国家高技术研究发展计划(2008AA101002)
- 作品数：14 被引量：121H指数：7
- 相关作者：俞英张勤张沅王雅春张毅更多>>
- 相关机构：中国农业大学西北农林科技大学山东省农业科学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 奶牛乳房炎致病型耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的分离鉴定被引量：4
- 2011年
- 为探究引起奶牛乳房炎的耐药性致病菌,本研究针对西安地区显性乳房炎奶样中的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行系统研究。采用常规细菌学鉴定法对34头(次)荷斯坦牛76个乳区152份奶样的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)进行了分离培养,共检出92株阳性菌株,检出率为60.5%;对其进行S.aureus致病基因nuc的特异性PCR检测,共检出28株含nuc基因的阳性菌株,检出率为30.4%;进一步针对MRSA耐药基因mecA进行特异性PCR扩增,共检出5株MRSA,检出率为17.9%。研究结果为MRSA耐药菌的有效检测及奶牛乳房炎的治疗提供了指导。
- 韦艺媛王新郝斐俞英
- 关键词：奶牛乳房炎耐甲氧西林金黄色葡萄球菌细菌培养MECA
- 中国荷斯坦牛乳房炎易感性及抗性的全基因组关联分析被引量：12
- 2013年
- 本研究首先通过SAS 9.1分析2 093头北京地区中国荷斯坦牛体细胞数(SCC)的变化规律,依据SCC将牛只划分为乳房炎易感牛(Case)及抗性牛(Control);再基于Case-control设计进行全基因组关联分析。通过染色体水平的Bonferroni校正,共检测到6个SNPs与乳房炎易感性及抗性显著相关。其中19号染色体检测出的显著SNP(ARS-BFGL-NGS-78516,P=5.200 65e-05)在其200kb范围内共有3个基因(PRKRIP1、ARHGAP23和TBX21)与炎症反应密切相关。研究结果为奶牛乳房炎易感性及抗性的分子遗传基础研究提供了数据。
- 王晓解小莉王胜钱梦樱马裴裴张沅孙东晓刘剑锋丁向东姜力王雅春张毅张胜利张勤俞英
- 关键词：中国荷斯坦牛易感性SCC全基因组关联分析
- 表观遗传对炎症的调控机制及其在奶牛乳房炎抗病育种中的应用前景被引量：14
- 2010年
- 炎症受遗传和非遗传因素(环境或表观遗传)的共同影响,其中表观遗传(Epigenetic)在炎症的发生发展过程中发挥重要调控作用。表观遗传修饰是指DNA序列没有改变,而基因表达却发生了可遗传的变化,主要包括DNA甲基化和组蛋白修饰等。表观遗传为病原微生物与炎症反应间关系的研究架起了重要桥梁。炎症反应中T辅助细胞的分化,细胞因子、趋化因子等基因的表达都受到表观遗传的调控。文章主要综述了DNA甲基化、组蛋白修饰等对炎症尤其是乳房炎的调控机制,并就表观遗传调控在奶牛乳房炎治疗及抗病育种中的应用前景进行了展望。
- 王晓铄俞英
- 关键词：炎症表观遗传乳房炎抗病育种
- Meta-AS:整合关联分析系统
- ＜正＞引言候选基因法是研究数量性状遗传机制的一个有效途径,因而已经成为动物遗传育种领域的研究热点。然而,目前候选基因法无论是在统计方法方面,还是在其应用方面都存在着大量问题:一是许多研究者对统计分析方法和软件无法熟练和准...
