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EST-SSR标记对三七选育品系的研究被引量：15: 2011年; 目的:通过对不同三七选育品系的遗传变异和遗传分化程度进行分析比较,为三七的品种选育提供理论依据。方法:利用自行设计和他人开发的17对EST-SSR引物,对来自4个不同区域的17份三七选育品系进行遗传多样性及遗传分化分析。结果:在17份三七选育品系中一共扩增出136个多态位点,平均多态信息量PIC值为0.78,Nei′s基因多样性H0.139,Shannon多样性指数I0.208。选育品系间的遗传分化系数为0.382,遗传相似度和聚类分析的结果表明17份三七选育品系和屏边三七被划分为4个大类群,其中17份三七选育品系被分为3个类群,屏边三七单独在一个类群。结论:通过集团选择后,从相同栽培居群内筛选出的不同品系存在一定程度的遗传分化,可以用EST-SSR标记来检测集团选择的结果。; 张金渝杨维泽崔秀明虞泓金航陈中坚沈涛; 关键词：EST-SSR标记

西洋参EST资源的SSR信息分析被引量：17: 2011年; 为了进一步利用现有的西洋参EST-SSR资源,从NCBI公共数据库中下载了4988条西洋参EST,全长为2616.042 kb。含SSR的EST序列313条,共349个SSR,平均每相隔7.5 kb出现1个SSR。SSR出现的频率和平均长度分别为7.00%和24.4 bp。在1-6 bp的重复基元中,三核苷酸重复基元出现频率最高,为34.09%;其次为二核苷酸重复基元和单核苷酸重复基元,分别为32.09%和21.78%。出现最多的重复基元为A/T（20.9%）,其次是AT/TA（16.9%）。结果显示,西洋参的EST数据库中SSR序列出现频率较高,类型较丰富、多态性较高,根据西洋参EST建立其EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径。; 杨维泽金航赵振玲杨美权张金渝; 关键词：西洋参 EST

濒危植物云南黄连不同居群表型多样性研究被引量：17: 2013年; 以揭示濒危药用植物云南黄连不同居群表型变异程度和变异规律为目的，抽取5个天然居群和2个栽培居群为研究材料，对其20个表型性状进行系统分析．采用变异系数、方差分析、相关分析、多样性指数分析和聚类分析等统计分析方法，讨论了云南黄连居群间和居群内的表型多样性．结果表明：云南黄连表型性状在居群内与居群间变异丰富，20个表型性状的变异程度不同，其变异系数范围为10．9％～75．1％，平均为33．6％，其多样性指数范围在1．634～1．839之间；7个居群的变异程度也不同，变异系数在27．4％～37．1％之间，变异最大的为腾冲明光乡自治（TCZ）居群，变异最小的为贡县普拉底乡（GSP）居群；通过表型分化分析，居群间与居群内的表型分化不同，居群问的表型分化系数为74．405％，居群内为25．595％，表明云南黄连的变异主要来自于居群间；20个表型性状间多数呈现出显著和极显著的相关性，采用居群间欧氏距离进行UPGblA聚类分析，7个云南黄连在阈值为10～15时被分为3类，但结果不以地理位置的远近作为分类的依据，且栽培居群与野生居群间差异不大．; 杨维泽金航李晚谊张智慧赵振玲张金渝; 关键词：居群表型多样性

三七栽培居群间表型变异式样研究被引量：9: 2009年; 目的:试图揭示文山地区三七不同栽培群体居群间和居群内的表型多样性及遗传结构,为进一步开展三七种质资源研究和品种选育提供理论依据和基础材料。方法:通过对来自文山地区4个三七主产区10个三七栽培居群的表型变异式样进行调查、统计、分析研究,并进行聚类分析。结果:个体间的差异几乎存在于每一个居群的每一个性状当中,在不同的居群内、不同性状间多样性存在较明显的差异。居群内多态现象丰富,居群间多型性明显,居群间的表型分化系数平均为0.238 8,地区间的表型分化系数Vst平均为0.176 2。Q-聚类分析的结果表明,10个三七栽培居群被划分为4组,居群间的表型差异并不完全与其地理距离的远近一致,自身的遗传作用对表型差异的影响比环境影响更明显。结论:文山三七不同群体均具有丰富的遗传多样性,并且其遗传变异主要存在于居群内个体间;不同居群间具有较大的遗传差异,地区间的遗传差异相对较小,长期的人工选择和不断地轮换种植地点是造成如此状况的主要原因;长期的人工选择已形成一些独特的农家优良种群,为三七的遗传育种提供丰富的材料。; 张金渝肖慧金航崔秀明

三七栽培居群遗传多样性的EST-SSR分析被引量：31: 2011年; 利用EST-SSR标记分析比较6个文山三七居群的遗传多样性和遗传结构,并以2个近缘种为对照进行聚类分析。17对人参属EST-SSR引物在8个居群中共检测到205个多态位点。在居群水平上,6个三七栽培居群的平均多态性信息量为0.729,Ne i′s基因多样性为0.1568,Shannon多样性指数为0.2466,居群间的遗传分化系数为0.2350。研究显示三七具有丰富的遗传多样性,但彼此间具较高的基因交流,居群间遗传分化水平低,遗传差异主要存在于居群内;另外,遗传相似度和聚类分析显示,三七及其近缘种被划分为3个大类群,6个三七栽培居群被分为3个小类群,三七与珠子参有较近的遗传关系,而与屏边三七的遗传距离较远。; 张金渝杨维泽崔秀明金航虞泓陈中坚沈涛杨涛; 关键词：EST-SSR标记

三种人参属植物的EST-SSR信息分析及其在三七中的应用被引量：14: 2011年; 为了解人参属植物EST中SSR分布特点及其在三七SSR标记中的应用,利用生物信息学方法,用primer3软件对dbEST数据库中人参属植物人参、西洋参和三七的EST序列进行搜索,发现人参属植物EST-SSR出现频率为11.54%,平均每4.39kb出现1个SSR。人参属植物单核苷酸重复基元占主导地位,其次为三核苷酸重复基元和二核苷酸重复基元,分别占总SSR的54.48%、17.31%和16.36%。人参属EST-SSR的优势类型为A/T和AT/TA,分别占54.73%和8.21%。根据人参属植物EST中的SSR设计48对引物,在合适的PCR扩增体系下,用5个三七样品的DNA为模板进行PCR扩增,引物有效扩增率85.42%,其中多态性引物占可扩增引物的70.73%。结果表明,利用人参属EST序列开发三七EST-SSR标记是可行的。; 杨维泽金航崔秀明沈涛杨美权张金渝; 关键词：人参属 EST-SSR

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云南省自然科学基金(2007C136M)