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搜索到322篇“ SSR-PCR“的相关文章

芦笋SSR-PCR反应体系的优化及验证: 2024年; 以芦笋幼叶为材料,采用单因素与L1(643)正交试验相结合的方法,对影响芦笋SSR-PCR反应的3个因素(2×Taq Master Mix,模板DNA,引物)进行优化,并以此为基础通过退火温度和循环次数试验筛选引物最佳退火温度和循环次数。结果表明,芦笋基因组DNA的SSR-PCR最优反应体系为:10μL反应体系中,50 ng·μL^(-1) DNA模板0.125μL,10μmol·L^(-1)上下游引物各0.5μL,2×Taq PCR Mix 3μL,灭菌ddH2O 5.875μL。PCR扩增程序为:94℃预变性4 min;94℃变性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸35 s,循环25次;72℃延伸10 min,4℃保存。经5对引物组合和5个不同芦笋品种DNA扩增验证,该体系稳定可靠,可用于芦笋遗传多样性分析、种子纯度鉴定、分子标记辅助育种及重要农艺性状的图位克隆等工作。; 白扬仪泽会; 关键词：芦笋 SSR-PCR反应体系正交设计

木本油料植物无患子SSR特征分析及SSR-PCR反应体系构建: 2024年; 无患子(Sapindus saponaria L.)是集生物柴油、药用、生态等多种用途于一体的经济型木本油料。本研究利用MISA软件挖掘了无患子叶片转录组中的SSR,对搜索到的SSR进行了特征分析,构建并优化了无患子SSR-PCR反应体系。结果表明,无患子叶片转录组共有Unigene条数目为52460条,其中含有SSR的Unigene有7014条,共检索到8654个SSR。经统计,SSR丰富度从二至六核苷酸依次减少,依次有4327、2669、634、208、161个。SSR长度范围在12~250 bp之间,长度小于等于15 bp的有3619个,均为二和三核苷酸;长度大于15 bp的有5035个,以二、三核苷酸居多。所有SSR共有435种不同重复单元。SSR不同类型重复基元频次分布在4~30次之间,主要分布在4~10频次,共有7090个SSR位点,占总频次的89.65%。SSR位点靶基因GO功能注释显示,无患子叶片转录组Unigene可分为3大类别51个小组;KEGG功能注释显示5大类别中,代谢通路占比最高为65.18%。通过对无患子SSR-PCR反应体系构建与优化,无患子SSR-PCR反应体系最佳组合为:循环次数37次、退火温度60℃、引物量2.0μL、DNA模板浓度为40 ng/μL。; 周宵蒋丽娟李昌珠陈韵竹李培旺熊宇晴张路红盛克寨杨艳陈景震; 关键词：木本油料植物 EST-SSR 功能注释 PCR反应体系

中国沙棘SSR-PCR反应体系的优化及引物开发被引量：1: 2023年; 本研究旨在建立适宜中国沙棘(Hippophae rhamnoides subsp.sinensis)SSR-PCR的反应体系,以期为中国沙棘遗传多样性分析、种质资源鉴定等相关研究奠定基础。本研究以来自青海不同地区的中国沙棘野生种的150个植株为试验材料,采用单因素试验和L16(45)正交实验对影响中国沙棘SSR-PCR反应体系的因素进行优化。正交试验极差分析和方差分析结果均显示,影响中国沙棘SSR-PCR反应体系扩增效果的5个因素的主次顺序为缓冲液>dNTPs>引物>模板DNA>Taq DNA聚合酶。结合直观分析的评分结果,确定适用于中国沙棘的最佳SSR-PCR反应体系为0.8 U Taq DNA聚合酶、 2 mmol/L缓冲液、 1.5 mmol/L dNTPs、 0.5μmol/L引物、 25 ng模板DNA,加双蒸水至20μL;筛选出15对条带清晰、多态性丰富且重复性好的SSR引物。本研究可为中国沙棘的亲缘关系鉴定和分子遗传育种等研究提供科学依据。; 刘青青马玉花李雄杰马福林高佩马亚琼杨开宇; 关键词：中国沙棘 SSR-PCR 单因素试验正交试验

国槐SSR-PCR反应体系的建立与优化被引量：2: 2022年; 利用单因素试验结合L_(16)(4^(5))正交试验设计对国槐SSR-PCR反应体系中的5个主要影响因素(Mg^(2+)、引物、dNTPs、ExTaq酶、模板DNA用量)进行优化,确定最佳反应体系为(10μL):25 mmol/L Mg^(2+)1.0μL,2.5 mmol/L dNTPs 0.2μL,10μmol/L上下游引物共0.5μL,5 U/μL ExTaq酶0.05μL,30 ng/μL模板DNA 1.0μL,10×PCR Buffer 1.0μL,ddH_(2)O 6.25μL。随机挑选4对SSR引物和8个国槐种质对试验确定的最佳反应体系进行验证,均能获得清晰、稳定的条带。该优化反应体系的建立为利用SSR标记对国槐种质资源进行深入研究和利用奠定了基础。; 张明静庞彩红李际红李双云付茵茵哈新英夏阳; 关键词：国槐 SSR PCR反应体系

