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药用植物DNA条形码与分子标记技术的研究进展被引量:1
2024年
目的对药用植物DNA条形码技术和分子标记技术的研究进展进行综述,为药用植物鉴定、遗传育种及种质资源保护的进一步研究奠定基础。方法查阅总结近年来国内外文献,对DNA条形码技术和分子标记技术的特征、种类及在药用植物中的应用情况进行总结。结果DNA条形码和分子标记技术已经被广泛应用于药用植物中。DNA条形码技术能够迅速且精确地对药用植物进行鉴定,克服了传统鉴别方式的缺陷;分子标记技术则以其操作简便、敏感度高、结果精确等优势,在促进药用植物的科学研究中获得了广泛的应用。结论DNA条形码和分子标记技术的出现对药用植物的鉴定产生了积极的影响,为种质资源的保护、鉴定、亲缘关系分析和遗传进化提供了依据,随着科技的不断进步,DNA条形码和分子标记技术也将不断精确,并对中医药现代化产生更加深远的影响。
张占平陆佳欣徐姣任伟超王震马伟刘秀波
关键词:生物技术DNA条形码分子标记药用植物分子鉴定
中国常见水生植物DNA条形码研究
杨文浩
风毛菊属(菊科)植物DNA条形码的分子鉴定研究
风毛菊属(Saussurea)隶属于菊科(Asteraceae)菜蓟族(Cardueae),物种丰富,全世界约500余种,我国约350余种,包含许多极具药用价值的珍稀物种,如雪莲(S.involucrata)、水母雪兔子...
何佳忆
关键词:风毛菊属DNA条形码物种鉴定
长江河口潮滩湿地种子植物DNA条形码研究和超微结构初步研究
长江口是一个特大型淤泥质的三角洲河口,受上游江水和下游海水相互作用的影响,区域水体和滩涂湿地的温度、盐度、p H和溶解氧等理化因子不断变化,为该区域丰富的生物多样性奠定了基础。准确的物种鉴定是进行生命科学研究的前提。DN...
张仕兰
关键词:植物DNA条形码物种鉴定超微结构
基于植物DNA条形码rbcLa序列的日本条螽食谱分析被引量:1
2023年
日本条螽Ducetia japonica广泛分布于我国绝大部分区域,并在城区绿地大量发生。据此假设其食物谱可能具有较高的物种多样性,但目前对其在自然环境下取食的植物种类仍缺乏了解。本研究对来自河北保定城区绿地和城郊荒地两种生境共计75头日本条螽肠道内容物进行DNA提取、rbcLa基因片段扩增及测序,并利用BOLD和NCBI数据库进行分类鉴定。结果显示:日本条螽在野外至少取食10科、13种植物。在城区绿地和城郊荒地两种生境中,取食频率最高的植物分别是卫矛科冬青卫矛Euonymus japonicus(47.37%)和大麻科葎草Humulus scandens(81.08%)。只有1条rbcLa基因序列未鉴定至种级水平,表明利用植物DNA条形码rbcLa基因序列可对植食性昆虫取食的植物种类进行快速鉴定。同时,研究结果也初步证实日本条螽的食物谱包含较高的物种多样性,为城市绿地螽斯类鸣虫保护和繁育提供依据。
王慧赵一铮黄慧敏周志军
关键词:植物DNA条形码
石斛属植物DNA条形码鉴定及铁皮石斛产地分析被引量:2
2023年
为建立石斛属植物适合的DNA条形码以及利用条形码鉴定铁皮石斛产地,对鼓槌石斛、报春石斛、金钗石斛、铁皮石斛4种石斛以及杭州、霍山、云南和温州4个产地的铁皮石斛的66份样品的ITS2和psbA-trnH序列进行扩增、测序及序列分析。比较石斛属植物种内、种间的变异,基于K2P距离分析Barcoding Gap,构建NJ系统发育树。结果表明,ITS2序列种内遗传变异(0~0.005)小于种间遗传变异(0.070~0.228),NJ进化树也能准确区分4种石斛;而psbA-trnH序列未形成Barcoding Gap,NJ进化树未能区分报春石斛和金钗石斛,psbA-trnH序列在鉴定石斛属植物时可作为补充序列。ITS2序列和psbA-trnH序列在4种产地铁皮石斛中存在多个变异位点,可鉴别铁皮石斛产地。
鄢珊珊沈斌国赵海莹丁艳菲朱诚
关键词:石斛属铁皮石斛DNA条形码
西藏地区紫堇属植物DNA条形码鉴定
2023年
目的:以ITS2序列和psbA-trnH序列作为DNA条形码,对西藏地区紫堇属植物进行分子鉴定。方法:通过比较两条序列的扩增成功率和测序成功率,分析序列特征,计算种内和种间的遗传距离,构建Neighbor-joining进化树,评价两条序列的鉴定效率。结果:两条序列的扩增成功率和测序成功率均为100%。psbA-trnH序列的最大种内遗传距离均小于最小种间遗传距离,符合DNA条形码对遗传距离的要求。系统进化树分析中,psbA-trnH序列能够有效地区分不同来源的紫堇属植物,而ITS2序列聚类效果较差。结论:psbA-trnH序列具有较高的鉴定效率,可作为西藏地区紫堇属植物物种鉴定的DNA条形码。该研究为西藏地区紫堇属植物的基因组学的深入研究夯实了基础,也为西藏紫堇属藏药的质量监控提供了新的方法。
