中国博士后科学基金(20110491124)
- 作品数:11 被引量:14H指数:2
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- 梅花鹿鹿茸组织PDGFA基因cDNA克隆及序列分析被引量:2
- 2017年
- 为了探讨PDGFA基因的结构和功能,采用RT-PCR方法获得梅花鹿PDGFA基因,并运用生物信息学软件对其序列进行了分析。结果表明:梅花鹿PDGFA基因开放阅读框大小为591 bp,共编码196个氨基酸,蛋白的分子质量约为22 ku,理论等电点(pI)为8.53,是亲水性蛋白,具有信号肽。二级结构分析显示,含有47.45%无规则卷曲、39.29%α-螺旋、13.27%扩展链。进化分析显示,PDGFA蛋白与白尾鹿(Odocoileus virginianus texanus)、家牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)、野猪(Sus scrofa)、白犀牛(Ceratotherium simum)、小鼠(Mus musculus)、密西西比鳄(Alligator mississippiensis)、原鸡(Gallus gallus)、绒啄木鸟(Picoides pubescens)的蛋白质序列相似度分别为98%、97%、96%、94%、93%、89%、81%、79%、78%。
- 梁运涛卢斌山张强高悦禹夏彦玲
- 关键词:梅花鹿克隆进化分析
- 梅花鹿鹿茸组织Anxa-1基因cDNA克隆及表达被引量:3
- 2015年
- 从梅花鹿(Cervus nippon)鹿茸间充质中成功克隆出包括膜联蛋白A1(Anxa-1)基因全部编码区的c DNA序列,并结合生物学信息方法及实时荧光定量技术对该基因的氨基酸序列及不同生长时期的表达情况进行了分析。结果表明:Anxa-1基因编码346个氨基酸。经生物学信息分析,该基因编码蛋白为稳定蛋白,不具备信号肽,相对分子质量为38 830.4,理论等电点为6.17,一级结构中亮氨酸占最大比例(10.4%)。同源序列比对及系统进化树分析表明,梅花鹿Anxa-1氨基酸序列与藏羚羊(Pantholops hodgsonii)、绵羊(Ovis aries)、山羊(Capra hircus)和水牛(Bubalus bubalis)相似性较高。实时荧光定量RT-PCR分析表明,Anxa-1基因在不同生长时期鹿茸顶端间充质表达存在差异,生长前期的表达量高于中期与后期。
- 曲昊淼丁玲赵姬臣夏彦玲
- 关键词:膜联蛋白A1实时荧光定量RT-PCR
- 鹿茸不同生长期MALAT1基因的差异表达被引量:1
- 2015年
- 以不同生长期的鹿茸尖端组织为材料,采用mRNA差异显示技术检测不同生长期鹿茸尖端间充质组织的差异表达基因。对其中一条差异表达片段进行克隆测序分析,得到400 bp左右的片段,与野猪的非编码基因MALAT1有高度同源性,同源性为90%。进一步实时荧光定量RT-PCR鉴定发现,该基因在鹿茸生长发育的前期和中期表达量高于后期,该基因在鹿茸快速生长期的上调表达暗示其在鹿茸生长发育过程中发挥作用,是鹿茸生长发育相关基因的候选基因。
- 夏彦玲桂姗姗喻月婷敖艳霖曲昊淼
- 关键词:鹿茸MRNA差异显示差异表达基因实时荧光定量RT-PCR
- 梅花鹿SNX10基因cDNA克隆与序列分析
- 2019年
- 为了获得梅花鹿SNX10基因编码区cDNA序列,试验提取了梅花鹿鹿茸尖端组织总RNA,设计上下游引物,利用PCR技术扩增SNX10基因,对扩增的基因进行氨基酸序列分析并构建系统进化树。结果表明:扩增获得的序列为854 bp,其中包括606 bp开放阅读框(ORF),编码201个氨基酸;SNX10蛋白为疏水性蛋白质且存在信号肽和跨膜结构,由α-螺旋、扩展链、无规则卷曲组成,蛋白亚细胞定位预测为细胞质。梅花鹿鹿茸SNX10蛋白氨基酸序列与白尾鹿的同源性极高,为99%。梅花鹿与白尾鹿的亲缘关系最近,与野猪、牛的亲缘关系较近,与人、白鳍豚、裸鼹鼠、黑猩猩、赤狐、刺猬的亲缘关系较远。
- 刘娜张浩波王皓珺高悦禹李和平夏彦玲
- 关键词:梅花鹿鹿茸CDNA克隆PCR技术
- 鹿眠宝、鹿醒宝3号在鹿人工授精实践中应用效果观察被引量:1
- 2017年
- 目前我国人工饲养的茸鹿主要是梅花鹿和马鹿,传统的自然本交方法使得鹿茸单产量较低且上升缓慢,人工授精技术的引进对于提高后代鹿茸产量、发挥优秀种公鹿作用等均有诸多利好.我国养鹿业在近几十年迅猛发展,期间开展了多项茸鹿种间以及亚种间的人工授精杂交组合试验,大幅提高了茸鹿的生产性能,同时也为养殖户带来了较高的经济效益.实践证明,推行茸鹿人工授精技术是养鹿产业迅速发展的重要措施之一.
