国家自然科学基金(81072486)
- 作品数:8 被引量:18H指数:2
- 相关作者:李永哲张奉春李萍胡朝军李丽君更多>>
- 相关机构:北京协和医学院北京协和医院中国医学科学院北京协和医学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划北京协和医院青年科研基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- FAM167A—BLK和TNFSF4基因多态性与原发性干燥综合征的遗传相关性被引量:4
- 2013年
- 目的探讨中国汉族人群中与其他自身免疫性疾病相关的FAM167A—BLK和TNFSF4基因区域多态性是否与原发性干燥综合征(pSS)存在遗传相关性。方法临床对照研究。选取2008年11月至2011年12月北京协和医院515例中国汉族pSS患者和567名健康体检者,对所有候选单核苷酸多态性(SNP)位点采用时间飞行质谱生物芯片系统(Sequenom MassArray)进行基因分型。采用X^2检验、logistic回归分析对SNP位点的基因型、等位基因、上位效应和单体型进行相关性分析,并在3种遗传模型(加性、显性和隐性)下对各SNP位点进行相关性分析。结果FAM167A—BLK基因区域的rs7812879和rs2254546位点在pSS组的基因型频率为:TT6.2%,TC28.5%,CC65.2%;AA6.0%,AG30.0%,GG64.0%;在健康对照组的基因型频率为:TT4.7%,TC38.2%,CC57.1%;AA5.1%,AG39.3%,GG55.6%,差异有统计学意义(X^2=11.09、9.91,Pa〈0.05)。且在显性遗传模型下,rs7812879(OR=0.71,Pa=0.044)、rs2254546(OR=0.70,Pa=0.037)和rs2736340(OR=0.71,Pn=0.039)3个SNP位点基因型分布在pSS组和健康对照组之间差异均有统计学意义。rs7812879、rs2254546和rs2736340位点组成的CGT单体型在pSS组和健康对照组的频率分别为75.7%和70.8%,差异有统计学意义(X^2=6.36,P=0.012)。在各种分析中未发现FAM167A—BLK基因区域的rs2248932和TNFSF4(rs2205960和rs704840)基因多态性与pSS相关(P均〉0.05),且FAM167A—BLK和TNFSF4基因区域内未发现所选SNP位点存在上位效应(P均〉0.05)。结论在汉族人群中FAM167A—BLK基因区域的rs7812879、rs2254546和rs2736340位点与pSS的遗传易感性密切相关,而FAM167A—BLK基因区域的rs2248932以及TNFSF4基因区域的rs2205960和rs704840与pSS的易感性无明确相关性。
- 孙菲李萍吴子燕徐涓娟陈华田新平张奉春李永哲
- 关键词:干燥综合征多态性单核苷酸蛋白酪氨酸激酶类
- 蛋白质微阵列芯片技术在自身抗体检测及研究中的应用被引量:1
- 2010年
- 自身免疫性疾病患者以血清出现多种自身抗体为主要特征。由于自身免疫性疾病发病机制非常复杂,往往一种自身免疫性疾病可涉及数十种,甚至上百种自身抗体,如PBC患者存在60多种自身抗体,SLE患者存在100多种自身抗体,所以自身抗体的筛选研究和多种自身抗体的同时检测非常重要,但又困难。
- 胡朝军李俊李永哲
- 关键词:蛋白质微阵列抗体检测芯片技术SLE患者自身抗体
- 自身免疫性疾病蛋白质组学的研究进展被引量:2
- 2011年
- 自身免疫性疾病是由机体免疫效应细胞或免疫效应分子针对自身组织或细胞产生免疫应答,最终导致组织损伤或器官功能障碍的炎症性疾病,其总体发病率占世界人口的3%-5%。然而,自身免疫性疾病的发病机制尚未完全明了,逐年上升的致残率与死亡率亦提示自身免疫性疾病的诊断与治疗正面临着巨大挑战。
- 邓垂文李永哲
- 关键词:自身免疫性疾病免疫效应分子器官功能障碍炎症性疾病免疫应答
- 人类基因组编码蛋白高通量芯片筛选原发性胆汁性肝硬化血清标志物被引量:2
- 2010年
