搜索到410篇“ CDNA微阵列“的相关文章
- 利用cDNA微阵列研究胃肠间质瘤耐药、复发相关基因的表达被引量:3
- 2011年
- 目的 观察复发与未复发胃肠间质瘤(GIST)间的基因表达差异,探讨恶性GIST伊马替尼耐药、复发发生发展机制.方法 收集5对患者的新鲜复发及未复发GIST组织随机配对成组行cDNA微阵列研究.应用荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法对芯片结果进行验证.结果 复发与未复发GIST间的差异表达基因共1088个,其中表达上调者592个,下调者496个;上调基因功能主要与信号传导、肿瘤发生、药物代谢、细胞黏附等相关;下调基因功能则主要与细胞间隙连接通讯、肿瘤抑制、补体免疫防御等相关;GIST相关基因c-kit(CD117)、CD34在两组间差异均无统计学意义;荧光定量PCR验证结果与芯片表达结果一致.结论 运用cDNA芯片进行基因表达谱分析,有助于探讨GIST复发、伊马替尼耐药机制并寻找新的治疗靶标.
- 闫竞一陈笑雷黄颖鹏韩少良周坤章圣辉
- 关键词:胃肠间质瘤CDNA微阵列复发伊马替尼
- 基于数学形态学分割方法的cDNA微阵列图像处理
- cDNA微阵列图像分析的目的是测量每个靶点的光亮度,靶点的光亮度在细胞中表现特定基因的数量,其测量结果直接影响到其后续分析研究。微阵列图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及信息抽取。本文利用数学形态学及形态学分割...
- 翁桂荣
- 关键词:CDNA微阵列数学形态学图像处理
- 文献传递
- 应用cDNA微阵列分析脊髓损伤后基因表达的差异
- 2010年
- 背景:基因芯片可以大规模地平行检测分析上千个基因的表达模式,克服了传统的一次实验仅能对单个或数个基因表达水平进行分析的局限。目的:应用含有1176条人类全长基因的cDNA表达谱芯片,对大鼠急性脊髓损伤模型中基因表达水平的变化进行动态观察。方法:雌性SD大鼠70只随机分成正常对照组、手术对照组、损伤4h,24h,3d,7d,10d组7组。损伤组切除T7、T8的椎板,并用钢棒从高处自由落下致脊髓损伤。手术对照组仅进行T7、T8椎板切除。正常组和各损伤组于伤后各时间段,手术对照组于术后3d取T6~T10段脊髓,提取总RNA,运用AtlasImageTM2.01软件(Clontech)对放射自显影基因表达谱进行分析,各个处理组与正常组相比,灰度值差异超过3倍的基因定为有表达差异。结果与结论:结果显示共有显著表达差异基因81条,其中表达上调的基因有46条,表达下调的基因有35条,并在国内外首次观察到神经激肽B、神经肽Y、垂体后叶加压素V2受体等数个基因在脊髓损伤中的变化。结果表明利用基因芯片技术结合实验动物模型能大规模、高通量地观察急性脊髓损伤继发性损伤的基因表达谱,筛选疾病相关基因,对进一步阐明疾病在基因水平上的发病机制,有重要的意义。
- 强华周严刘瑾陈雄生黄晓伟张斌阴彬袁建刚贾连顺
- 关键词:急性脊髓损伤基因表达谱CDNA微阵列基因芯片
- 基于数学形态学分割方法的cDNA微阵列图像处理
- cDNA微阵列图像分析的目的是测量每个靶点的光亮度,靶点的光亮度在细胞中表现特定基因的数量,其测量结果直接影响到其后续分析研究。微阵列图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及信息抽取。本文利用数学形态学及形态学分割...
- 翁桂荣
- 关键词:CDNA微阵列数学形态学
- 文献传递