- 卢斌山梁运涛张宇夏彦玲
- 关键词:人工授精技术鹿眠宝鹿茸产量人工饲养
- 梅花鹿PTN基因cDNA克隆及表达分析被引量:1
- 2019年
- 为了探究多效生长因子(PTN)基因在鹿茸生长发育中的调控作用,试验采用分子克隆技术得到包括PTN基因全部编码区的cDNA序列,并结合生物信息学方法、实时荧光定量PCR技术对其进行分析。结果表明:获得的PTN基因cDNA序列长度为750 bp,共编码168个氨基酸;PTN蛋白分子质量为18.93 ku,理论等电点为9.66,是信号肽介导的一种亲水性蛋白质;其二级结构以无规则卷曲为主,其次是α-螺旋和β-折叠,分别占47.62%、32.74%和19.64%;梅花鹿PTN基因在进化上较为保守,与白尾鹿、野猪、牛等偶蹄目动物亲缘关系较近,与斑纹海豚、豚鼠、人亲缘关系较远;实时荧光定量PCR分析显示,PTN基因在不同生长时期的鹿茸顶端间充质组织中表达差异显著,表达量在生长中期明显高于前期和后期。
- 崔薇陈楠苗震李和平刘伟石夏彦玲
- 关键词:梅花鹿PTN鹿茸实时荧光定量
- 东北狍PTN基因cDNA克隆及表达分析被引量:1
- 2019年
- 采用RT-PCR方法、分子克隆技术成功获得东北狍(Capreolus pygargus)PTN(pleiotrophin)基因cDNA序列。结果表明:获得的PTN基因cDNA序列长750 bp,共编码167个氨基酸,PTN蛋白分子质量为18.9 ku,理论等电点(pI)为9.66,是信号肽介导的一种亲水性蛋白质,其二级结构以无规则卷曲为主,其次是α-螺旋和β-折叠,分别占46.71%、32.34%和20.96%;生物信息分析发现,东北狍PTN基因在进化上较为保守,与其他物种同源性均>89%;构建的进化树表明,东北狍PTN基因与野牦牛、绵羊、野猪等偶蹄目动物亲缘关系较近,这一结果符合经典分类学规律;实时荧光定量RT-PCR分析显示,PTN基因在狍茸顶端组织不同生长层表达量存在显著差异,其中前软骨和间充质组织层的表达量明显高于皮肤和软骨组织层。
- 卢斌山王强辉张强高悦禹夏彦玲
- 关键词:分子克隆生物信息分析
- 咖啡因对马鹿精子体外获能作用的研究被引量:2
- 2013年
- 为研究不同浓度咖啡因对马鹿精子体外获能的作用,取健康马鹿冻精,分别以0、1.0、2.5、5.0、10.0 mmol/L咖啡因处理液作用精子,在孵育0、15、30、60、120、240 min的各个时间点取样,观察精子活力,并用考马斯亮蓝染色法检测各组精子的顶体反应(AR)。结果表明:咖啡因浓度为5.0 mmol/L时精子活力最高(80.19±0.52%),马鹿精子顶体反应率最高(61.94±1.50%),与对照组相比差异极显著(P<0.01),咖啡因作用30 min时各组的顶体反应率达到最高值。
- 丁玲夏彦玲
- 关键词:咖啡因精子获能
- 狍鹿ANXA-2基因编码序列的克隆及序列分析
- 2016年
- 首次从狍鹿鹿茸组织中成功克隆出包含膜联蛋白A2(ANXA-2)基因全部编码区的c DNA序列。通过生物信息学软件分析表明,该基因的开放阅读框共包含1 020个碱基,编码339个氨基酸,编码蛋白质的相对分子质量为38 612.09,理论等电点为7.224。蛋白保守区预测表明,该基因的蛋白保守区共有4个Annexin结构域。同源比对表明:ANXA-2基因与梅花鹿、马鹿、牛的CDS区的同源性分别为98%、98%和96%。用Mega5.0软件进行物种间遗传距离计算,结果表明该基因与蟾、原鸡的遗传距离最远,与梅花鹿、牛、羊的遗传距离最近。
- 赵姬臣梁运涛卢斌山夏彦玲
- 关键词:膜联蛋白A2CDNA克隆生物信息学分析
- 东北狍PDGFA基因cDNA克隆及表达分析被引量:2
- 2018年
- 为了研究血小板衍生生长因子A(PDGFA)基因在狍茸生长发育中的调控作用,试验采用分子克隆技术得到PDGFA基因全部编码区的cDNA序列并结合生物信息学方法进行分析。结果表明:获得的东北狍PDGFA基因cDNA长度为653 bp,其中包括594 bp的开放阅读框(ORF),编码197个氨基酸。PDGFA基因编码蛋白为不稳定蛋白,相对分子质量为22 259.65,等电点为8.53,具备信号肽,属于分泌性蛋白。蛋白质二级结构由α-螺旋、扩展链及无规则卷曲结构组成。通过构建系统进化树发现,狍与白尾鹿亲缘关系最近,与野牦牛、水牛、野猪、绵羊的亲缘关系较近,与原鸡、人、褐家鼠、斑马鱼的亲缘关系较远。实时荧光定量PCR分析显示,PDGFA基因在狍茸顶端组织不同组织层表达存在差异,其中前软骨层和软骨层的相对表达量显著高于皮肤层和间充质层(P〈0.05)。
- 崔薇苗震张强高悦禹夏彦玲
- 关键词:克隆生物信息学分析实时荧光定量PCR