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基于线粒体全基因组结构的鱼类分子分类研究被引量:4
2022年
为明确鱼类的线粒体全基因组序列结构、寻找有效的种间鉴别分子标记,并剖析其系统发育信息,从而为鱼类的分类学、进化遗传学和种质鉴定提供参考依据,测定了5种鱼类(中国Pampus chinensis、灰P.cinereus、银P.argenteus、珍P.minor、翎P.punctatissimus)的线粒体全基因组序列,并结合NCBI数据库中已有的鱼类线粒体全基因组序列进行分析。结果显示:1)线粒体基因组全序列长度在16551 bp到18062 bp之间,其基因组结构与大多数硬骨鱼类一致;比较特别的是,银和镰具有两个tRNA;结构,珍出现ND1基因重排以及两个重复的D-loop结构。2)银与镰的D-loop区出现重复CSB3结构,灰与翎D-loop区出现重复TAS结构。3)ND2基因条形码及其微型条形码均可将鱼类区分开,可作为有效的鉴别分子标记。4)东海区的银与镰应为同一物种,灰可能为翎的同物异名。
闫永斌程起群
关键词:线粒体全基因组分子鉴定DNA条形码系统发育
海洋所揭示世界鱼类物种多样性和地理分布格局
2022年
近日,中国科学院海洋研究所鱼类分类与系统发育研究团队在世界科(Stromateidae)(Pampus)鱼类分类及地理分布格局研究方面获得新进展。该研究基于分子系统学和物种界定方法,综合分析了全球线粒体序列和分布数据,首次揭示世界鱼类物种多样性和地理分布格局。相关研究成果发表在Frontiers in Marine Science上。
关键词:鱼类分类鲳属分子系统学
鱼类形态学和遗传学研究
(Pampus)鱼类广泛分布于西太平洋一印度洋,是一类重要的经济鱼类,隶于鲈形目(Perciformes)、亚目(Stromateoidei)、科(Stromateidae),我国科鱼类中仅见。迄今为止,...
李渊
关键词:遗传学线粒体
鱼类的线粒体基因组演化及银的遗传多样 性分析
(Pampus argenteus)在中国各大海域(南海、东海、黄海及渤海)沿岸都广泛分布,但是随着捕捞量的逐年增加,消费需求的急剧增长,环境污染的不断恶化,银野生资源量不断减少,可捕捞量呈显著下降的趋势。本研究测...
孙丹丹
关键词:银鲳鲳属线粒体全基因组系统进化
文献传递
中国鱼类一新种(鲈形目,科)(英文)被引量:2
2013年
描述了分布于中国东南沿海的鱼类I新种,刘氏Pampuliuorumsp.nov.。与其它已知种比较,刘氏体为长椭圆形,个体大而强壮;背鳍具37~4l鳍条;臀鳍具36—40鳍条,前部鳍条延长超过尾柄;鳃耙退化,第1鳃弓上具8~12结节状鳃耙;脊椎骨38个;新鲜标本体为银灰色并带金黄色或铜蓝色金光泽。
刘静李春生
关键词:鲳属
3种鱼不同组织脂肪酸组成的比较研究被引量:11
2012年
3种野生鱼银(Pampus argenteus)、灰(Pampus cinereus)和中国(Pampus sinensis)样本于2010年3—4月采集于浙江东海海域,用GC/MS法分别对其肝脏和肌肉的总脂和脂肪酸组成进行了分析和评价,同时比较了野生和养殖银的脂肪酸组成。结果表明:3种鱼肝脏总脂平均值(19.95%)显著高于肌肉总脂平均值(11.69%)(P<0.05),灰肝脏和肌肉中的总脂含量显著高于银和中国(P鲳肌肉中的总脂含量显著高于养殖银(P鲳鱼肝脏中共检测出23种脂肪酸,肌肉中仅检测出13种脂肪酸。饱和脂肪酸(SFA)中都主要以C16∶0(棕榈酸)和C18∶0(硬脂酸)为主,单不饱和脂肪酸(MUFA)中主要为油酸(C18∶1n-9),油酸分布特点为银>中国>灰;肝脏的脂肪酸种类组成较丰富,MUFA含量中国>银>灰(P<0.05),多不饱和脂肪酸(PUFA)含量灰>银>中国(P<0.05);肌肉中MUFA含量银>灰>中国(P<0.05),PUFA含量3种鱼无显著差异(P>0.05)。EPA+DHA含量在3种鱼肌肉中无显著差异(P>0.05),但在中国肝脏未检测到EPA,在灰肝脏和中国肝脏和肌肉中未检测到DHA,而在银肝脏和肌肉组织中EPA和DHA均有分布,DHA含量分别达到13.99%和15.95%;野生银的油酸、EPA和DHA含量显著高于养殖银,PUFA含量是养殖银的1.53倍。由实验结果及与其它经济鱼类相比可知,3种鱼主要是以不饱和脂肪酸为主,在2种组织中平均占53.89%,EPA+DHA含量平均占PUFA的82.54%,这3种鱼具有很高的营养价值并且银更胜一筹,同时野生银品质优于养殖银,但不失为一种优良的养殖品种。
