黑龙江省科技攻关计划(GC06C424)
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
- 相关作者：李冀宏陈淑红张静陈露菲王开利更多>>
- 相关机构：黑龙江省疾病预防控制中心中国农业科学院哈尔滨兽医研究所东北林业大学更多>>
- 发文基金：黑龙江省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 褐家鼠汉坦病毒黑龙江SC106分离株S基因特征分析被引量：6
- 2010年
- 为研究家鼠型(SEO)汉坦病毒(HV)黑龙江分离株的分子特征,本研究对黑龙江省SEO型新分离株SC106的S基因进行了扩增和序列分析。结果表明:SC106株S基因全长由1775nt组成,编码的蛋白长429aa,符合SEO型编码。与HV参考毒株进行比较,SC106与SEO型同源性最高,与姬鼠型(HTN)相对较低,与其它型别同源性更低。N蛋白进化树分析表明,SC106位于SEO型病毒所在支系,与河南株R22,黑龙江株Pf26和北京株BjHD01亲缘关系接近,体现了一定的宿主依赖性和地理簇集性。序列分析表明:SC106与黑龙江省首个SEO型分离株Pf26均为SEO型中的S1亚型,它们的S基因核苷酸序列同源性也最高(99.2%),并且SC106的S基因编码的N蛋白氨基酸序列也比较保守,由此证实,HV的进化与时间关系不大。
- 陈淑红彭永刚陈露菲刘娣刘娣刘彦成杨明王开利张静
- 关键词：褐家鼠汉坦病毒S基因
- 黑龙江省大林姬鼠中汉坦病毒的分离及其S基因序列分析被引量：6
- 2012年
- 为了研究黑龙江省大林姬鼠携带汉坦病毒(HV)的分子特征,对黑龙江省大林姬鼠分离株NA33的S基因进行了扩增和序列分析。结果表明,NA33株S基因全长由1 693nt组成,TA含量丰富,编码N蛋白的ORF起始于37nt,终止于1 326nt,编码的蛋白长429aa,符合HTN型编码。与HV参考毒株进行比较,NA33与Amur类汉坦病毒同源性最高,与其它HTN型相对较低,与SEO等同源性更低。N蛋白进化树分析表明,NA33位于Amur类病毒所在支系,并且与俄罗斯远东和吉林大林姬鼠分离株亲缘关系更接近,体现了一定的宿主依赖性和地理簇集性。序列分析发现,NA33的N蛋白具有Amur类汉坦病毒保守的氨基酸位点。黑龙江省大林姬鼠携带Amur类汉坦病毒,是重要的传染源。
- 陈露菲陈淑红王开利张静李冀宏
- 关键词：大林姬鼠汉坦病毒S基因
