国家自然科学基金(30901259) 作品数:3 被引量:14 H指数:3 相关作者: 张燕 周剑惠 齐忠 魏雷雷 陈创 更多>> 相关机构: 吉林省疾病预防控制中心 中国疾病预防控制中心 吉林市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
2008-2010年C4a人肠道病毒71型在中国大陆的广泛传播和流行 被引量:5 2012年 目的了解2008-2010年流行于中国大陆的人肠道病毒71型(humanenterovirus71,HEV71)病毒和2008年安徽阜阳株的进化关系以及C4a进化分支病毒在中国大陆各省、区的传播和流行情况。方法从GenBank上获得2008-2010年中国大陆各省份流行的具有完整VPl(≥891bp)或近似完整VPl(≥876bp)基因的核苷酸序列信息的HEV71毒株序列,采用MEGA5.0软件,构建种系发生树,分析2008-2010年流行于中国大陆各省、区的C4aHEV71病毒与安徽阜阳株间的分子流行病学关系。结果中国大陆2008-2010年流行的HEV71分离株除了8株属于A型,一株属于进化分支C4b外,其他均为C4a;目前流行于中国大陆各省、区的C4a病毒与2008年安徽阜阳株同源性较高(96.5%~100%),其溯源可至1998年的C4b病毒。2008年的阜阳株所引发的传播链主要集中在广东、江苏、上海、湖南、山东等省市。结论中国大陆2008-2010年流行的HEV71分离株以C4a进化分支病毒为绝对优势病毒,阜阳株传播链主要分布在中国南部和以安徽为中心的中原地区。 石晶 张燕 周剑惠 朱贞 毛乃颖 许松涛 崔爱利 檀晓娟 祝双利 张勇 严冬梅 孔晓慧 许文波关键词:肠道病毒属 种系发生 疾病传播 引起吉林省2011年手足口病流行的肠道病毒71型VP1区基因的特征 被引量:6 2012年 目的分析引起吉林省2011年手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)VP1区基因的特征。方法对2011年分离自吉林省8个市(州)HFMD病例的35株EV71分离株的VP1编码区基因进行RT-PCR扩增及序列测定,应用Bioedit和MEGA 4.0软件对VP1基因进行同源性和基因亲缘关系分析。结果吉林省2011年的35株EV71分离株均属于C4a基因亚型;其VP1区基因的核苷酸序列同源性在95.9%~100%之间,分属于3个进化枝,形成3个传播链,与2008年安徽阜阳株亲缘关系最近,VP1区基因核苷酸序列同源性达97.6%~99.3%,与2007年的北京株和2003年的浙江株亲缘关系相对较远;2011年吉林省各市中,既存在3个EV71传播链共流行的市,同时监测到2个EV71传播链共流行的市,还发现3个只有单一EV71传播链的市,每个传播链均在5个市流行传播。结论 2011年在吉林省内,3个C4a基因亚型EV71的传播链同时循环传播引起HFMD的流行,未发现优势传播链。 范明 周剑惠 张燕 魏雷雷 王爽 张云仙 苟伟民 马学军 齐忠 孙宇 赵海霞 孙伟 陈创关键词:手足口病 VP1区 基因特征 吉林省2009-2010年引起手足口病流行的肠道病毒71型基因特性的研究 被引量:12 2012年 目的分析引起吉林省2009--2010年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型的基因进化特征。方法选择31株2009-2010年分离于吉林省8个地市(州)HFMD病例的EV71代表株,对VP1编码区基因进行逆转录.聚合酶链反应扩增、扩增产物的序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1基因进行同源性、基因亲缘关系分析。结果吉林省2009-2010年的31株EV71分离株均属于C4a基因亚型,3l株EV7t株在VP1区的核苷酸的同源性在94.5%~100%之间,分属于5个分支,其中25株病毒(分离于8个地市)形成一个大的分支,属于绝对优势传播链,其余6株形成4个小分支。结论2009-2010年在吉林省内有多个EV71C4a基因型的传播链同时存在,其中分支1为绝对优势传播链,在8个地市持续传播,引起HFMD的暴发流行。 周剑惠 王爽 魏雷雷 吴静 齐忠 刘红 苟伟民 陈创 檀晓娟 张勇 张燕 许文波关键词:手足口病 肠道病毒属 疾病传播