搜索到1042篇“ COI基因“的相关文章
- 基于COI基因的浙江省内黄缘闭壳龟遗传多样性研究
- 2024年
- 为了解浙江省内不同黄缘闭壳龟(Cuora flavomarginata)群体的种质资源现状,基于线粒体DNA COI序列对来自浙江省内野外和养殖场的8个黄缘闭壳龟群体的遗传多样性和遗传结构进行比较分析。结果表明:黄缘闭壳龟线粒体COI基因序列长度为1040 bp,A=27.4%、T=30.5%、C=24.6%、G=17.5%,有较强的AT偏好性;共定义9个单倍型,单倍型多样性(Hd)为(0.79900±0.21000),核苷酸多样性(Pi)为(0.00209±0.00147),呈“高Hd低Pi”遗传分布;不同黄缘闭壳龟群体间的遗传距离为0~0.003,群体内部的遗传距离为0~0.004,其中磐安后阁村(YS)群体内部的遗传距离最大,为0.004;单倍型系统发育树并未呈现明显的谱系结构;群体间遗传分化指数(FST)为-0.34752~0.82222,8个群体的遗传分化不显著(p>0.05);中性检验(Tajima’s D=-0.36627,Fu’s FS=-0.605)与核苷酸错配分布均表明,浙江省内黄缘闭壳龟群体并未经历种群扩张事件,同时,由Mantel检验可知,遗传距离与地理距离没有显著的相关性(R=0.2938,p>0.05);AMOVA分子方差结果显示,群体内的遗传变异高于群体间(85.06%>14.94%)。研究表明,浙江省内黄缘闭壳龟群体之间为高单倍型多样性和低核苷酸多样性的遗传特征,并且存在一定水平的遗传分化,群体内存在明显的基因交流,根据COI基因分析显示,在磐安县获得的野生黄缘闭壳龟个体确定为黄缘闭壳龟浙江种,同时也发现存在浙江种与安徽种的杂交种,建议将分化程度不同的黄缘闭壳龟群体划分为不同单元保护。研究结果为浙江省内黄缘闭壳龟种质资源开发利用和合理制定保护措施提供了基础依据。
- 陈敏秦媛林业宏任思齐叶嘉政郑善坚
- 关键词:黄缘闭壳龟COI
- 基于形态学和线粒体COI基因分子标记的安西自然保护区普氏野马马胃蝇幼虫鉴定分析
- 2024年
- 马胃蝇Gasterophilus spp.是马科动物体内常见的一类寄生虫,目前全世界报道了9种马胃蝇。马胃蝇不同物种具有明显的地域分布特征,不同地区感染马胃蝇的物种组成结构差异明显。为了探究甘肃安西极旱荒漠国家级自然保护区内普氏野马Equus ferus感染马胃蝇幼虫的物种组成,2021年对保护区内的野马进行了驱虫保健,并解剖死亡个体,采获马胃蝇幼虫875只;利用体视解剖镜对特征明显的三龄幼虫进行了形态学观察及鉴别,根据三龄幼虫领部棘刺,以及各体节棘刺形态、口脊骨页部形态平滑、伪头小刺结构清晰等特征,明确了三龄幼虫均为黑腹胃蝇Gasterophilus pecorum;对于形态难以鉴定的一、二龄幼虫,采取了扩增其线粒体细胞色素氧化酶亚基(COI)基因并与GenBank数据库中马胃蝇属序列对比的分子鉴定方法,经过比对分析,确认一、二龄幼虫均与黑腹胃蝇序列聚为一支,且与黑腹胃蝇遗传距离最近。综上,确认甘肃安西极旱荒漠国家级自然保护区马胃蝇种类均为黑腹胃蝇。
- 裴鹏祖田瑞祥闫利平张东
- 关键词:普氏野马分子鉴定
- 扩增稻水象甲线粒体COI基因序列的特异性引物组及其应用
- 本发明涉及分子生物学技术领域。本发明提供了扩增稻水象甲线粒体COI基因序列的特异性引物组,包括正向引物DSXJF5和反向引物DSXJR5;还提供了该特异性引物组在区分稻水象甲生殖型中的应用、试剂盒以及方法。本发明操作简单...
