上海市科学技术发展基金(044909004)
- 作品数:9 被引量:32H指数:4
- 相关作者:高诚魏晓锋谢建云胡建华余琛琳更多>>
- 相关机构:上海市计划生育科学研究所第二军医大学扬州大学更多>>
- 发文基金:上海市科学技术发展基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- 微卫星DNA多态性在大鼠遗传监测中的应用研究被引量:3
- 2009年
- 目的选用有较好多态性的微卫星位点对6种品系大鼠DNA多态性进行分析,以期建立一种准确可靠、高效可行的遗传监测方法。方法选择大鼠不同染色体上的15个微卫星位点,应用PCR技术对6个品系大鼠进行了微卫星多态性分析。结果9个微卫星位点均具有稳定扩增效果,在同一品系不同个体之间表现为单态性;在不同品系之间表现多态性,可用于大鼠遗传监测。结论随着微卫星DNA多态性研究的不断深入,微卫星DNA可以取代生化标记分析法,广泛应用于大鼠的遗传监测中去。
- 魏晓锋谢建云胡建华高诚
- 关键词:微卫星DNA
- 微卫星标记在近交系及封闭群小鼠遗传质量检测中的初步应用被引量:9
- 2008年
- 利用建立的小鼠微卫星检测方法,对来源于2个单位的近交系 BALB/c 小鼠和封闭群 ICR 小鼠进行了遗传分析,结果发现 A 单位 BALB/c 小鼠发生了遗传污染,有部分小鼠在部分微卫星位点发生了变异,而 B 单位 BALB/c 小鼠在所有的检测位点上的结果都与预期的 BALB/c 小鼠位点一致;对 ICR 小鼠分析结果发现 A 单位 ICR 小鼠在22个位点的平均杂合度为0.379,平均多态信息量为0.308,属中度多态,B 单位 ICR 小鼠的平均杂合度为0.287,平均多态信息量为0.227,属低度多态。结果表明微卫星标记可用于检测近交系小鼠的遗传质量,也可用于分析封闭群小鼠的遗传多态性,为一种有潜力的实验动物遗传学检测标记。
- 谢建云冯洁胡建华周艳邵伟娟倪丽菊魏晓锋高诚
- 关键词:微卫星标记近交系小鼠遗传多态性
- 上海地区实验用免微卫星多态性分析
- 2009年
- 目的对上海地区的3个品系5个种群的家兔进行微卫星多态性分析。方法选择兔的13个微卫星位点,分析了上海地区3个品系家兔群体的遗传变异。结果新西兰兔、日本大耳兔、青紫兰兔3个品系(种)兔群体内的平均多态信息含量分别为0.3123、0.2012、0.1328;平均杂合度分别为0.4091、0.3472、0.2222;对三种群兔之间的遗传距离分析发现新西兰兔和日本大耳兔之间的遗传距离较低,青紫兰兔和其他两种兔的遗传距离较远。结论新西兰兔种群杂合度较高,青紫兰兔种群杂合度相对较低。
- 魏晓锋谢建云倪丽菊胡建华高诚
- 关键词:微卫星遗传多态性
- 近交系小鼠双色荧光正相杂交芯片技术体系的建立和优化
- 2008年
- 目的探讨采用单核苷酸多态性(SNP)检测方法-双色荧光正相杂交芯片技术对近交系小鼠遗传质量监测及相关影响因素。方法运用基于芯片的双色荧光正相杂交检测SNP技术,进行芯片杂交动力学研究,考察信号值(Cy3,Cy5)和ratio值(Cy5/Cy3)与PCR产物点样浓度、PCR产物长度和荧光标记探针长度之间的关系,研究PCR产物点样浓度、PCR产物长度和荧光标记探针长度对SNP分型的影响。结果采用正反标记实验后,Ratio值随着PCR产物点样浓度的增加呈稳定趋势;PCR双链产物长度对信号值影响比较大,点样时其长度不宜太长,最好不超过450 bp;随荧光标记探针长度的增加,基因分型能力明显下降,长度为15 bp最佳,长度超过20 bp时,已基本没有区分能力。结论PCR产物点样浓度、PCR产物长度和荧光标记探针长度是双色荧光正相杂交SNP分型系统的重要影响因素,采取适当的PCR产物点样浓度、PCR产物长度和荧光标记探针长度,并采用正反标记实验,可以取得稳定、准确的基因分型效果。为进一步进行近交系小鼠遗传质量监测的研究奠定基础。
