重庆市科技创新能力建设计划项目(CSTC-2009CA1005)
- 作品数:2 被引量:32H指数:2
- 相关作者:韩国辉林清龙治坚梁国鲁向素琼更多>>
- 相关机构:重庆市农业科学院西南大学涪陵区农业科学研究所更多>>
- 发文基金:重庆市科技创新能力建设计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 芥菜SCoT分析体系的建立与优化被引量:13
- 2013年
- 采用L25(56)正交设计方法,对影响芥菜SCoT-PCR反应的Mg2+,dNTPs,Taq酶,引物,模板DNA等因素的浓度进行优化,建立了适用于芥菜研究的SCoT-PCR最佳反应体系:20μL反应体系中,含有Mg2+1.875mmol/L,dNTPs 0.35mmol/L,Taq酶2.00U,Primer 0.875μmol/L,模板DNA 10ng.利用芥菜的16个品种对该反应体系进行验证,得到了条带清晰、亮度适中、稳定可靠的电泳图.
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- 关键词:芥菜正交设计
- 基于SCoT标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱被引量:22
- 2013年
- 利用SCoT标记对46份芥菜种质资源进行遗传多样性分析。从70条引物中筛选出21条用于PCR扩增,共扩增出200条条带,其中多态性条带140条,多态性比率为70%。供试材料相似系数介于0.77~0.95之间,平均Nei’s基因多样性为0.198,平均Shannon信息指数为0.301,平均多态信息含量为0.8227。利用UPGMA构建46份芥菜种质资源的聚类树状图,在相似系数D1=0.780处,可以将46份芥菜种质分为两大类;而在D2=0.807处,第Ⅱ类可进一步细分为5个亚类。选出清晰的16个多态性位点,构建46份芥菜种质的SCoT指纹图谱,结果由引物SP4、SP19、SP20、SP23、SP30所构建的DNA指纹图谱可将供试材料完全区分开。
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- 关键词:芥菜指纹图谱