- 祝增荣洪海诺周瀛高泰
- 扩增稻水象甲线粒体COI基因序列的特异性引物组及其应用
- 本发明涉及分子生物学技术领域。本发明提供了扩增稻水象甲线粒体COI基因序列的特异性引物组,包括正向引物DSXJF5和反向引物DSXJR5;还提供了该特异性引物组在区分稻水象甲生殖型中的应用、试剂盒以及方法。本发明操作简单...
- 祝增荣洪海诺周瀛高泰
- 烟青虫不同地理种群的mtDNA COI基因序列分析及其系统发育
- 2024年
- 烟青虫是一种世界性的农业害虫,对烟草种植危害严重,在我国四川、贵州、华中等多个烟草产区造成了巨大损失,损失量达到15%。烟青虫在亚洲、非洲和澳洲分布广泛,本研究对分布在不同地理种群的烟青虫进行mtDNA COI基因序列分析,同时研究其系统发育关系,为研究四川省烟青虫防治提供借鉴。结果表明,昆明和玉溪为同一个类群;昭通和珠海为同一个类群;韩国、宿迁、妙峰山为同一个类群;进化关系为((((昆明+玉溪)(昭通+珠海))+(大理+丽江))+(印度+(妙峰山+(韩国+宿迁))))。研究结果揭示了10个来自不同地区烟青虫的COI基因序列特征以及发育关系,为研究凉山州烟青虫的防治和系统发育提供了基础分子数据。
- 梁辉杨东升
- 关键词:烟青虫COI系统发育
- 用线粒体COI基因序列分析黄尾鲴养殖群体的遗传结构
- 2024年
- 为了解人工养殖和选育对黄尾鲴(Xenocypris davidi)遗传多样性的影响,利用线粒体COI基因分析中国湖南的醴陵(LL)、浙江的长兴(CX)、双浦(SP)和吴兴(WX)128尾1~2龄的4个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性。结果显示,在539 bp的COI部分序列中,检测到75个变异位点,包括74个简约信息位点,序列中A+T的含量(56.1%)明显高于G+C的含量(43.8%),有明显的(A+T)偏好性。在128尾个体中定义了11种单倍型,单倍型Hap-01个体43尾,为优势单倍型。遗传多样性检测结果显示,4个群体的单倍型多样性指数(Hd)介于0.226~0.605,核苷酸多样性指数(π)介于0.00104~0.02221,其中,WX群体的遗传多样性最为丰富。不同养殖群体间遗传距离为0.0145~0.0986,CX和WX群体的遗传距离最近,LL与SP群体的遗传距离最远。AMOVA分析显示,群体间的遗传分化系数Fst为0.8385(P<0.01),遗传变异主要发生在群体间。NJ系统发生树和遗传距离分析结果表明,4个群体间存在相当高的遗传分化。本研究结果可为黄尾鲴遗传多样性变化的比较研究提供基础数据,并为黄尾鲴增殖放流和资源保护提供一定依据。
- 陈大伟朱鹏灿刘士力干超其郑建波蒋文枰程顺迟美丽杭小英李飞
- 关键词:养殖群体
- 宽体金线蛭COI基因特异性引物的设计及验证
- 2024年
