中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(ZD2013005)
- 作品数：4 被引量：14H指数：2
- 相关作者：徐凌飞翟锐周鹏仇宗浩王志刚更多>>
- 相关机构：西北农林科技大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶的克隆与分析被引量：6
- 2014年
- 【目的】从早酥梨及其红色芽变基因组中克隆Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列,分析其特点和差异。【方法】根据Ty1-copia反转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物,建立并优化PCR扩增体系,回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结果】成功从早酥梨基因组和红色芽变材料中分别获得29,30条逆转录酶序列,序列大小均为260bp左右。生物信息学分析表明,与早酥梨相比,红色芽变的逆转录酶序列多发生终止子突变、缺失突变、替换突变。聚类分析可将所得序列分为7个家族,基于逆转录酶序列进行的不同物种进化树分析显示,第7家族序列与苹果和李具有很高的同源性,可能是反转录转座子横向传递的结果。【结论】早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列具有普遍性、异质性等特点,虽均已不具备转录活性,但红色芽变的逆转录酶序列突变程度更高。
- 周鹏仇宗浩翟锐梁东徐凌飞
- 关键词：逆转录酶进化分析
- 两个品种绿皮梨及其红色芽变品种光合生理特性的比较被引量：2
- 2013年
- 以"早酥"梨、"巴梨"与其红色芽变"红早酥"梨、"红巴梨"为试材,在田间条件下,比较研究了4个梨品种功能叶片的光合生理特性的差异和叶片色素含量的变化。结果表明:4个梨品种净光合速率(Pn)日变化曲线呈单峰型,且日变化平均值大小依次为:"早酥"梨>"红早酥"梨>"红巴梨">"巴梨";4个梨品种蒸腾速率(Tr)日变化曲线呈单峰型;"早酥"与"红早酥"梨气孔导度(Gs)日变化曲线呈双峰型,"巴梨"与"红巴梨"为单峰型;"早酥"与"红早酥"梨胞间CO2浓度(Ci)日变化曲线呈双谷型,"巴梨"与"红巴梨"为单谷型;瞬时水分利用效率(WUE)和光能利用效率(LUE)日变化曲线均呈单谷型。红色芽变的"红早酥"梨与"红巴梨"叶片中叶绿素、花色素苷含量均显著高于其对应的"早酥"梨与"巴梨"。
- 董晓勤周鹏仇宗浩翟锐徐凌飞
- 关键词：光合作用光合色素花青苷
- 梨Ty1-copia反转录转座子的克隆及IRAP分子标记体系的建立被引量：5
- 2016年
- 【目的】从早酥梨及其红皮芽变基因组中分离Ty1-copia反转录转座子全长序列,分析序列特点,并基于其中长末端重复序列(LTR)建立IRAP分子标记体系。【方法】以早酥梨及其红皮芽变和极早熟芽变植株叶片为试材,根据已知的Ty1-copia反转录转座子保守区域设计引物,利用同源克隆技术得到目的基因。根据基因两端LTR序列设计引物,建立IRAP分子标记体系,并对早酥梨及其芽变进行遗传分析。【结果】从早酥梨基因组中获得2条Ty1-copia反转录转座子全长序列,分别命名为PbTYZS1和PbTYZS2,长度分别是9 363和9 632bp。从红色芽变基因组中获得1条序列,命名为PbTYRM1,长度为9 652bp。经结构分析,获得的3条序列都是典型的Ty1-copia反转录转座子,但其开放阅读框(ORF)的完整性发生了变化。利用反转录转座子LTR保守区域设计引物成功建立了IRAP分子标记体系,早酥梨与红皮芽变的平均遗传距离为0.104,与极早熟芽变的遗传距离为0.115,并且早酥梨与极早熟芽变的多态性为20.41%,较之与红皮芽变的多态性(18.89%)更为丰富。【结论】早酥梨及其红皮芽变基因组中都含有完整结构的Ty1-copia反转录转座子,建立的IRAP分子标记体系可以得到清晰稳定的多态性指纹图谱。
- 周鹏张士伟翟锐王志刚徐凌飞
- 关键词：芽变反转录转座子进化分析IRAP
- ‘红早酥’梨花青苷合成相关基因的克隆及表达分析被引量：2
- 2015年
- 以‘早酥’梨(Pyrus bretschneideri Rehd.)及其红色芽变‘红早酥’梨为试材,采用同源克隆方法,分别从这2种材料的果皮中,得到花青苷生物合成途径中3个关键结构基因PbCHS、PbDFR、PbUFGT和2个调控基因PbbHLH、PbMYB10的cDNA编码区序列。生物进化树分析表明,这5个花青苷合成相关基因序列与其他植物均具有较高的同源性。通过荧光定量PCR,研究花青苷合成基因在不同幼嫩组织器官中的表达情况。结果表明,大部分基因在‘红早酥’梨的幼叶、叶柄、花瓣、幼果、花梗中的表达量均高于‘早酥’梨,其中PbUFGT和PbMYB10在二者中的表达差异尤为显著。
- 冯文亭翟锐王志刚朱春琴徐凌飞
- 关键词：早酥梨