- 目的 探讨用人类基因组编码蛋白高通量芯片(以下简称"高通量蛋白芯片")筛选出有诊断价值的PBC血清标志物的应用价值.方法 用高通量蛋白芯片(包含17 718个人类基因编码蛋白,共有38 400个蛋白点)筛选21例PBC患者、20例疾病对照患者(AIH 7例,病毒性肝炎8例,其他自身免疫性疾病5例)和10名健康对照者血清,并用生物信息学软件提取筛选信息后,经统计软件分析确定有价值的诊断PBC的血清标志物.结果 用抗GST抗体对高通量蛋白芯片进行检测的结果显示,该芯片蛋白点的检出率为97.6%,蛋白复点间检测信号强度的相关系数为0.98.用高通量蛋白芯片从PBC组、疾病对照组和健康对照组中筛选出4个差异有统计学意义的标志物(PDHA1、DBT、DLAT和HK1),他们在3组中的阳性率分别为66.67%(14/21)、5.00%(1/20)和0(0/10),57.14%(12/21)、5.00%(1/20)和0(0/10),52.38%(11/21)、0(0/20)和0(0/10),52.38%(11/21)、0(0/20)和0(0/10) 3组4项指标分别比较的差异均有统计学意义(PDHA1:x2=16.79,P<0.01 Fisher精确检验,P=0.000 DBT:x2=12.86,P<0.01 Fisher精确检验,P=0.004 DLAT和HK1:Fisher精确检验,P均分别为0.01、0.05).其中,针对PDHA1、DBT和DLAT蛋白的抗体为现已使用的PBC标志物-AMA-M2组成部分 针对HK1蛋白的抗体为新发现的PBC标志物,其对PBC的诊断敏感度为52.38%,特异度为100.00%.AMA-M2阳性与AMA-M2阴性PBC患者中未发现差异有统计学意义的血清标志物.经Fisher精确检验,ACA阳性与ACA阴性PBC患者间仅针对着丝粒B(CENPB)蛋白的抗体差异有统计学意义(Fisher精确检验,P=0.000).结论 高通量蛋白芯片是一种快速全面筛选诊断PBC标志物的技术.针对HK1蛋白的抗体对PBC具有较好的敏感度和特异度,可作为PBC新标志物.AMA-M2阳性与AMA-M2阴性PBC患者间未发现具有统计学意义的血清标志物,而针对CENPB蛋白的抗体可作�
- 胡朝军李永哲李晞张蜀澜李萍李丽君张奉春曾小峰
- 关键词:蛋白质阵列分析生物学标记
- 抗酿酒酵母细胞抗体在原发性胆汁性肝硬化患者中的临床意义被引量:2
- 2010年
- 目的 检测原发性胆汁性肝硬化(PBC)患者血清抗酿酒酵母细胞抗体(ASCA),探讨其在PBC中的阳性状况和临床意义.方法 采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测162例PBC患者、44例自身免疫性肝炎(AIH)患者、41例肝病对照组(LDC)患者、144例炎症性肠病(IBD)患者及35名健康体检者血清ASCA的IgA和IgG亚型.采用χ2检验和非参数U检验进行分析.结果 ASCA-IgA在PBC患者中的阳性率为24.1%,高于溃疡性结肠炎(UC)组11.6%(χ2=5.5,P<0.05)和健康对照组0(χ2=10.5,P<0.01),与AIH组(20.5%)、LDC组(14.6%)和克罗恩病(CD)组(34.5%)比较,差异无统计学意义(P>0.05);ASCA-IgG在PBC患者中的阳性率为11.1%,明显低于CD组27.6%(χ2=8.9,P<0.01),高于健康对照组0(χ2=10.5,P<0.01),与AIH组(15.9%)、LDC组(7.3%)和UC组(8.1%)比较,差异无统计学意义(P>0.05);ASCA-IgA和IgG同时阳性的PBC患者仅占6.2%,显著低于CD组17.2%(χ2=6.3,P<0.05);ASCA-IgA或IgG阳性的PBC患者占29.0%,显著低于CD组44.8%(χ2=4.8,P<0.05),高于UC组(χ2=5.9,P<0.05)和健康对照组(χ2=13.3,P<0.01).抗GP210抗体阳性的PBC患者ASCA阳性率高于抗GP210抗体阴性PBC患者(38.6%和23.8%,χ2=3.9,P<0.05);抗线粒体抗体(AMA)、抗SP100抗体阳性和阴性PBC患者间ASCA的阳性率差异无统计学意义.ASCA-IgA阳性PBC患者总胆红素、直接胆红素、总胆汁酸、乳酸脱氢酶(LD)、IgA、IgM、红细胞沉降率(ESR)高于ASCA-IgA阴性PBC患者,而白蛋白(ALB)、白蛋白/球蛋白和胆碱酯酶低于ASCA-IgA阴性PBC患者(P均<0.05).ASCA-IgG阳性PBC患者与阴性患者间肝功能损伤指标和免疫功能指标差异均无统计学意义.结论 ASCA并不是IBD特异性自身抗体,在PBC患者有较高的阳性率,且以IgA亚型为主.ASCA-IgA与PBC患者肝功能损伤指标和免疫活动指标改变有关,而ASCA-IgG与PBC患者肝功能损伤指标和免�
- 胡朝军张蜀澜周仁芳李晞李萍李丽君董晓娟张奉春李永哲
- 关键词:自身抗体
- 中国154家实验室检测抗平滑肌抗体和抗线粒体抗体的比对分析被引量:6
- 2014年
- 目的调查分析中国检测平滑肌抗体(ASMA)和抗线粒体抗体(AMA)工作现状,为改进其检测质量提供依据。方法调查性研究。共有154家实验室(至少参加1个项目的检测比对工作)自愿报名参加全国自身免疫性肝病相关抗体检测多中心比对分析。由卫生公益性行业科研专项“风湿免疫病诊疗关键技术临床推广及转化应用研究”项目组(以下称“项目组”)制备比对样品(液体血清),包括5份ASMA比对样品和5份AMA(包括AMA—M2亚型抗体检测)比对样品,并于2012年12月15日常温下将比对样品发放至各实验室。要求各实验室在2012年12月31日之前按照各自实验室常规方法检测比对样品,并于2013年1月14日前将检测结果以及检测所用方法填入统一表格寄回项目组。项目组采用Excel软件对检测结果进行分析,主要包括符合率分析和滴度回报率分析。结果ASMA-1为ASMA阳性,余为ASMA阴性。AMA.3和AMA-4为AMA及AMA.M2双阳性,余为AMA及AMA—M2双阴性。参加ASMA、AMA和AMA—M2检测比对工作的实验室数目分别为103家、103家和138家。ASMA、AMA和AMA.M2比对品检测结果阳性符合率分别为57.3%、66.5%和93.5%,阴性符合率分别为96.8%、99.0%和97.8%。间接免疫荧光法是检测ASMA和AMA的主要方法,但该法阳性符合率较低,分别为57.6%和65.2%,且2个项目的滴度回报率亦较低,分别为39.1%和43.5%。同时回报AMA和AMA—M2检测结果的实验室占总回报实验室的57.0%。结论2012年我国临床实验室检测ASMA和AMA比对品的阳性符合率尚不理想,阴性符合率较好。AMA—M2检测符合率均较好。IIF法检测ASMA和AMA的滴度回报率较低。目前亟需规范和提高自身免疫性肝病相关自身抗体谱检测质量。(中华硷验医学杂舌,2014,37:127.131)
- 邓垂文胡朝军白依娜董晓娟李萍李丽君宋宁史艳萍张奉春李永哲
- 关键词:线粒体自身抗体
- 拷贝数变异及其检测技术在自身免疫性疾病中的应用进展被引量:1
- 2013年
- 拷贝数变异是基因组中广泛存在的一种结构变异,为个体间基因差异的重要来源之一.近年来,随着基因芯片及基因测序技术的成功研发,拷贝数变异的检测技术也日益标准化、自动化,也使得拷贝数变异在自身免疫性疾病等复杂疾病中的作用越来越受到学界的关注和重视.拷贝数变异的检测技术可以分为定点分析技术和基于全基因组水平的分析平台.目前拷贝数变异在自身免疫性疾病中的研究多集中在系统性红斑狼疮和类风湿关节炎,受限于检测技术和检测成本,研究尚处于起步阶段.
- 吴子燕李永哲
- 关键词:自身免疫疾病基因组
- 应用基因芯片技术研究原发性胆汁性肝硬化患者外周血单个核细胞基因表达谱特征
- 2011年
- 目的应用基因芯片技术分析原发性胆汁性肝硬化患者外周血单个核细胞的基因表达谱特征。方法选取9例原发性胆汁性肝硬化患者、9名健康对照为研究对象,提取其外周血单个核细胞总RNA,进行人类全基因组寡核苷酸芯庶〈约22000个基因)检测,筛选出差异表达基因及相关信号通路。结果原发性胆汁性肝硬化患者外周血单个核细胞中差异表达的基因共有79个,其中21个表达上调,58个表达下调。这些基因对应着27条信号通路,其中有6条通路参与了免疫调控及细胞凋亡过程,分别是自然杀伤细胞介导的细胞毒通路、Toll样受体信号通路、抗原加工提呈通路、细胞因子相互作用通路、T细胞受体信号通路、细胞凋亡通路。结论原发性胆汁性肝硬化患者外周血单个核细胞中存在特有的差异表达基因,针对这些基因及相关信号通路的进一步研究,将为探索发病机制和寻找生物标志物提供新的方向。
- 张磊李永哲马丹旭李晞张奉春
- 关键词:胆汁性寡核苷酸序列分析基因表达谱