江苏省高校高新技术产业发展项目(BG2004317)
- 作品数：3 被引量：19H指数：2
- 相关作者：黄瑞华刘红林王林云张伟峰何宗亮更多>>
- 相关机构：南京农业大学河北工程大学更多>>
- 发文基金：江苏省高校高新技术产业发展项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学建筑科学更多>>
- 猪IGF2基因内含子3变异的遗传效应分析被引量：16
- 2008年
- 采用错配PCR-RFLP技术鉴别了长白猪和大白猪纯种以及长白×大白猪杂交后代去势公猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因内含子3的3072位点变异,分析了遗传来自父本不同等位基因个体间的相关性状差异及不同等位基因的遗传效应。结果表明:在后代个体中,与遗传父本G等位基因的G型个体相比,遗传父本A等位基因的A型个体胸围和体躯指数分别增加了3.06%(P<0.05)和3.01%(P<0.05)。A型个体臀部膘厚、胸腰部膘厚和6～7肋膘厚比G型个体分别薄15.31%(P<0.01)、23.74%(P<0.01)和20.27%(P<0.05);但A型个体肩部膘厚比G型个体厚7.97%(P<0.05)。A型个体比G型个体皮薄9.38%(P<0.01),眼肌面积大22.58%(P<0.01),活体瘦肉率高2.18%(P<0.01),嫩度低17.32%(P<0.05)。A型个体的肌纤维横截面积和肌纤维直径比G型个体分别大32.70%(P<0.01)和15.38%(P<0.01),而A型个体肌纤维密度比G型个体小20.03%(P<0.01)。结果提示,猪IGF2基因内含子3的3072位点来自父源A等位基因有助于后代猪群的体骼发育粗壮,并通过增加单个肌纤维面、眼肌面积和减少皮厚、背膘来影响猪整体肌肉含量和脂肪沉积的。
- 虞德兵何宗亮张伟峰贾晓旭邱新深王林云黄瑞华刘红林
- 关键词：胰岛素样生长因子2
- 猪IGF-2基因内含子3突变检测及其多态性分布
- 2008年
- 采用错配PCR—RFLP法，检测8个品种314头猪IGF-2基因内含子3的3072位点多态性及其在群体中的分布。结果表明：引入错配碱基构造出新的酶切位点，在很大程度上降低了试验成本且不影响基因型判定结果。IGF-2基因内含子3的3072位点（G→A）变异多态在猪群中分布差异极显著。国外品种猪中等位基因A的频率高于我国地方品种猪，我国地方品种猪（二花脸猪、梅山猪、五指山猪、淮猪）群体中绝大多数为GG基因型；而国外品种猪（长白猪、大约克猪、杜洛克猪）群体中GA和AA基因型频率分别为60％-70％和20％～30％。由杜洛克猪与二花脸猪、梅山猪杂交育成的苏太猪，其群体中GA基因型频率接近78％，大大超过地方品种猪。
- 虞德兵张伟峰何宗亮王林云黄瑞华杜文兴刘红林
- 关键词：IGF-2基因内含子多态性
- SLA-DQB和DRB的生物信息学分析被引量：3
- 2008年
- 对Genbank中猪的白细胞抗原(SLA)II类抗原基因DQB及DRB序列进行了SNP及氨基酸序列多态性分析,并对SLA-DQB及DRB分子进行了蛋白质序列模式分析(Prostie motif search)。结果表明:β1功能区存在较大的变异,特别是位于抗原肽结合槽的氨基酸位点中,其变异程度更大。SLA-DQB及DRB蛋白质序列中,主要存在8种类型的蛋白质序列模式位点,其中3种类型的磷酸化位点存在蛋白模序的改变,都位于β1功能区(前94个氨基酸),且多数位点突变频率较高。
- 周波黄瑞华刘红林王林云
- 关键词：BIOINFORMATICSMOTIF