- 目的建立一种宽体金线蛭的聚合酶链式反应鉴别方法,实现对宽体金线蛭及其常见混伪品的快速鉴别。方法以细胞色素c氧化酶亚基I序列为基础,通过分析宽体金线蛭单核苷酸多态性位点,设计宽体金线蛭的特异性鉴别引物。对引物稳定性、引物特异性及灵敏度进行考察确认,同时将其应用于含水蛭的中成药中进行验证。结果使用宽体金线蛭特异性引物KT1-3或KT1-4均可特异性扩增宽体金线蛭的DNA,产物大小分别为235 bp和266 bp,而在其他非宽体金线蛭样品中无扩增条带。该方法对宽体金线蛭DNA的最低检测限为0.01 ng。使用该特异性引物对可在脑血栓片模拟制剂和部分市售脑血栓片中检测到宽体金线蛭。结论建立的DNA分子鉴定方法中宽体金线蛭引物对特异性强、灵敏度高,可作为水蛭药材传统基原鉴定方法的补充,为宽体金线蛭的快速鉴别提供支持。
- 潘爽刘金花孙巧巧李鹏举
- 关键词:DNA条形码宽体金线蛭特异性引物掺伪
- 基于线粒体COI基因鉴定技术的盐城市长角血蜱遗传多样性分析
- 2024年
- 目的了解盐城市长角血蜱的遗传多样性和不同地理种群间系统发育关系,为该地区长角血蜱及其蜱媒病的防控提供理论基础。方法2022年10月—2023年4月,在盐城市亭湖(枸杞灌木丛、盐地碱蓬区、海堤草丛、白茅、居民区)、东台(河堤草丛)两地共6种生境采集蜱虫,形态学鉴定后用普通PCR扩增线粒体细胞色素C氧化酶I亚基(COI)基因,进行分子鉴定。结果共采集38只蜱虫,包括25只成蜱和13只若蜱,经形态学与分子生物学鉴定均为长角血蜱,分布于两个进化分支,主要进化分支位于Compound分支中。不同地理种群分属于5个共享单倍型,25个为独享单倍型,其中盐城市共涉及3个共享单倍型,10个单倍型,H5、H10处于辐射中心位置,可能较为原始。结论本次采集的长角血蜱在不同地理种群无明显分化,在盐城种群中可能处于扩张突变积累中。
- 陈国清崔倩张红军李峰李春香燕清丽王富华徐兵安然杨鹏飞
- 关键词:长角血蜱系统发育种群遗传多样性种群遗传结构
- 一种罗氏沼虾线粒体COI基因扩增引物
- 本发明公开了一种罗氏沼虾线粒体COI基因扩增引物,该引物序列为:上游引物序列为SEQ ID NO.1,即COIF:5'‑CAACGTAATTGTCACTGCCCACG‑3';下游引物序列为SEQ ID NO.2,即COI...
- 唐琼英杨国梁杨旻珉夏正龙谢巨洪蔡缪荧李景芬高权新
- 基于COI基因分析叶尔羌河5种鲤科鱼类遗传多样性
- 2023年
- [目的]探讨线粒体COI基因对叶尔羌河鱼类资源鉴定及遗传多样性分析的适应性。[方法]分析叶尔羌河5种鲤科的50条COI基因片段序列,并结合GenBank比对筛选出的12条高同源序列基于邻接法构建系统进化树。[结果]5种鱼类COI基因同源序列的长度675 bp,碱基组成展现出显著A/T的偏倚性,转换/颠换的比值(R值)为3.2;核苷酸变异位点有146个,定义了10个单倍型;除塔里木裂腹鱼和宽口裂腹鱼物种间的遗传距离(0.002 4),其余物种间的遗传距离均符合2%阈值或10倍原则;系统进化树中,除塔里木裂腹鱼和宽口裂腹鱼外,斑重唇鱼、鲫鱼和鲤鱼均形成独立分支,推测两者亲缘关系较近或物种间未达到分化程度。[结论]COI基因适用于叶尔羌河除裂腹鱼属外鱼类的物种鉴定及多样性分析。
- 张小雨靳文慧王佳王玉涛
- 关键词:COI基因鲤科鱼类
相关作者
- 马凌波

- 作品数:381被引量:615H指数:15
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