吕志清
作品数: 4被引量:39H指数:2
  • 所属机构:内蒙古大学
  • 所在地区:内蒙古 呼和浩特市
  • 研究方向:生物学
  • 发文基金:国家自然科学基金

相关作者

李前忠
作品数:143被引量:220H指数:10
供职机构:内蒙古大学物理科学与技术学院
研究主题:抗冻蛋白 蛋白质 支持向量机 离散量 启动子
一种预测蛋白质结构型的新方法被引量:4
2002年
基于蛋白质的结构类型决定于它的二级结构序列的概念 ,将蛋白质的二级结构含量和二级结构序列参数 Nα,Nβ,Nβαβ结合起来构成离散源 ,分别计算四种结构类型的标准离散量 D( Xα) ,D( Xβ) ,D( Xα/β) ,D( Xα+β) ,利用离散增量的概念 ,蛋白质的结构类型是由这个蛋白质的离散量 D( X)与四个标准离散量之间离散增量的最小值所决定的 .因此 ,对标准集中 35 9个蛋白的结构型进行检测并对检验集中 1 1 7个蛋白质进行结构预测 ,标准集的准确率为 87% ,检验集的预测准确率为 88%
吕志清李前忠
关键词:二级结构序列离散量蛋白质
用Markov链模型研究不同物种的氨基酸丰度和对蛋白质结构型的预测
该文第一部分利用吸收Markov链模型对大肠杆菌(E.coli)和酿酒酵母(S-cerevisiae)的氨基酸丰度和变异度进行研究,计算了20种氨基酸的丰度值和变异度值,证明了密码子三个核苷酸的转换、颠换突变系数的差异,...
吕志清
关键词:MARKOV链氨基酸离散量
用离散量预测蛋白质的结构型被引量:38
2001年
基于蛋白质的结构类型决定于它的二级结构序列的概念,用二级结构序列参数Nα,Nβ,Nβαβ,N(βαβ)构成离散源,并计算离散量D(Xα),D(Xβ),D(Xα/β),D(Xα +β),利用离散增量预测蛋白质的结构类型,它是由这个蛋白质的离散量D(Xn)与四个标准离散D(Xα),D(Xβ),D(Xα/β),D(Xα +β)之间离散增量的最小值所决定的 .预测结果表明,准确率分别达到84.8%(标准集)和83.8%(检验集)。
吕志清李前忠
关键词:二级结构序列离散量蛋白质
用Markov链模型研究不同物种的氨基酸丰度
2001年
:针对不同的物种 ,利用 Markov链模型分别计算了 E.coli和酿酒酵母 ( S-cerevisiae)的2 0种氨基酸的丰度和变异度 .并与丰度的统计值进行比较 ,二者取得了较好的一致 .
吕志清李前忠
关键词:密码子使用频率遗传密码酿酒酵母