国家自然科学基金(30972639)
- 作品数：24 被引量：139H指数：9
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- 结核分枝杆菌CarD蛋白结构与功能的生物信息学分析被引量：12
- 2017年
- 目的应用生物学信息分析软件预测结核分枝杆菌CarD蛋白的结构和功能。方法运用NCBI中Blast工具,将结核分枝杆菌H37Rv carD基因序列与GenBank中相似序列进行核苷酸比对;利用MEGA 6.06软件,采用邻位相连法构建N-J进化树;运用ClustalX 2.1软件,将结核分枝杆菌H37Rv CarD及与其同源性较高的分枝杆菌CarD氨基酸序列进行多重比对分析;登录ExPASy网站,运用ProtParam工具分析CarD蛋白的理化性质,运用ProtScale进行蛋白质疏水性分析,运用SignalP 4.1Server预测蛋白质信号肽,运用TMHMM Server v.2.0以及TMPred预测蛋白质跨膜螺旋区,运用SOPMA预测蛋白质二级结构,运用SWISS-MODEL进行蛋白质三级结构同源建模;运用NetPhos 3.1Server预测蛋白质磷酸化位点;运用NCBI中CDD工具预测CarD蛋白保守结构域。结果分枝杆菌carD基因序列相似度为100%,进化关系较近。H37Rv与田鼠分枝杆菌起源于同一物种,同源性较高。CarD分子在进化过程中高度保守,为稳定、亲水性蛋白,无跨膜区、无信号肽,蛋白序列中存在4个丝氨酸磷酸化位点,二级结构中以α-螺旋为主,三级结构同源建模成功。CarD蛋白是一种结合RNA聚合酶的转录调控因子,属于CarD/CdnL/TRCF家族。结论 CarD蛋白为RNA聚合酶结合蛋白,调控转录和控制结核分枝杆菌的生长。该蛋白序列保守稳定,是治疗结核病潜在的新靶标。
- 张德峰付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌CARD生物信息学分析
- 巨噬细胞内microRNA与结核分枝杆菌相互作用的研究进展被引量：6
- 2017年
- 结核分枝杆菌(MTB)为结核病的病原菌,感染机体后主要寄生于巨噬细胞内。MiRNA是一类内源性非编码小分子RNA,在转录水平上负向调控基因的表达。miRNA在MTB感染机体后部分可稳定存在于巨噬细胞内,miR-125a,miR-144,miR-146a,miR-155等表现出明显的上调或下调的变化。本文就巨噬细胞内miRNA与MTB相互作用的研究进展作一综述。
- 袁秋露付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌MIRNA巨噬细胞MIR-155
- 结核分枝杆菌PKnG蛋白结构与功能的生物信息学分析被引量：6
- 2018年
- 目的运用生物信息学的方法分析结核分枝杆菌PKnG蛋白的结构与功能。方法从NCBI数据库获取PKnG的基因信息;使用protParam工具分析PKnG基因编码蛋白的理化性质,运用ProtScale工具分析其疏水性;运用SOPMA工具预测其二级结构,运用SWISS-MODEL工具模拟其三级结构;运用NCBI网站上的BLAST工具对PKnG蛋白的保守域进行预测,运用NetPhos 3.1Server预测其磷酸化位点;运用ABCperd服务器以及SYFPEITHI程序分别预测PKnG蛋白的B细胞和T细胞抗原表位;运用SignalP 4.1Server预测其信号肽,运用TMHMM2.0和TMpred Server对其跨膜螺旋区进行预测;运用STRING 10.5程序对其相互作用蛋白进行预测。结果预测PKnG基因编码蛋白由750个氨基酸构成,理论等电点5.52,为不稳定疏水蛋白,其二级结构以α-螺旋为主,有3个保守区域和多个磷酸化位点,有7个B细胞抗原表位和4个T细胞抗原表位,无信号肽和跨膜螺旋区,并发现数个相关作用蛋白。结论PKnG为不稳定疏水蛋白,含有T、B细胞抗原表位,具有良好的抗原性,可作为结核诊断与治疗的潜在候选因子。
- 刘威付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌免疫逃逸生物信息学分析
- 结核分枝杆菌蛋白PE13的生物信息学分析被引量：2
- 2018年
- 目的应用生物信息学软件预测结核分枝杆菌Rv1195基因编码蛋白PE13的结构和功能。方法利用在线分析软件ProtParam,ProtScale,SOSUI,TMHMM Server v.2.0,SignalP 4.1,Motif Scan,TargetP 1.1Server,WoLF PSORT,SOPMA,SWISS-MODEL,BepiPred 1.0Server,SYFPEITHI和STRING数据库分析预测结核分枝杆菌Rv1195基因编码蛋白PE13的理化性质、亲疏水性、可溶性、跨膜区、信号肽、翻译后修饰位点、亚细胞定位、二级结构、三级结构、B细胞、T细胞抗原表位以及蛋白质的相互作用。结果 PE13蛋白由99个氨基酸组成,分子式为C418H655N113O139S4,相对分子质量(Mr)为9.615 71×103,理论等电点为4.56,280 m波长处消光系数为4 470,吸光度(Abs)为0.465,不稳定性系数为41.93,脂溶性系数为82.42,总平均亲水性系数为0.593,预测该蛋白为不稳定疏水性蛋白;该蛋白无跨膜区和信号肽,亚细胞定位预测其可能为分泌蛋白;二级结构中以α-螺旋为主,占86.87%,β-折叠和无规则卷曲分别占2.02%和11.11%,无β-转角,有1个蛋白激酶C磷酸化位点,3个B细胞抗原表位,5个限制性CTL细胞抗原表位,2个限制性Th细胞抗原表位;预测PE13蛋白与PPE18及esxK有相互作用。结论生物信息学预测PE13蛋白含有多个潜在的抗原表位,可作为研发新的结核病疫苗靶标。
