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基于线粒体全基因组结构的鲳 属 鱼类分子分类研究 被引量:4 2022年 为明确鲳 属 鱼类的线粒体全基因组序列结构、寻找有效的种间鉴别分子标记,并剖析其系统发育信息,从而为鲳 属 鱼类的分类学、进化遗传学和种质鉴定提供参考依据,测定了鲳 属 5种鱼类(中国鲳 Pampus chinensis、灰鲳 P.cinereus、银鲳 P.argenteus、珍鲳 P.minor、翎鲳 P.punctatissimus)的线粒体全基因组序列,并结合NCBI数据库中已有的鲳 属 鱼类线粒体全基因组序列进行分析。结果显示:1)鲳 属 线粒体基因组全序列长度在16551 bp到18062 bp之间,其基因组结构与大多数硬骨鱼类一致;比较特别的是,银鲳 和镰鲳 具有两个tRNA;结构,珍鲳 出现ND1基因重排以及两个重复的D-loop结构。2)银鲳 与镰鲳 的D-loop区出现重复CSB3结构,灰鲳 与翎鲳 D-loop区出现重复TAS结构。3)ND2基因条形码及其微型条形码均可将鲳 属 鱼类区分开,可作为有效的鲳 属 鉴别分子标记。4)东海区的银鲳 与镰鲳 应为同一物种,灰鲳 可能为翎鲳 的同物异名。 闫永斌 程起群关键词:线粒体全基因组 分子鉴定 DNA条形码 系统发育 海洋所揭示世界鲳 属 鱼类物种多样性和地理分布格局 2022年 近日,中国科学院海洋研究所鱼类分类与系统发育研究团队在世界鲳 科(Stromateidae)鲳 属 (Pampus)鱼类分类及地理分布格局研究方面获得新进展。该研究基于分子系统学和物种界定方法,综合分析了全球鲳 属 线粒体序列和分布数据,首次揭示世界鲳 属 鱼类物种多样性和地理分布格局。相关研究成果发表在Frontiers in Marine Science上。关键词:鱼类分类 鲳属 分子系统学 鲳 属 鱼类形态学和遗传学研究鲳 属 (Pampus)鱼类广泛分布于西太平洋一印度洋,是一类重要的经济鱼类,隶属 于鲈形目(Perciformes)、鲳 亚目(Stromateoidei)、鲳 科(Stromateidae),我国鲳 科鱼类中仅见鲳 属 。迄今为止,... 李渊关键词:遗传学 线粒体 鲳 属 鱼类的线粒体基因组演化及银鲳 的遗传多样 性分析 银鲳 (Pampus argenteus)在中国各大海域(南海、东海、黄海及渤海)沿岸都广泛分布,但是随着捕捞量的逐年增加,消费需求的急剧增长,环境污染的不断恶化,银鲳 野生资源量不断减少,可捕捞量呈显著下降的趋势。本研究测... 孙丹丹关键词:银鲳 鲳属 线粒体全基因组 系统进化 文献传递 中国鲳 属 鱼类一新种(鲈形目,鲳 科)(英文) 被引量:2 2013年 描述了分布于中国东南沿海的鲳 科鲳 属 鱼类I新种,刘氏鲳 Pampuliuorumsp.nov.。与鲳 属 其它已知种比较,刘氏鲳 体为长椭圆形,个体大而强壮;背鳍具37~4l鳍条;臀鳍具36—40鳍条,前部鳍条延长超过尾柄;鳃耙退化,第1鳃弓上具8~12结节状鳃耙;脊椎骨38个;新鲜标本体为银灰色并带金黄色或铜蓝色金属 光泽。 刘静 李春生关键词:鲳属 3种鲳 属 鱼不同组织脂肪酸组成的比较研究 被引量:11 2012年 3种野生鲳 属 鱼银鲳 (Pampus argenteus)、灰鲳 (Pampus cinereus)和中国鲳 (Pampus sinensis)样本于2010年3—4月采集于浙江东海海域,用GC/MS法分别对其肝脏和肌肉的总脂和脂肪酸组成进行了分析和评价,同时比较了野生和养殖银鲳 的脂肪酸组成。结果表明:3种鲳 鱼肝脏总脂平均值(19.95%)显著高于肌肉总脂平均值(11.69%)(P<0.05),灰鲳 肝脏和肌肉中的总脂含量显著高于银鲳 和中国鲳 (P鲳肌肉中的总脂含量显著高于养殖银鲳 (P鲳鱼肝脏中共检测出23种脂肪酸,肌肉中仅检测出13种脂肪酸。饱和脂肪酸(SFA)中都主要以C16∶0(棕榈酸)和C18∶0(硬脂酸)为主,单不饱和脂肪酸(MUFA)中主要为油酸(C18∶1n-9),油酸分布特点为银鲳 >中国鲳 >灰鲳 ;肝脏的脂肪酸种类组成较丰富,MUFA含量中国鲳 >银鲳 >灰鲳 (P<0.05),多不饱和脂肪酸(PUFA)含量灰鲳 >银鲳 >中国鲳 (P<0.05);肌肉中MUFA含量银鲳 >灰鲳 >中国鲳 (P<0.05),PUFA含量3种鲳 鱼无显著差异(P>0.05)。EPA+DHA含量在3种鲳 鱼肌肉中无显著差异(P>0.05),但在中国鲳 肝脏未检测到EPA,在灰鲳 肝脏和中国鲳 肝脏和肌肉中未检测到DHA,而在银鲳 肝脏和肌肉组织中EPA和DHA均有分布,DHA含量分别达到13.99%和15.95%;野生银鲳 的油酸、EPA和DHA含量显著高于养殖银鲳 ,PUFA含量是养殖银鲳 的1.53倍。由实验结果及与其它经济鱼类相比可知,3种鲳 属 鱼主要是以不饱和脂肪酸为主,在2种组织中平均占53.89%,EPA+DHA含量平均占PUFA的82.54%,这3种鲳 鱼具有很高的营养价值并且银鲳 更胜一筹,同时野生银鲳 品质优于养殖银鲳 ,但不失为一种优良的养殖品种。 