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食管鳞癌中GPX3基因的甲基化特征及其临床意义被引量：4: 2015年; 目的:采用将食管鳞癌组织和癌旁组织相对比,并将食管鳞癌患者的血浆与正常人的血浆相对比的策略,检测GPX3的甲基化状态和频率。结合患者的临床病理特征,分析GPX3基因甲基化在食管鳞癌中的意义。方法:收集42例食管鳞癌组织标本和相对应的癌旁组织标本,同时收集42例食管鳞癌患者和50例正常人的血浆标本;应用甲基化特异性PCR(MSP)结合琼脂糖凝胶电泳检测GPX3在组织和血浆中的甲基化情况,对比分析。结果:GPX3在肿瘤组织中的甲基化频率为54.8%,显著高于癌旁组织9.5%(P<0.001)。GPX3在肿瘤患者血浆中的甲基化频率为40.5%,在正常对照组的血浆中没有检测到甲基化。组织中的甲基化频率在病理分期为T3组和N2组分别显著高于病理分期为T1-T2组和N0-N1组。血浆中的甲基化频率在病理分期T3组明显高于病理分期T1-T2组。结论:GPX3在食管鳞癌组织的甲基化频率高于癌旁组织,在食管鳞癌患者血浆中的甲基化频率显著高于正常人,且临床分期越晚的甲基化频率越高。; 郑燕芳李许锋蒋春雨张积仁吕海; 关键词：食管鳞癌甲基化表观遗传学

胃癌患病风险关键基因筛选被引量：8: 2014年; 目的:筛选胃癌患病风险关键基因,为进一步相关性研究提供参考。方法:检索Pubmed/Medline和Embase数据库,收集胃癌患病风险相关基因的文献,运用生物信息学的方法对获得的基因进行分析。结果:954篇文献符合要求,共涉及268个基因,其中不同功能的GO分类780种,京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路67种,而贝叶斯因子>1、P≤0.001且误判率≤0.001的GO分类有94种,KEGG通路有6种,主要涉及应激反应、DNA损伤修复、细胞生理调控过程、细胞凋亡、免疫反应、细胞因子与细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Jak-STAT信号通路以及MAPK信号通路相关。所涉及基因的蛋白产物通过在线String 9.0软件构建蛋白网络,运用Cytoscape 2.8.2软件将构建的蛋白网络图可视化及量化。筛出24个关键候选基因,包括STAT3、EGFR、NFKB1、GSTP1、IL4、IFNG、PARP1、MMP9、JUN、IL6、TNF、IL1B、CD4、CDH1、SMAD4、HRAS、PTGS2、EGF、VEGFA、MLH1、TP53、CASP3、TGFB1和CCND1,其中5个关键基因是PTGS2、TNF、IL6、NFKB1和TP53。结论:胃癌患病风险关键基因可为胃癌遗传易感性研究提供参考,针对这些基因的大样本跨种族及高质量的临床研究可能是未来的方向。; 李龙李静黄东兰郑燕芳张积仁; 关键词：胃肿瘤患病风险基因生物信息学

基因在食管鳞癌组织和血浆中的甲基化特征及临床意义: 2015年; 目的:将食管鳞癌组织和癌旁组织相对比,将食管鳞癌患者的血浆与正常人的血浆相对比,检测EPPB41L3的甲基化状态和频率,并结合患者的临床病理特征,分析EPPB41L3基因甲基化在食管鳞癌中的意义。方法:收集42例食管鳞癌组织标本和相对应的癌旁组织标本,同时收集42例食管鳞癌患者和50例正常人的血浆标本;应用甲基化特异性PCR(MSP)结合琼脂糖凝胶电泳检测EPB41L3在组织和血浆中的甲基化情况。结果:EPB41L3在肿瘤组织中的甲基化频率为59.5%,显著高于癌旁组织4.8%(P<0.001)。EPB41L3在肿瘤患者血浆中的甲基化频率为31.0%,在正常对照组的血浆中没有检测到甲基化。组织中的甲基化频率在肿瘤≥5 cm组和病理分期为T3组分别明显高于肿瘤<5 cm组和病理分期T1-T2组。血浆中的甲基化频率在病理分期N2组明显高于病理分期N0-N1组。结论:EPB41L3在食管鳞癌组织的甲基化频率高于癌旁组织,在食管鳞癌患者血浆中的甲基化频率显著高于正常人,且临床分期越晚的甲基化频率越高。; 熊威斌李许锋蒋春雨张积仁周福有余力郑燕芳; 关键词：食管肿瘤甲基化表观遗传学