- 瞿秀华阚广捍余琛琳汤球孙伟崔淑芳
- 关键词:单核苷酸多态性芯片小鼠
- 云南滇南小耳猪与广西巴马小型猪mtDNA D-Loop的初步研究被引量:2
- 2011年
- 目的研究封闭群滇南小耳猪与广西巴马小型猪线粒体DNA(mtDNA)的多态性,探索小型猪遗传监测的方法。方法用18种限制性内切酶对23头滇南小耳猪和21头广西巴马小型猪mtDNA D-loop的PCR产物进行RFLP分析。结果滇南小耳猪和广西巴马小型猪的mtDNA D—loop在品种内和品种间均表现出相同的酶切图谱,未见多态性。结论滇南小耳猪与广西巴马小型猪mtDNA D—loop的遗传多样性贫乏,mtDNA PCR—RFLP技术在其遗传监测中不具应用价值。
- 倪丽菊谢建云胡建华
- 关键词:广西巴马小型猪MTDNA多态性PCR-RFLP
- 野生和人工饲养洞庭湖种群东方田鼠血液及血清生化指标的测定被引量:1
- 2009年
- 目的比较野生和人工饲养洞庭湖种群东方田鼠血液及血清生化指标的差异。方法采用SYSMEX iPOCH血常规测定仪和HITACHI7020全自动生化分析仪对野生和人工饲养洞庭湖种群东方田鼠部分血液及血清生化指标进行测定和分析。结果两类东方田鼠部分血液指标和血清中与脂肪代谢相关的部分生化指标有显著差异,部分指标无明显差异,并无明显的变化规律。结论东方田鼠可作为潜在的脂肪肝动物模型。
- 魏晓锋谢建云胡建华高诚
- 关键词:东方田鼠血清生化
- 上海地区实验用兔线粒体DNA-RFLP分析被引量:4
- 2007年
- 提取3个品种实验用兔肝组织中的线粒体DNA,并用ApaI等21种限制性内切酶进行消化。分析上海地区实验用兔mtDNA的多态性。酶切产物经琼脂糖凝胶电泳检测,共检出8种不同的限制性单倍型,少数个体出现的差异,可能来源于几个位点发生偶然突变,但不同兔群的限制性无规律性。结果表明上海地区实验用兔群体mtDNA的遗传多样性贫乏,遗传结构单一,提示所研究的兔种可能有共同祖先,或人工饲养繁殖出现血缘杂交现象。
- 冯洁谢建云胡建华高诚
- 关键词:线粒体DNA
- 双色荧光杂交芯片在近交系小鼠遗传监测中的应用被引量:7
- 2008年
- 应用一种新的高通量SNP检测方法-双色荧光杂交芯片技术进行近交系小鼠遗传监测。应用双色荧光杂交芯片技术对4个品系近交系小鼠的多个基因组DNA样本进行SNP分型,整合6个SNP位点的芯片杂交信息,对样本所属品系进行判断。研究结果表明SNP检测方法-双色荧光杂交芯片技术能够对选定的6个SNP位点进行高准确率分型;双色荧光杂交芯片技术是一种高通量SNP检测的良好工具,适合于对少量近交系品系来源的大样本量小鼠进行遗传污染监测和品系鉴定,并具有扩大应用的潜力。
- 崔淑芳瞿秀华韩士忠余琛琳孙伟汤球
- 关键词:SNP小鼠
- 微卫星技术对近交系小鼠遗传质量的分析被引量:7
- 2007年
- 目的对14个品系近交系小鼠24个微卫星座位进行遗传分析,以期用微卫星位点分析法区分不同近交系小鼠。方法通过Mouse Genome Informatics数据库确定合适的微卫星位点和引物,对近交系小鼠基因组DNA进行扩增,分析不同品系小鼠在所选微卫星座位的基因片段,与数据库小鼠品系数据进行比较,并对14个品系近交小鼠进行了DNA多态性分析。结果24个微卫星位点在不同品系的小鼠之间具有多态性,不同品系小鼠之间的遗传距离为0.045~1.526;在不同的亚系之间也有具有多态性。结论微卫星标记方法能区分不同的近交小鼠品系、近交小鼠亚系,为小鼠遗传质量的检测提供了一个快捷简便的方法。
- 谢建云邵伟娟胡建华高诚
- 关键词:微卫星近交系小鼠