黑龙江省普通高等学校青年学术骨干支持计划(1152G007)
- 作品数：10 被引量：69H指数：5
- 相关作者：陈庆山胡国华刘春燕齐照明孙亚男更多>>
- 相关机构：东北农业大学黑龙江省农垦科研育种中心国家大豆工程技术研究中心更多>>
- 发文基金：黑龙江省普通高等学校青年学术骨干支持计划国家高技术研究发展计划黑龙江省博士后科研启动基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术环境科学与工程更多>>
- 大豆株高QTL的定位与整合分析被引量：8
- 2010年
- 株高是影响大豆产量的主要性状之一,本研究利用Charleston×东农594重组自交系构建的SSR遗传图谱,采用WinQTLCartographer Ver.2.5软件的CIM和MIM分析方法对2006-2008年连续3年的大豆株高数据进行QTL定位,检测到了15个控制株高的QTLs,分别位于LGB1、LGD1a和LGG等。另外,利用BioMercator2.1的映射功能将国内外常用的大豆图谱上的株高QTLs通过公共标记映射整合到大豆公共遗传连锁图谱soymap2上,将搜集到78个株高QTLs和本研究得到QTLs进行整合分析,最终得到12个大豆株高的"通用"QTL,分别位于LGB1、LGC2、LGD1a、LGF、LGG、LGK和LGM,其置信区间最小可达到0.24cM,为今后对大豆株高QTL精细定位,提供有利指导。
- 孙亚男齐照明单大鹏刘春燕胡国华陈庆山
- 关键词：大豆株高QTL定位
- 大豆叶片的特征提取方法研究被引量：4
- 2010年
- 综合考虑了叶片的轮廓和叶脉信息,给出了一种新的确定叶片中轴的方法,并依此方法重新定义了描述叶片的各个重要特征。通过实例分析表明,新特征使得大豆叶片的识别准确高效,也证实了新的叶片中轴的确定方法是行之有效的。这一方法的提出为图像识别技术在植物叶片识别诊断中的进一步应用提供了借鉴。
- 朱荣胜陈庆山杨佳吴贝贝吴绪霞李荟孟军
- 关键词：特征提取叶脉
- 大豆复杂性状候选位点的效应分析
- 2010年
- 借助Bootstrap的思想,设计了一种复杂性状候选位点的筛选方法-随机抽样评判法。采用多次抽样的方式,对抽样获得的子集逐个进行分析,并对获得的结果进行综合评价,最终确定因子的贡献率。通过对实际数据的分析表明,该方法有效地降低了因数据和方法的不同给分析结果带来的影响。
- 朱荣胜陈庆山胡振邦胡国华
- 关键词：综合评价
- 利用EST数据克隆大豆天冬氨酸代谢途径关键酶基因被引量：5
- 2009年
- 电子克隆(in silico cloning)是随着基因组计划和EST计划实施而发展起来的利用生物信息学手段进行基因克隆的新方法。本研究根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学方法以不同物种的基因序列为信息探针,运用Blast软件与所下载的大豆EST数据库进行比对拼接,获得基因全长cDNA序列。首次克隆了大豆天冬氨酸代谢途径上AHRI、AHAS、ASADH、BCAT、CBL、DAPD、DAPE、DHDPR、DHAD、HK和TD等11个关键酶基因的cDNA序列。其中AHRI、DAPD、DAPE、DHDPR和DHAD基因经RT-PCR克隆和序列分析验证,长度分别为1764bp、1467bp、1080bp、1035bp和1806bp,结果与电子克隆序列基本一致。本实验通过与不同物种的这些基因蛋白序列比较,发现与双子叶植物拟南芥、蓖麻和马铃薯的同源性较高,而与单子叶植物水稻的同源性略低。
- 于妍姜威唐敬仙刘春燕刘迎雪陈立君陈庆山胡国华
- 关键词：大豆天冬氨酸酶基因EST数据库
- 大豆生育期降水量与油分含量的相关分析被引量：2
- 2011年
- 试验采用27个大豆品种,结合大豆生育期每月降水量,采用随机区组设计,研究了降水量对大豆籽粒油分含量的影响和不同类型品种油分含量与降水量的关系。结果表明,除8月份外,大豆品种油分含量与生育期各月份降水量都达到5%显著水平以上的负相关。6月份和7月份的降水对大豆油分含量形成起到了重要作用。此外,7月份降水对高油大豆品种油分形成起关键作用,而9月份降水对高蛋白和中间类型大豆品种油分形成更重要。
- 陈庆山裴宇峰蒋洪蔚刘业丽何琳栾怀海刘春燕韩雪胡国华
- 关键词：大豆生育期降水量油分含量
- 基于Meta分析的大豆倒伏性相关QTL的整合被引量：7
- 2010年
