国家自然科学基金(31000729)
- 作品数：9 被引量：22H指数：3
- 相关作者：汪保华朱新宇王为王长彪江鹏更多>>
- 相关机构：南通大学江苏沿海地区农业科学研究所山西省农业科学院棉花研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省高校自然科学研究项目国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 棉花水通道蛋白序列生物信息学初步分析被引量：2
- 2013年
- 水通道蛋白(aquaporin,AQP)是高效转运水分子的膜内在蛋白,在调控植物的水分关系中有重要作用,和抗旱性能紧密相关。为初步评价分析棉花AQP序列资源,对网上最新且仅有的52条棉花AQP序列进行分子聚类,同时将其进行多序列比对及亚细胞定位,结果表明:棉花AQP大致分为7类,具有丰富的多样性,AQP基因在跨膜转运以及光合中起重要作用。另外,来自水稻、大豆、玉米、拟南芥的328条AQP序列和52条棉花AQP序进行分子聚类,结果表明:有48条棉花AQP和大豆聚为一类,遗传距离较接近。
- 王为王长彪陈浩东刘方王春英张香娣王玉红王坤波
- 关键词：棉花水通道蛋白耐盐抗旱
- 百脉根NIN旁系同源蛋白的结构歧异和功能分化
- 2012年
- 目的:研究百脉根(Lotus japonicus)NIN转录因子和它的旁系同源蛋白的结构歧异和功能分化。方法:从百脉根基因组中获取完全的NIN旁系同源蛋白质序列,通过生物信息学手段进行系统发育、理化性质、功能位点和蛋白质三级结构同源建模分析。结果:总共获得5个NIN旁系同源蛋白序列,其中2个属于新鉴别的成员,它们分属于两个不同的进化分支;脯氨酸含量在LjNLP3中比次高的LjNLP1增加33%,提示其具有耐旱的功能特征;功能位点分析显示NIN旁系同源蛋白之间存在差异,提示它们可能通过翻译后修饰发生了功能分化;LjNIN蛋白在进化过程中用一段α螺旋替代了LjNLP1的一段β折叠,这一差异可能导致百脉根Nin招募为根瘤感受基因。结论:初步揭示了百脉根NIN旁系同源蛋白的结构歧异与功能分化的关系,为进一步的实验研究奠定了基础。
- 朱新宇汪保华陈曹逸
- 关键词：百脉根
- 棉花数量性状基因定位研究进展被引量：3
- 2011年
- 棉花的许多重要性状,包括产量、纤维品质、株型、抗病抗逆性、生理生化等都是数量性状,受遗传和环境因子的共同作用。近年来,随着分子生物学技术的进步,棉花基因组研究得到迅速发展,为棉花数量性状基因(quantitative trait locus,QTL)定位奠定了坚实的基础。概述了近十几年来棉花QTL定位研究及分子标记辅助选择的进展,结合研究实践指出了棉花QTL定位及标记辅助选择存在的问题,并对其发展方向做出了初步探讨。
- 王启会李怀芹朱新宇汪保华
- 关键词：棉花QTL定位标记辅助选择基因定位
- 超级矩阵构树方法研究进展被引量：1
- 2011年
- 在后基因组时代,系统发育重建领域面临许多新的挑战。新的方法正在开发以处理高通量技术产生的庞大而复杂的分子数据。系统发育大树是研究宏观进化和生物学问题的重要手段和基础,组合几百甚至几千个基因的超级矩阵是"大树"构建的主要方法之一。与通常的小规模矩阵相比,超级矩阵构树在每个步骤上都面临方法上的挑战,包括取样策略、数据库操作、多序列比对、构树计算和树信心评估等构树环节。文章围绕超级矩阵构树方法的进展、存在的问题和将来的发展进行了简要综述。
- 朱新宇汪保华
- 关键词：系统发育构树
- 棉花抗黄萎病分子育种的现状、问题与展望(英文)
- 2011年
- 黄萎病是棉花生产上的重要病害,极大地影响了棉花的生产。概述了棉花黄萎病病菌的分类及其致病机理,棉花黄萎病抗性的QTL定位及分子育种进展,探讨了黄萎病抗性育种存在的问题和发展方向,为今后棉花黄萎病育种研究提供参考。
- 汪保华高灵路王长彪