徐善良 王丹丽 徐继林 严小军 胡燕明关键词:银鲳 脂肪酸 基于COI部分序列探讨南海鲳 属 鱼类系统进化与种群遗传结构 被引量:3 2012年 利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COI)部分序列研究了南海区鲳 属 鱼类(Pampus)银鲳 (P.ar-genteus)、珍鲳 (P.minor)和中国鲳 (P.chinensis)的系统进化与种群遗传结构。通过PCR扩增与序列测定获得了长度为643 bp的COI基因片段,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为25.4%、33.6%、18.9%和22.1%,A+T含量高于G+C含量。64条序列共定义了20种单倍型,包含152个变异位点,简约信息位点148个,单变异位点4个,产生169个点突变。结果表明,银鲳 与中国鲳 的遗传差异最小,银鲳 与珍鲳 的其次,而珍鲳 与中国鲳 的遗传差异最大,3种鲳 属 鱼类的遗传多样性均呈现较低的水平,应采取有效的保护措施,以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果为鲳 属 鱼类资源保护和合理开发利用提供必要的参考。 孙鹏 尹飞 施兆鸿 彭士明关键词:系统进化 利用COⅠ和Cytb序列探讨东海区3种鲳 属 鱼类的种群遗传结构 被引量:14 2011年 通过对COⅠ和Cytb序列的分析,研究了银鲳 (Pampus argenteus)、灰鲳 (P.cinereus)和翎鲳 (P.punctatissimus)3种东海区重要鲳 属 鱼类群体的种群遗传结构。在62个鲳 属 鱼类样本中分别检出COⅠ和Cytb单倍型21个和27个,发现变异位点125个和176个。东海区的3种鲳 属 鱼类种群中,翎鲳 的单倍型多样性(h)与核苷酸多样性(Pi)水平均为最高(在COⅠ序列中分别为0.779和0.003 25,在Cytb序列中分别为0.847和0.003 33),而银鲳 和灰鲳 的h和Pi水平较低。FU’S FS中性检验和歧点分布分析结果显示,3种鲳 属 鱼类种群均经历了种群扩张现象。结果表明,3种鲳 属 鱼类均经历过种群瓶颈效应,处于瓶颈效应后的增长期,遗传多样性水平较低,应采取一些有效的保护措施,以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果可以为鲳 属 鱼类资源的合理开发利用和保护提供必要的参考。 孙鹏 彭士明 尹飞 施兆鸿关键词:细胞色素B 种群遗传结构 东海常见鲳 属 鱼类的形态差异及系统进化关系探讨 被引量:8 2011年 应用多变量形态度量学方法研究了鲳 属 中常见鱼类银鲳 、翎鲳 和中国鲳 的形态差异,同时对3种鲳 鱼线粒体DNA 16S rRNA基因序列差异进行了分析,并根据3种鲳 鱼的形态和分子数据对其系统进化关系进行了探讨。聚类分析表明,银鲳 和翎鲳 形态较为相似,而与中国鲳 形态差异较大。判别分析表明,3种鲳 鱼形态上存在着明显差异,利用4个形态参数就可以将3种鲳 鱼100%予以区分,同时利用该参数建立了3种鲳 鱼的判别公式。典型变量分析也表明3种鲳 鱼形态存在着一定的分化,变异部位主要集中在头部和尾部。不同的生活史及栖息环境可能是导致3种鲳 鱼形态差异的主要原因。在所测定的3种鲳 鱼线粒体DNA 16S rRNA部分基因序列中,共检测到40个变异位点,2个插入和缺失位点。3种鲳 鱼26个个体中共发现5种单倍型,利用单倍型构建的系统进化树显示翎鲳 和中国鲳 关系较近,而两者与银鲳 亲缘关系较远。利用多变量形态学数据所揭示的形态相似性并不能完全反映3种鲳 鱼的亲缘关系。 赵峰 马春艳 庄平 章龙珍 施兆鸿关键词:鲳鱼 线粒体DNA RRNA 银鲳 群体遗传多样性及鲳 属 鱼类分子系统进化关系 银鲳 (Pampus argenteus)隶属 于鲈形目(Perciformes)、鲳 科(Stromateidae)、鲳 属 (Pampus),在我国诸海域均有分布,是我国重要的经济鱼种和潜在的增养殖对象。由于过度捕捞和栖息地生... 赵峰文献传递
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刘静 作品数:62 被引量:341 H指数:13 供职机构:中国科学院海洋研究所 研究主题:鱼类 试剂盒 家系选育 鲳属 系统进化 施兆鸿 作品数:332 被引量:1,646 H指数:25 供职机构:中国水产科学研究院东海水产研究所 研究主题:银鲳 幼鱼 养殖 仔鱼 黄鲷 马春艳 作品数:232 被引量:650 H指数:16 供职机构:中国水产科学研究院东海水产研究所 研究主题:拟穴青蟹 青蟹 养殖 微卫星标记 系统进化 李显森 作品数:88 被引量:803 H指数:20 供职机构:中国水产科学研究院黄海水产研究所 研究主题:选择性 黄海中南部 小黄鱼 鳀鱼 南极磷虾 赵峰 作品数:518 被引量:2,002 H指数:24 供职机构:中国水产科学研究院东海水产研究所 研究主题:长江口 中华绒螯蟹 鱼类 中华鲟 盐度