
