福建省自然科学基金(2012J05114)
- 作品数：3 被引量：6H指数：1
- 相关作者：叶福玲郭红陈勃季平更多>>
- 相关机构：福州大学香港理工大学更多>>
- 发文基金：福建省自然科学基金福建省科技创新平台建设项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 一种基于混沌游走表示法的种系发生树构建
- 2012年
- 针对生物信息学领域中种系发生树构建这一重要课题的需要,利用DNA碱基序列的频度混沌游走表示法,提出一种碱基序列自重复性的度量和一种序列间相关性的度量,并由此出发,提出了一种新的以此种相关性为依据的聚类方法。利用这样的方法,通过GenBank中获取的线粒体DNA数据构建了一棵包含20个物种的种系发生树。实验结果验证了新提出的度量方法以及聚类方法在种系发生树构建问题上的有效性。此外,由于这种方法使用碱基序列的图形表示法,而非传统的串形表示法,避免了建树过程中序列间联配的步骤。
- 陈勃季平
- 关键词：聚类生物信息学
- 基于小波矩和叶形特征的叶片识别被引量：5
- 2014年
- 植物的叶片是识别植物种类的一个重要属性,文章提出一种基于植物叶片形状的图像内容识别方法。首先对叶片图像进行归一化处理,然后提取叶片的小波矩特征、叶片的周长、面积及伸长度,最后根据这些特征进行支持向量机(SVM)训练和分类,识别出植物的种类。该方法得到的识别率达到95%。
- 叶福玲
- 关键词：图像处理小波矩支持向量机
- 以位置特异性得分矩阵和基因本体为特征的蛋白质亚细胞定位预测被引量：1
- 2017年
- 提出一种蛋白质亚细胞定位预测方法.该方法以位置特异性得分矩阵和基因本体抽取对应特征,结合支持向量机构建多标签分类模型.充分考虑了蛋白质进化信息对其亚细胞定位的影响,并基于文本分类中涉及到的卡方检验的对数变换思想,构建基因本体注释信息的加权系数对其进行加权处理,从而提高预测的准确率.采用支持向量机作为基分类器构建多标签分类模型,进一步提高预测的准确率.通过在目前该领域两个常用的真实数据集上进行的一系列测试结果表明,该方法能有效提高蛋白质亚细胞定位预测的准确率.
- 刘冰静郭红
- 关键词：基因本体