- 关键词：棉花黄萎病QTL分子育种
- 苏沿海盐碱地棉花种质材料耐盐性鉴定
- 2013年
- 在江苏沿海地区盐土农业示范基地（盐城点）盐碱地土壤上，于2012年对390份半野生棉材料进行耐盐性鉴定，结果表明：在土壤含盐浓度为中度（0．3％-0．5％）的情况下，试验总计1174个小区有549个小区出苗，三个重复间出苗一致性好的有50份材料，其中出苗一致性好且达到耐盐级别以上的有7份材料。
- 潘宗瑾潘群斌蔡立旺陈建平王为
- 关键词：棉花种质盐碱地耐盐性
- 盐胁迫下棉花基因组基于毛细管电泳的MSAP分析被引量：9
- 2014年
- 以棉花杂交种中棉所29为材料,用甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析法结合毛细管电泳检测技术进行甲基化鉴定,以初步探讨棉花耐盐的分子机理.应用24个引物组合,中棉所29在0.4%盐水胁迫及清水对照下,平均每引物组合检测甲基化位点数分别为69.2和56.7,差异达显著水平.盐胁迫下的DNA甲基化水平与清水对照下相比,52.6%位点表现出甲基化水平提高,即发生了超甲基化;19.7%位点甲基化水平降低,即表现为次甲基化;二者差异达极显著水平.研究结果表明,中棉所29盐胁迫后发生了广泛的DNA甲基化变化,包括超甲基化和次甲基化,以及其它甲基化类型的转变;发生超甲基化位点极显著地多于发生次甲基化位点.盐胁迫下的中棉所29与对照相比,DNA总体甲基化水平显著提高,暗示中棉所29有提高基因组甲基化水平以应对盐胁迫的潜在机制,棉花基因组整体甲基化水平的提高可能与棉花对盐胁迫的耐受性起重要作用.本研究中,甲基化序列的初步克隆及比对分析表明,盐胁迫前后多个ATP合成相关基因甲基化程度维持在同一水平,其表达不受甲基化影响,这也可能是中棉所29耐盐性较强,在一定时间盐处理后能维持正常生长的原因之一.
- 钱晓伟袁有禄荣平朱新宇刘亚泰江鹏刘尚汪保华
- 关键词：棉花甲基化敏感扩增多态性盐胁迫毛细管电泳
- 3个黄褐棉近等基因系的选择及评价被引量：4
- 2011年
- 为了发掘利用黄褐棉的优异基因并用以改良陆地棉纤维品质,通过陆地棉与黄褐棉种间杂交构建了一套回交高世代群体,通过标记辅助选择及纤维品质鉴定选出3个近等基因系。结果表明,所选的近等基因系遗传背景与陆地棉亲本基本相同,仅在少数几条染色体上具备黄褐棉渐渗片段,这些渐渗片段主要集中分布于1号、14号以及19号染色体。3个近等基因系的纤维强度表现突出,纤维细度优良,有望通过精细定位发现控制纤维强度及麦克隆值的QTL,同时这3个近等基因系可以作为种质资源供纤维强度和细度改良育种应用。
- 汪保华王为庄智敏朱新宇
- 关键词：近等基因系纤维强度纤维细度育种
- 根瘤感受样基因的进化:结构歧异与功能分化被引量：3
- 2013年
- 豆科植物百脉根(Lotus japonicus)的根瘤感受基因Nin与根瘤的早期发育有关。Nin的同源基因(Nin-like基因)功能上涉及氮代谢过程。从完成测序的豆科和非豆科植物基因组中获取Nin-like基因并进行系统发育分析。在此基础上,追踪基因和蛋白质结构的歧异式样,尝试建立结构歧异和功能分化的联系。通过比较,新的Nin-like基因被鉴别。系统发育分析不仅重现了以前分辨的直系同源群(分支I、II和III),且识别了它们之间的姐妹群关系。Nin-like基因的结构呈现多样性,支持系统发育分析的结果。水稻OsNLP5基因缺乏内含子,可能起源于基因返座事件。NIN-like蛋白结构域组织和功能位点在不同分支中存在差异,提示它们的功能发生了分化。根瘤固氮植物NIN-like蛋白的GAF结构域中存在一个显著变异区,三级建模分析显示这个变异区对应于百脉根非固氮NIN-like蛋白的一段保守构象,这一变异可能使豆科植物具有根瘤固氮能力。研究结果为阐明Nin-like基因的功能提供了新的研究思路。
- 朱新宇吕万胜余春梅汪保华
- 关键词：进化