- cDNA微阵列分析穿刺手术所致BALB/c小鼠肝损伤基因表达谱变化
- 2010年
- 目的分析肝穿刺术后BALB/c小鼠肝脏基因表达谱的变化。方法10只BALB/c随机分为两组;实验组和正常组,每组各5只;实验组小鼠开腹直视下肝左叶注生理盐水,8天后采集肝组织标本并提取RNA,cDNA微阵列分析25 000个基因在实验组和正常组小鼠肝组织中的表达水平差异。结果肝穿刺术后共有82条差异基因,其中52条基因表达上调,30条基因表达下调;功能聚类可分为代谢、转录调节、转运、信号转导、炎症反应、细胞增殖与凋亡、细胞周期与细胞骨架及细胞粘附等8类。结论肝穿刺术所致小鼠肝脏基因表达谱发生的改变,涉及多个基因表达调控途径。
- 谢文娟吕国栋李瑶王红丽李静张传山王俊华卢晓梅马纪温浩林仁勇
- 关键词:CDNA微阵列肝脏穿刺
- cDNA微阵列分析BALB/c小鼠肝脑组织中差异性表达基因的研究被引量:1
- 2010年
- 目的分析BALB/c小鼠肝、脑组织差异基因表达谱。方法TRIZOL法提取总RNA,反转录cDNA,采用36K小鼠全基因组寡核苷酸芯片,运用荧光双交换方法分析BALB/c小鼠肝脑组织中mRNA转录本含量。经芯片扫描、图像采集后,运用MAS2.0软件对差异基因进行基因功能分析(GO)和KEGG通路分类。结果基因芯片结果表明与脑组织相比,在肝组织中共发现差异表达基因6 132个,其中包括上调基因2 974个,下调基因3 158个,GO分析上述差异表达基因主要涉及代谢、细胞信号转导、DNA结合与转录、细胞周期、细胞骨架、细胞粘附和发育等。KEGG信号通路分析显示:上调差异基因中71个通路的改变差异具有统计学意义(P<0.05),下调差异基因中有80个通路的改变差异具有统计学意义(P<0.05)。结论小鼠肝与脑组织基因表达谱的差异涉及多个基因表达调控途径,研究这些基因分子功能有助于深入了解各组织独特的功能表达系统。
- 谢文娟吕国栋曹琦李瑶卢晓梅马纪林仁勇温浩
- 关键词:CDNA微阵列小鼠基因
- 利用cDNA微阵列分离橡胶胶乳生物合成相关基因的研究
- 2009年
- 天然橡胶是中国重要的热带经济作物,关系到国计民生的重要战略物资。通过对橡胶叶与胶乳mRNA的提取,及其逆转录产物cDNA经Cy3、Cy5荧光染料标记后,进行芯片杂交,杂交数据经分析结果显示,在橡胶胶乳中表达上调达显著的基因有105个,其中表达极显著的基因有44个,包括elongation factor Tu(延伸因子基因),thioredoxin H-type1(硫氧还蛋白H型1基因),4个zinc finger(C3HC4-type RING finger)family protein(锌指蛋白基因)等。在橡胶叶中表达显著的基因有151个,其中表达极显著的有34个。研究结果对于发现橡胶胶乳表达相关基因有着重大的实践作用,对研究橡胶生物合成相关基因具有重要的参考作用,这将为研究橡胶生物合成机理奠定基础。
- 廖文彬周芳尹一伊彭明
- 关键词:MRNACDNA基因芯片
- 骨性关节炎大鼠软骨与滑膜基因表达的cDNA微阵列实验研究
- 2009年
- 目的研究骨性关节炎大鼠滑膜及软骨基因表达谱,探讨骨性关节炎与各种基因的相关性。方法选取12只Wistar种大鼠,随机分为骨性关节炎模型组和正常对照组,每组6只,骨性关节炎模型组进行骨性关节炎造模。采用cDNA微阵列技术,根据遗传学中心法则,利用基因互补配对原理,用含有588个基因的大鼠基因表达谱芯片从基因表达水平在同一载体上同时进行多基因检测,研究骨性关节炎模型组及正常对照组大鼠滑膜基因表达谱,动态、整体、定量地考察骨性关节炎发生发展过程中基因种类、数量的改变。