徐善良王丹丽徐继林严小军胡燕明
关键词:银鲳脂肪酸
基于COI部分序列探讨南海鱼类系统进化与种群遗传结构被引量:3
2012年
利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COI)部分序列研究了南海区鱼类(Pampus)银(P.ar-genteus)、珍(P.minor)和中国(P.chinensis)的系统进化与种群遗传结构。通过PCR扩增与序列测定获得了长度为643 bp的COI基因片段,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为25.4%、33.6%、18.9%和22.1%,A+T含量高于G+C含量。64条序列共定义了20种单倍型,包含152个变异位点,简约信息位点148个,单变异位点4个,产生169个点突变。结果表明,银与中国的遗传差异最小,银与珍的其次,而珍与中国的遗传差异最大,3种鱼类的遗传多样性均呈现较低的水平,应采取有效的保护措施,以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果为鱼类资源保护和合理开发利用提供必要的参考。
孙鹏尹飞施兆鸿彭士明
关键词:系统进化
利用COⅠ和Cytb序列探讨东海区3种鱼类的种群遗传结构被引量:14
2011年
通过对COⅠ和Cytb序列的分析,研究了银(Pampus argenteus)、灰(P.cinereus)和翎(P.punctatissimus)3种东海区重要鱼类群体的种群遗传结构。在62个鱼类样本中分别检出COⅠ和Cytb单倍型21个和27个,发现变异位点125个和176个。东海区的3种鱼类种群中,翎的单倍型多样性(h)与核苷酸多样性(Pi)水平均为最高(在COⅠ序列中分别为0.779和0.003 25,在Cytb序列中分别为0.847和0.003 33),而银和灰的h和Pi水平较低。FU’S FS中性检验和歧点分布分析结果显示,3种鱼类种群均经历了种群扩张现象。结果表明,3种鱼类均经历过种群瓶颈效应,处于瓶颈效应后的增长期,遗传多样性水平较低,应采取一些有效的保护措施,以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果可以为鱼类资源的合理开发利用和保护提供必要的参考。
孙鹏彭士明尹飞施兆鸿
关键词:细胞色素B种群遗传结构
东海常见鱼类的形态差异及系统进化关系探讨被引量:8
2011年
应用多变量形态度量学方法研究了中常见鱼类银、翎和中国的形态差异,同时对3种鱼线粒体DNA 16S rRNA基因序列差异进行了分析,并根据3种鱼的形态和分子数据对其系统进化关系进行了探讨。聚类分析表明,银和翎形态较为相似,而与中国形态差异较大。判别分析表明,3种鱼形态上存在着明显差异,利用4个形态参数就可以将3种鱼100%予以区分,同时利用该参数建立了3种鱼的判别公式。典型变量分析也表明3种鱼形态存在着一定的分化,变异部位主要集中在头部和尾部。不同的生活史及栖息环境可能是导致3种鱼形态差异的主要原因。在所测定的3种鱼线粒体DNA 16S rRNA部分基因序列中,共检测到40个变异位点,2个插入和缺失位点。3种鱼26个个体中共发现5种单倍型,利用单倍型构建的系统进化树显示翎和中国关系较近,而两者与银亲缘关系较远。利用多变量形态学数据所揭示的形态相似性并不能完全反映3种鱼的亲缘关系。
赵峰马春艳庄平章龙珍施兆鸿
关键词:鲳鱼线粒体DNARRNA
群体遗传多样性及鱼类分子系统进化关系
(Pampus argenteus)隶于鲈形目(Perciformes)、科(Stromateidae)、(Pampus),在我国诸海域均有分布,是我国重要的经济鱼种和潜在的增养殖对象。由于过度捕捞和栖息地生...
赵峰
文献传递

相关作者

刘静
作品数:62被引量:341H指数:13
供职机构:中国科学院海洋研究所
研究主题:鱼类 试剂盒 家系选育 鲳属 系统进化
施兆鸿
作品数:332被引量:1,646H指数:25
供职机构:中国水产科学研究院东海水产研究所
研究主题:银鲳 幼鱼 养殖 仔鱼 黄鲷
马春艳
作品数:232被引量:650H指数:16
供职机构:中国水产科学研究院东海水产研究所
研究主题:拟穴青蟹 青蟹 养殖 微卫星标记 系统进化
李显森
作品数:88被引量:803H指数:20
供职机构:中国水产科学研究院黄海水产研究所
研究主题:选择性 黄海中南部 小黄鱼 鳀鱼 南极磷虾
赵峰
作品数:518被引量:2,002H指数:24
供职机构:中国水产科学研究院东海水产研究所
研究主题:长江口 中华绒螯蟹 鱼类 中华鲟 盐度