镉致癌的分子机制研究进展被引量：15: 2015年; 镉是一种无处不在的重金属环境污染物,广泛用于工业环境中。普通人主要通过摄食、吸烟及饮水等方式摄入镉。1993年国际肿瘤研究机构(IARC)就已将镉及其化合物列为第1类人致癌物,镉的致癌性被广泛研究,大量研究发现镉会提高肺癌、前列腺癌、乳腺癌、消化道肿瘤等肿瘤的患病风险。但至目前为止,镉的致癌分子机制尚不清楚。大量研究认为镉通过以下几方面致癌:氧化应激、抑制DNA损伤修复、DNA异常甲基化、抑制细胞凋亡、影响细胞周期调控、致多种基因异常表达、雌激素样效应、促进肿瘤干细胞生长、慢性炎症刺激。; 吴婧董欣敏郑燕芳张积仁; 关键词：镉重金属致癌分子机制

EGFR突变阴性非小细胞肺癌二、三线治疗的荟萃分析被引量：5: 2015年; 目的：比较酪氨酸激酶抑制剂（TKIs）与二线或三线化疗治疗表皮生长因子受体（EGFR）突变阴性的非小细胞肺癌（NSCLC）患者的疗效。方法：检索Pub Med、Cochrane Library、EMBASE、中国知网和美国临床肿瘤学会（ASCO）会议摘要,对符合要求的随机对照试验进行荟萃分析。结果：共纳入7个试验,结局指标包括从随机化分配到疾病进展的时间（PFS）和从方案招募开始到患者死亡的时间（OS）。PFS指标显示,TKIs在统计学上差于化疗（风险比HR=1.34,95%CI为1.08-1.65;P=0.007）;OS指标显示,两者差异无统计学意义（HR=1.07,95%CI为0.92-1.24;P=0.395）。移除2个试验后,PFS指标显示,TKIs仍然差于化疗（风险比HR=1.42,95%CI为1.23-1.63;P=0.000）;OS指标显示,两者差异无统计学意义（HR=1.05,95%CI为0.90-1.23;P=0.536）。所有亚组中厄洛替尼对比化疗差异均无统计学意义。结论：对于EGFR突变阴性且可耐受化疗的NSCLC患者,化疗优于TKIs治疗,但是TKIs可用于体力状况评分差的患者。; 杨锁萍丁为民李凯姜兆静郑燕芳; 关键词：非小细胞肺癌吉非替尼厄洛替尼

食管鳞癌组织和血浆中COL14A1基因的甲基化及与临床特征的关系: 2015年; 目的对比分析食管鳞癌组织和癌旁组织，食管鳞癌患者与正常人的血浆，检测COL14A1的甲基化频率，并结合患者的临床病理特征，分析COL14A1基因甲基化与食管鳞癌的临床特征的关系。方法收集42例食管鳞癌组织标本和相对应的癌旁组织标本，同时收集42例食管鳞癌患者和50例正常人的血浆标本；应用甲基化特异性PCR（MSP）结合琼脂糖凝胶电泳检测COLl4A1在组织和血浆中的甲基化情况。结果COL14A1在肿瘤组织中的甲基化频率为45．24％，显著高于癌旁组织11．9％（P〈0．001）。COL14A1在肿瘤患者血浆中的甲基化频率为30．95％，在正常对照组的血浆中未检测到甲基化。组织中的COL14A1甲基化频率在病理分期为N2组明显高于病理分期N0-N1组。血浆中的COL14AI甲基化频率在病理分期T3组明显高于病理分期T1-T2组。结论COL14A1在食管鳞癌组织的甲基化频率高于癌旁组织，在食管鳞癌患者血浆中的甲基化频率显著高于正常人，且临床分期越晚的甲基化频率越高。; 郑燕芳李许锋蒋春雨周福有王贻诺张积仁; 关键词：食管鳞癌甲基化表观遗传学

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国家自然科学基金(81202073)