云南白灵芝菌株分子鉴定及SSR遗传多样性分析被引量：6: 2022年; 为了在分子水平上明确云南白灵芝的种属地位和遗传差异,本实验利用rDNA-ITS序列比对和SSR分子标记法,对云南白灵芝菌株进行分子鉴定和遗传多样性分析。结果显示,15个菌株的ITS测序在种的水平上鉴定为白肉灵芝(Ganoderma leucocontextum);SSR-PCR筛选出17对扩增稳定、多态性较高的引物,参试菌株共检测出101个等位基因位点,等位变异数范围为3~10个,平均每对引物等位基因数目为5.94个;Nei’s遗传多样性指数变化范围为0.127~0.330,平均为0.223;香农指数在0.231~0.504之间,平均值为0.365。经遗传多样性分析,各样本间的相似水平在0.40~0.75之间。研究表明各菌株间存在较大的遗传差异,为云南白灵芝的菌种鉴定和新品种测试提供依据。; 姚春馨陈卫民柴红梅田果廷; 关键词：RDNA-ITS SSR-PCR 分子鉴定

玉米品种德美亚多重SSR-PCR系统的建立及应用: 2022年; 玉米杂交种纯度的优劣直接决定其产量,常规检测方法采用若干单引物进行若干次电泳检测,鉴定周期长,效率低,不能及时反映杂交种纯度,难以及时指导大田生产。为了提高玉米种子纯度检测的准确性,建立稳定高效的多重PCR检测技术,本研究以‘德美亚1号’、‘德美亚2号’、‘德美亚3号’及其父母本为试验材料,通过比较不同DNA提取方法,确定了适宜多重PCR检测的SDS法;同时针对‘德美亚’不同系列,从国标玉米核心40对引物中筛选多态性并适合组建多重PCR的引物,试验最终为‘德美亚1号’组建了两重PCR,‘德美亚2号’和‘德美亚3号’组建了3重PCR,并尝试了自交系4重和5重引物组合,采用适宜的琼脂糖凝胶电泳检测方法,都获得了很好的扩增效果,试验所采用的扩增体系和扩增程序适宜2~5重PCR反应,并能有效应用于玉米杂交种的种子纯度鉴定。为今后‘德美亚’系列玉米品种鉴定提供了便利,也为其它玉米品种鉴定提供了思路。; 王超王超王超郭春兰李莹侯文秀邹冰雪黄珊珊化金阁郭梅杨楠庞震; 关键词：玉米 SSR标记多重PCR 种子纯度鉴定

西北地区大蒜及其野生蒜SSR-PCR体系优化及引物筛选: 2022年; 为探索了解西北地区大蒜及其野生蒜资源之间的亲缘关系及变异特性,以25份西北地区及野生大蒜鳞茎和叶片为材料提取模板DNA,筛选适于简单重复序列(SSR)-PCR的反应体系。采用L_(16)(4^(3))正交表设计正交试验并进行单因素试验,对影响大蒜SSR-PCR的相关体系参数进行优化。结果表明,适用于大蒜的SSR反应体系总体积为10μL:模板DNA 30.0 ng,正反引物均为0.5μmol/L,2×Taq PCR Mix 5.0μL,其余用dd H_(2)O补齐。扩增程序:94℃预变性3 min;94℃变性30 s,不同引物最佳退火温度退火45 s,72℃延伸90 s;30次循环的最后1次循环72℃延伸设为10 min,4℃保存扩增产物。最终在上述PCR条件下从50对SSR通用引物中筛选出13对多态性好、稳定性高的适用于大蒜SSR-PCR多样性分析的候选引物。; 李守明史荣梅李辉玲; 关键词：大蒜 SSR-PCR 引物筛选扩增产物

茶树SSR-PCR引物开发及其在永川秀芽产品真实性认证和重庆野生茶树资源分析中的应用研究: 简单重复序列分子标记（Simple sequence repeat,SSR）因具有高多态性、共显性遗传、特异性强、结果稳定、多样性高、分布广泛和检测方便等优点,被广泛应用于植物分子标记辅助育种、遗传图谱的构建、种质资源鉴...; 黄瑞; 关键词：SSR-PCR

一种用于棘头梅童鱼SSR多重PCR引物及其应用: 本发明公开了一种用于棘头梅童鱼SSR多重PCR引物，所述SSR多重PCR引物包括9对特异性引物，分别为引物对Clu982、Clu1605、Clu740、Clu493、Clu1563、Clu873、Clu1288、Clu1...; 郭梁张殿昌张楠朱克诚郭华阳刘宝锁赵方草

海南省火焰兰SSR-PCR反应体系及其应用: 本发明属于分子生物学技术领域，具体公开了一种海南省火焰兰SSR‑PCR反应体系，包括Primer‑F、Primer‑R、DNA聚合酶、DNA模板。本发明还公开了上述海南省火焰兰SSR‑PCR反应体系在海南省火焰兰SSR分...; 赵慧琪任军方赵慧琳黄赛李栋梁张浪蔡嘉慧; 文献传递

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