- 车纾慧付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌生物信息学
- 结核分枝杆菌感染致巨噬细胞脂代谢改变的研究进展被引量：4
- 2018年
- 结核分枝杆菌引起的结核病是全球致死性传染病之一,结核感染期间结核分枝杆菌利用巨噬细胞脂质作为主要碳源。结核分枝杆菌与巨噬细胞间的相互作用、巨噬细胞内的免疫应答及脂质平衡密切相关。结核病患者肺内脂质含量明显增加,而外周血内胆固醇含量却明显降低。本文从巨噬细胞中结核分枝杆菌的能量代谢、结核分枝杆菌感染致肺部及血中巨噬细胞脂代谢改变等方面对结核分枝杆菌感染致巨噬细胞脂代谢改变的研究进展作一综述,以期发现结核病治疗的新靶点和新方法。
- 车纾慧付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌结核感染胆固醇代谢
- 外泌体及其在结核病中作用的研究进展被引量：2
- 2018年
- 外泌体是一类直径约30~100nm的能被大多数细胞分泌的细胞外膜泡,高度特异、拥有双脂质层结构。外泌体可以携带有功能的miRNA和蛋白质等生物信号分子并将其传递给靶细胞从而影响靶细胞的功能。在调节机体局部微环境和细胞间通讯方面发挥了至关重要的作用。而在被结核分枝杆菌感染后,细胞分泌的外泌体携带的分子会发生改变,例如mRNA和miRNA以及蛋白质等生物分子信号,而这些分子的改变与结核病的发生与发展有密切关系。本综述通过对近几年外泌体在结核方面的研究进展进行总结,为研发结核疫苗和探讨结核病的发病机制提供新的思路。
- 伊星昊李猛付玉荣
- 关键词：外泌体细胞间通讯结核分枝杆菌MIRNA蛋白质
- 活动性肺结核患者痰液中miR-29a的表达被引量：6
- 2012年
- miRNA是一类长度为18～25个核苷酸的单链非编码RNA分子，参与到调控细胞生长、发育、分化等各个环节，与疾病的发生、发展相关。最近的研究结果表明，miRNA分子也在微生物引起的感染和免疫应答中起重要调控作用；肺部疾病患者痰液中miRNA的表达可发生变化。我国是结核病高发国，其中，以肺结核最为常见。痰是肺泡、气管和支气管的分泌物，含有机体肺组织诸多生物过程的重要产物。本研究的目的是探讨miR-29a分子在活动性肺结核患者痰液中的表达情况。
- 伊正君付玉荣李瑞芳裴景亮张玉芝
- 关键词：肺结核患者活动性痰液RNA分子肺部疾病
- 长链非编码RNA及其与结核感染关系的研究进展
- 2018年
- 人类大约70％的基因组被转录，但不到2％的基因组编码蛋白质。根据大小，将非编码的RNA（ncRNA）分为长链非编码RNA（lncRNA）和短链非编码RNA（sncRNA）。lncRNA是一类长度大于200个核苷酸、无蛋白质编码功能的RNA。
- 王方璐伊正君付玉荣
- 关键词：非编码RNA结核感染长链编码蛋白质核苷酸
- 结核分枝杆菌调节蛋白RelA的原核表达及多克隆抗体制备被引量：13
- 2012年
- 目的:克隆编码结核分枝杆菌调节基因RelA并在大肠杆菌中表达,纯化后制备兔抗RelA的抗体。方法:利用PCR从结核分枝杆菌H37Rv株中扩增RelA基因,构建重组表达质粒pET-32a(+)-RelA;以重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3),筛选阳性重组菌株,IPTG诱导目的蛋白表达,在变性条件下对目的蛋白进行镍离子亲和层析纯化,通过SDS-PAGE和Westem blot鉴定目的蛋白的表达及反应原性;以表达的RelA蛋白免疫家兔,制备抗RelA的多克隆抗体并进行效价及特异性鉴定。结果:扩增了RelA基因,克隆于表达载体pET-32a(+)中,PCR筛选和酶切鉴定获得阳性克隆,测序证实正确。经诱导在大肠杆菌中表达出相对分子质量(Mr)为120 000的目的蛋白;纯化的RelA免疫家兔后,能有效地刺激特异性抗体的产生,抗血清的效价达到1∶6 400以上,且具有良好的特异性。结论:已成功构建RelA基因的原核表达载体,并在大肠杆菌中获得高效表达;制备出兔抗RelA抗体,效价及特异性均良好,为进一步研究RelA蛋白在结核病中的致病机制奠定了基础。
- 伊正君付玉荣许福亮高昆山李猛李建花
- 关键词：结核分枝杆菌RELA原核表达多克隆抗体
- 自噬在巨噬细胞抗结核感染中的作用及调控机制研究进展被引量：3
- 2018年
- 结核分枝杆菌和宿主细胞的相互作用在很大程度上决定结核的结局,自噬是巨噬细胞清除结核分枝杆菌的策略之一;结核分枝杆菌也进化出了一套自噬逃逸机制,利于其在巨噬细胞内的生存。自噬通路调控是细胞自噬发挥其生物学功能的基础,影响结核分枝杆菌和巨噬细胞的作用结局,本文主要讲述结核分枝杆菌入侵机体后巨噬细胞相关自噬通路调控以及结核分枝杆菌自噬抑制机制,为寻找防止结核病的新靶点奠定基础。
- 张西燕付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌结核病巨噬细胞自噬分子调控