杨冬璠赵丽萍汪圣旦增顿珠徐福春
关键词:DNA条形码ITS2PSBA-TRNH
黄芪属植物DNA条形码与聚类分析的研究被引量:12
2022年
目的通过分析吉林产10种黄芪属植物的ITS2、matk、rbcL、psbA条形码序列,为黄芪属植物的物种分类鉴定及其亲缘关系提供理论依据。方法共收集30份样品,以ITS2、matk、rbcL和psbA作为条形码序列,对黄芪属10种植物提取基因组DNA、PCR扩增并进行双向测序。所得序列结果经校正处理后,并对其进行聚类分析。结果ITS2、matk、rbcL和psbA4种片段,单独的每一种片段并不能将10种植物全部鉴别出来,只能鉴别出部分植物,即蒙古黄芪A.membranceus var.mongholicus、扁茎黄芪A.complanatus、糙叶黄芪A.scaberrimus、华黄芪A.chinensis、草木樨黄芪A.melilotoides、细叶黄芪A.angustissimus、兴安黄芪A.dahuricus、新巴黄芪A.hsinbaticus;由聚类分析结果可知,以锦鸡儿Caraganasinica为外类群,10种植物中,华黄芪为单独1支,细叶黄芪与扁茎黄芪聚为1支,糙叶黄芪、斜茎黄芪与新巴黄芪聚为1支,膜荚黄芪A.membranceu、蒙古黄芪与草木樨黄芪聚为1支,并且这3者与兴安黄芪关系较近。结论ITS2+rbcL+psbA组合可以将8种黄芪属植物鉴别出来。聚类分析结果显示10种黄芪属植物被划分为5支,该聚类分析结果与《中国植物志》中10种黄芪属植物的传统分类相一致。
常晶茹姚萱航张雪薇周仪刘翠晶刘霞
关键词:黄芪属DNA条形码聚类分析膜荚黄芪
濒危龙树科植物DNA条形码鉴定方法被引量:6
2021年
为了建立濒危龙树科植物DNA条形码鉴定方法,本研究选取rbc L、mat K、ycf1b等3对引物对9种21份龙树科植物进行DNA提取、序列扩增及产物测序,比较序列扩增效率和测序成功率;应用DNASTAR Lasergene软件对测得的双向序列进行拼接;使用MEGA-X软件进行序列比对,分析种内和种间变异;使用邻接法构建系统聚类树。结果表明,ycf1b序列可以区分龙树科4个属的植物,聚类效果好,种间存在可靠序列差异,可作为龙树科植物DNA条形码鉴定的有效序列片段。
李井干吴晶刘晓宇许忠祥李洋郭静伏建国杨晓军
关键词:DNA条形码物种鉴定基因片段
稗属植物DNA条形码研究被引量:1
2021年
为评估DNA条形码在稗属植物鉴定中的有效性,选取核DNA条形码序列ITS和ETS及叶绿体DNA条形码序列psbA、trnL-F和matK作为候选序列进行了分析。本研究对无芒稗、稗、长芒稗和细叶旱稗4种稗属植物的不同DNA条形码序列进行了扩增、测序,并分析了不同候选条形码序列的特征。结果显示,matK序列变异位点占比最高(3.6%),ETS序列最低(1.7%);psbA序列种间变异最大,matK序列种内变异最大;邻接树分析显示,条形码序列ITS、ETS、psbA、trnL-F和matK均可以区分出长芒稗,支持率均大于80%;此外,ITS序列将无芒稗和稗聚于同一支,可以区分出细叶旱稗。因此,建议ITS作为鉴别稗属植物潜在的DNA条形码序列。
袁国徽田志慧李涛钱振官沈国辉
关键词:田间杂草ETSPSBATRNL-FMATK

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李德铢
作品数:217被引量:3,018H指数:23
供职机构:中国科学院昆明植物研究所
研究主题:英文 竹亚科 测序 果实 离体保存
陈士林
作品数:850被引量:8,801H指数:48
供职机构:中国中医科学院中医药信息研究所
研究主题:DNA条形码 药用植物 中药材 产地适宜性 ITS2
王红
作品数:116被引量:469H指数:11
供职机构:中国科学院昆明植物研究所
研究主题:探针 引物 花粉形态 英文 实时荧光定量PCR
葛学军
作品数:52被引量:809H指数:15
供职机构:中国科学院华南植物园
研究主题:植物 遗传多样性研究 蒲公英属 植物DNA条形码 DNA条形码
罗焜
作品数:32被引量:987H指数:14
供职机构:中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所
研究主题:ITS2 DNA条形码 分子鉴定 条形码 药用植物