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国家自然科学基金(31000779)

作品数:2 被引量:18H指数:2
相关作者:张利达刘斌但现龙施春雷周敏更多>>
相关机构:上海交通大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金“十一五”国家科技支撑计划更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇医药卫生

主题

  • 1篇荧光
  • 1篇荧光定量
  • 1篇沙门氏菌
  • 1篇扩增内标
  • 1篇REAL_T...
  • 1篇DEVELO...
  • 1篇SEAFOO...

机构

  • 1篇上海交通大学

作者

  • 1篇李小玲
  • 1篇史贤明
  • 1篇周敏
  • 1篇施春雷
  • 1篇但现龙
  • 1篇刘斌
  • 1篇张利达

传媒

  • 1篇微生物学报
  • 1篇Protei...

年份

  • 1篇2012
  • 1篇2011
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
Development of a real time PCR assay for rapid detection of Vibrio parahaemolyticus from seafood被引量:2
2012年
A real time PCR assay for the detection of Vibrio para-haemolyticus in seafood samples was developed using a novel specific target and a competitive internal ampli-fication control(IAC).The specificity of this assay was evaluated using 390 bacterial strains including V.parahaemolyticus,and other strains belonging to Vibrio and non-Vibrio species.The real time PCR assay un-ambiguously distinguished V.parahaemolyticus with a detection sensitivity of 4.8 fg per PCR with purified genomic DNA or 1 CFU per reaction by counting V.parahaemolyticus colonies.The assays of avoiding interference demonstrated that,even in the presence of 2.1μg genomic DNA or 107 CFU background bacteria,V.parahaemolyticus could still be accurately detected.In addition,the IAC was used to indicate false-negative results,and lower than 94 copies of IAC per reaction had no influence on the detection limit.Ninety-six sea-food samples were tested,of which 58(60.4%)were positive,including 3 false negative results.Conse-quently,the real time PCR assay is effective for the rapid detection of V.parahaemotyticus contaminants in seafood.
Bin LiuXiaohua HeWanyi ChenShuijing YuChunlei ShiXiujuan ZhouJing ChenDapeng WangXianming Shi
关键词:SEAFOOD
添加有扩增内标的沙门氏菌荧光定量PCR检测体系的建立与评价被引量:16
2011年
【目的】建立添加有扩增内标(IAC,Internal amplification control)的沙门氏菌EvaGreen荧光定量PCR检测体系,提高PCR检测可靠性。【方法】通过比较已有沙门氏菌属细菌的基因组序列,筛选沙门氏菌属特异检测靶点,设计特异引物;再用复合引物法构建扩增内标,优化参数,建立沙门氏菌内标PCR检测体系,利用特异性和灵敏度实验评价体系的检测性能。【结果】筛选得到的新特异靶点基因编码III型分泌系统蛋白(ssaQ)。针对该基因设计特异引物(SsaQ6),建立了添加有扩增内标的常规PCR和EvaGreen荧光定量PCR检测体系;二者对151株沙门氏菌和34株非沙门氏菌的检测符合率均达100%,对基因组DNA的检测下限达14.9拷贝/PCR和2.76拷贝/PCR;人工污染牛奶样品(初始染菌量:4-6 cfu/10 mL),増菌10 h和8 h后分别可检出沙门氏菌。【结论】本研究发掘的新靶点基因ssaQ特异性强,基于这一新靶点建立的添加有扩增内标的EvaGreen荧光定量PCR比常规内标PCR的检测限更低,重复性更好,快速方便,在12 h内即可得出检测结果,并且定量准确,有利于推进沙门氏菌PCR检测方法的标准化应用。
但现龙刘斌李小玲张利达施春雷周敏史贤明
关键词:沙门氏菌扩增内标
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