- 王起山胡艳玲赵洪波王明辉潘玉春
- 关键词：单体型数量性状标记辅助选择
- 文献传递
- 利用改进的酚-氯仿法从猪毛囊中提取基因组DNA被引量：18
- 2010年
- 为提高从猪毛囊组织中提取基因组DNA的效率，文章在借鉴从其他组织提取基因组DNA方法的基础上，对经典的酚-氯仿法的反应体系和步骤进行了改进。利用改进的酚-氯仿抽提法，从猪的毛囊组织中快速、高效地提取了高质量基因组DNA。利用该方法从1-6根猪毛囊中提取的基因组DNA可满足基于PCR技术的相关分子生物学实验需要。
- 王继英俞英冯利霞王怀中张勤
- 关键词：基因组DNA
- 利用全基因组连锁不平衡估计中国荷斯坦牛有效群体大小被引量：6
- 2012年
- 有效群体大小是群体遗传学研究的一个重要内容,有助于我们更清楚地了解群体的遗传变异、进化和复杂性状的遗传机制等。随着高密度SNP标记的出现,越来越多的研究利用SNP标记间连锁不平衡估计有效群体大小。文章采集北京地区中国荷斯坦牛2 093个样本,并利用牛SNP芯片(Illumina BovineSNP50,含5 4001 SNPs)进行基因型测定,估计不同世代中国荷斯坦牛的有效群体大小。质量控制标准设定为SNP检出率0.95,最小等位基因频率>0.05,样本检出率0.95,哈代温伯格平衡检验显著性水平P<0.0001。经过质量控制,共1 968个样本和38 796个SNPs用于连锁不平衡分析。文章选取SNP间距0.1、0.2、0.5、1、2、5、10、15(Mb),估计中国荷斯坦牛在4世代之前有效群体大小。结果表明,中国荷斯坦牛的有效群体呈逐代下降趋势,至4世代前,中国荷斯坦牛平均有效群体为45头左右。
- 尼桂琰张哲姜力马裴裴张勤丁向东
- 关键词：中国荷斯坦牛
- 利用SNP标记进行北京地区中国荷斯坦牛亲子推断的研究被引量：10
- 2012年
- 本研究旨在利用SNP标记对北京地区中国荷斯坦牛群进行亲子推断,并分析场、母牛出生年月、公牛家系对系谱错误率的影响,以期为指导奶牛育种和生产管理提供依据。共选取了255个最小等位基因频率大于0.45的高多态SNPs标记,利用似然法,采用Cervus3.0软件对北京地区84头荷斯坦公牛和1 927头母牛进行亲子推断研究。结果显示,试验群体平均系谱错误率为20.9%,不同的场、出生年份和月份的母牛的系谱错误率有显著差异(P<0.05),而各公牛家系间系谱错误率差异不显著(P>0.05)。结果说明,错误系谱的发生主要是由于牛场本身记录不完善造成的。在我国亟需建立利用遗传标记监测、校正系谱准确性的制度,采取措施提高系谱的准确性,加快我国荷斯坦牛遗传改良进程。
- 郭刚周磊刘林李东张胜利刘剑锋丁向东张毅王雅春张勤张沅
- 关键词：中国荷斯坦牛SNP
- 中国荷斯坦牛SCC变化规律及其与产奶性状之间的关系被引量：37
- 2010年
- 本研究旨在分析北京地区中国荷斯坦牛测定日体细胞数的变化规律及其与产奶性状之间的关系,推断适于中国荷斯坦牛隐性乳房炎的判定标准。通过对北京地区76个荷斯坦牛牛场63510头母牛的DHI数据进行整理筛选,按每毫升奶中体细胞数(SCC)情况,用SAS8.2将其划分为12个子数据集及8个累积数据集。首先用Excel对12个子数据集的SCC和产奶性状作图,然后用Matlab的Spline函数对12个子数据集及8个累积数据集做泌乳期的SCC曲线。除乳脂率外,12个子数据集的SCC均值与各产奶性状均值的变化趋势相关显著,随着SCC的增长,产奶量、乳蛋白量和乳脂量逐渐下降,乳蛋白率逐渐上升(P<0.001)。累计数据集作图发现,SCC<20万与SCC<10万的差异较大,而SCC<50万与SCC<40万差异较小。结果表明,为有效降低隐性乳房炎发病率,北京地区中国荷斯坦牛牛群宜以10万～50万SCC作为隐性乳房炎划分标准。
- 马裴裴俞英张沅张勤王雅春孙东晓张毅
- 关键词：体细胞数产奶性状隐性乳房炎
- 中国北方奶牛金葡菌乳房炎感染现状及耐药性和流行类型研究进展被引量：11
- 2015年
- 奶牛乳房炎,尤其是由金黄色葡萄球菌(金葡菌)感染引起的隐性乳房炎是最难以防控的奶牛常见病。近五年来,本课题组对中国北方六个省市九个荷斯坦牛场的生产群高体细胞数(SCC)和低SCC奶牛以及临床乳房炎奶牛进行了十一批次采样,共采集奶样1 112头份,分离出191株金葡菌,所检测牛的平均金葡菌感染率达11.7%,其中生产群奶牛金葡菌感染率为12.4%,临床乳房炎牛为10.8%。对这些金葡菌进行药敏试验以及毒素基因检测,发现氯霉素和阿米卡星对金葡菌有较强抑制性,毒素基因检出率最高者是杀白细胞素基因PVL(70.2%)。依据金葡菌PFGE分型结果绘制中国北部及华东地区奶牛乳源金葡菌的流行图谱。结合国内外相关研究结果,对比分析了国内外奶牛金葡菌乳房炎的感染情况以及金葡菌的耐药性、毒素基因和流行类型,并提出了降低奶牛感染金葡菌乳房炎的相关策略。
- 王晓俞英
- 关键词：奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌耐药性
- 基于EM和规则算法的半同胞家系单倍型推断方法
- ＜正＞引言单倍型（Haplotype）是指同一染色体上多个基因座位等位基因的组合,它能同时利用多个基因座位的遗传信息,比单基因座位分析更有效力,在进化、基因定位、基因组选择等研究领域有广阔的应用前景。目前,
- 丁向东张勤
- 关键词：EM算法半同胞家系
- 文献传递