结果骨性关节炎模型组12周时可见关节软骨失去光泽,呈灰黄色,软骨变薄、碎裂,滑膜充血水肿。正常对照组未出现明显的骨性关节炎表现。与正常对照组大鼠软骨及滑膜的基因表达谱相比,骨性关节炎模型组大鼠软骨与滑膜中的差异表达基因共有82个,主要基因种类包括生长因子类基因、免疫基因、细胞凋亡基因、生长发育基因、疾病相关基因、能量相关基因及其他基因;其中上调基因27个,下调基因55个。结论本研究在骨性关节炎大鼠软骨与滑膜中检测出的82个差异表达基因可能与骨性关节炎的发生相关,为进一步基因治疗骨性关节炎提供了重要讯息。
- 陈宏贤朱伟民王大平牛琼欧阳侃
- 关键词:软骨基因表达微阵列分析WISTAR
- 基于cDNA微阵列数据对乳酸菌生长及应激代谢转录组特征的研究被引量:1
- 2009年
- 应用本实验室编写的perl程序包将GEO数据库中乳酸菌生长、应激代谢相关实验数据和相应的基因组数据整合,构建易于本地查询和访问的MySQL数据库,利用该数据库研究乳酸菌在生长、衰亡及应对不利环境(如胆盐、过氧化氢、碳氮源饥饿)时的转录组特征,并利用MEME软件寻找到了各种情况下部分协同表达基因前导序列的共有motif,即潜在的调控蛋白作用位点。结果表明:除了胆汁和草酸铵对嗜酸乳杆菌细胞代谢特征的影响具有较高的一致性外,面对其他压力环境乳酸菌细胞的应激模式具有较大的差异,有着各自受到特异性诱导表达或抑制的基因群,但在各种情况下翻译(J)、脂类运输和代谢(I)、细胞内运输和分泌(U)相关因的转录水平变化都比较显著,特别是蛋白质翻译相关基因变化最为明显,说明细胞主要通过调控蛋白质翻译相关基因的种类和表达量来对细胞的状态进行调整。
- 李家鹏任琳田寒友乔晓玲
- 关键词:乳酸菌CDNA微阵列
- cDNA微阵列鉴定差异表达基因的可靠性分析被引量:2
- 2008年
- 应用马铃薯晚疫病水平抗性相关的1 009条表达序列标签(ESTs)所制备的cDNA微阵列和荧光信号Cy3,Cy5杂交系统,通过同一样品RNA的自身比较试验及与不同样品RNA的差异分析试验,对该技术的重复性和可靠性进行了验证分析。结果表明,在自身比较试验中,芯片杂交的假阳性率仅为0.79%,相关系数高达0.981 1;在差异分析试验中,同向标记、正反向标记、同一芯片内2个重复杂交结果的相关系数分别为0.966 0,0.889 5,0.980 2。研究结果证实,cDNA芯片技术具有高度的可靠性,可以鉴定出显著差异表达基因,并构建高质量的基因表达数据库,通过3次生物学重复和2次技术重复试验(采用正、反向标记)即可克服绝大部分试验误差。
- 王冰林柳俊李媛媛谢从华
- 关键词:CDNA微阵列差异表达基因可靠性
相关作者
- 梁清华

- 作品数:300被引量:777H指数:16
- 供职机构:中南大学湘雅医院
- 研究主题:痹肿消汤 滑膜 脑出血 胶原诱导性关节炎大鼠 肝阳化风证
- 游潮

- 作品数:732被引量:3,862H指数:27
- 供职机构:四川大学华西医院
- 研究主题:颅咽管瘤 颅内动脉瘤 预后 脑出血 胶质瘤
- 曾义

- 作品数:109被引量:218H指数:6
- 供职机构:四川大学华西医院
- 研究主题:胶质瘤 整合素 脑膜瘤 KI-67 SHG-44
- 蔡斌

- 作品数:39被引量:172H指数:6
- 供职机构:上海市第一人民医院
- 研究主题:子宫内膜癌 基因表达谱 子宫内膜肿瘤 CDNA微阵列 卵巢癌
- 王安宇

- 作品数:25被引量:101H指数:7
- 供职机构:中南大学湘雅医学院
- 研究主题:滑膜 痹肿消汤 CDNA微阵列 实验性关节炎大鼠 胶原诱导性关节炎大鼠