- 倒伏性是大豆高产、稳产和优质的主要限制因子之一,是控制大豆产量性状的主要数量性状。本研究共搜集整理了16年来已经报道的与大豆倒伏性有关的59个QTL,以2004年发布的大豆公共遗传连锁图谱soymap2为参考图谱,通过软件BioMercator2.1的映射,将大豆倒伏性QTL整合到soymap2上,并利用Meta进行元分析进而推断QTL位置,计算提取真正有效的QTL位点,共得到11个与大豆倒伏性相关的真实主效QTL位点,分布于5个连锁群上。本研究结果为倒伏性相关基因的精细定位和克隆奠定了基础。
- 张丽伟齐照明刘春燕胡国华陈庆山
- 关键词：大豆倒伏性QTLMETA分析
- 基于Meta分析的大豆百粒重的QTLs定位被引量：21
- 2009年
- 【目的】百粒重是控制大豆产量性状的主要数量性状,对大豆产量性状进行基因定位具有重要的研究和应用价值。现有百粒重QTL定位结果分散,需选择合适的公共图谱,整合前人的研究结果,使其真正应用到实践中。【方法】以2004年发布大豆公共遗传连锁图谱soymap2为参考图谱,将近20年不同试验中的大豆百粒重的QTLs进行映射整合,构建百粒重QTL综合图谱。利用BioMercator2.1的映射功能将国内外常用的大豆图谱上的百粒重QTLs通过公共标记映射整合到大豆公共遗传连锁图谱soymap2上,并利用Meta分析,通过对比已经报道的QTLs的95%的置信区间来推断QTL位置,从而提取真正有效的QTL标记。【结果】在已经发表的文献中共找到65个百粒重QTLs定位信息,其中有53个QTLs定位区间与公共图谱有共有标记,包括36个增效效应的QTLs和17个减效效应的百粒重QTLs,共得到12个QTL簇,通过Meta分析,发掘出6个增效效应和6个减效效应的百粒重"通用QTLs"及其连锁标记。【结论】本研究得到的"通用QTLs"其置信区间最小可达到1.52cM,为辅助选择分子标记、QTL精细定位以及数量性状基因的克隆奠定基础。
- 齐照明孙亚男陈立君郭强刘春燕胡国华陈庆山
- 关键词：大豆百粒重META分析MAS
- 基于一种新测度的基因型分类方法研究被引量：1
- 2010年
- 提出一种了针对基因型数据的测度,重新设计了聚类分析,并根据新的聚类方法对真实数据进行分析。结果表明,基因型向量相似的个体倾向于表型值相近。这一测度的提出和结论的形成将为G-P模型的构建提供新的思路。
- 朱荣胜陈庆山胡振帮胡国华
- 关键词：分子辅助选择聚类
- 基于元分析的大豆生育期QTL的整合被引量：18
- 2009年
- 共搜集整理了12年来已经报道的与大豆生育期有关的98个QTL,通过BioMercator2.1和公共标记映射整合到大豆公共遗传连锁图谱soymap2上,并利用元分析技术推断QTL位置,计算提取真正有效的QTL。发掘出大豆两个重要生育时期,共9个"真实QTL"及其连锁标记,其中与开花期(R1)相关的有7个,与成熟期(R8)相关的有2个,建立了QTL的一致性图谱,其中L连锁群上的一个定位区间包含一个已发表的有关R1的基因。在5个连锁群上共发现10个控制多个生育时期的QTL。本研究结果为大豆生育期QTL精细定位和基因克隆奠定了基础。
- 吴琼齐照明刘春燕胡国华陈庆山
- 关键词：大豆生育期
- 大豆叶片性状QTL的定位及Meta分析被引量：13
- 2012年
- 利用Charleston×东农594重组自交系构建SSR遗传图谱,采用WinQTLCartographer Ver.2.5软件的CIM和MIM分析方法对2006—2010年(F2:14～F2:18)连续5年的大豆叶长、叶宽以及叶柄长数据进行QTL定位。检测到8个与叶长有关的QTL,位于染色体Gm01、02、05、11和18上;9个与叶宽有关的QTL,位于染色体Gm01、03、05、06、11、12和16上;8个与有关叶柄长的QTL,位于染色体Gm01、03、05、06、11、17和18上。2年以上均检测到的叶长QTL为qLL5a、qLL5b、qLL1a和qLL18;叶宽QTL为qLW5a、qLW11a、qLW11b和qLW12;叶柄长QTL为qLSL11b。另外,利用BioMercator2.1的映射功能将国内外常用的大豆图谱上的叶长、叶宽QTL通过公共标记映射整合到大豆公共遗传连锁图谱Soymap2上,将搜集到的35个叶长QTL、37个叶宽QTL和本研究得到的QTL整合分析,最终得到5个大豆叶长的"通用"QTL,位于Gm09、18和19,其置信区间最小可达5.66cM;4个大豆叶宽的"通用"QTL,位于Gm07、Gm18和Gm19上,其置信区间最小可达5.67cM,为今后对大豆叶片性状QTL精细定位提供了信息。
- 仕相林孙亚男王家麟刘春燕陈庆山胡国华
- 关键词：大豆叶片性状QTL定位
