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一种用于检测水稻MITE转座子插入位点的引物组合及其应用: 本发明涉及分子生物学领域，具体涉及一种用于检测水稻MITE转座子插入位点的引物组及其应用。所述引物组包括16条特异性引物，序列如SEQ ID NO:11‑26所示；利用上述引物组中的任意单个引物或任意几条引物的混合组合，...; 程溪柳吕明杰刘君

一种鉴定转基因元件插入位点的方法: 本发明公开了一种鉴定转基因元件插入位点的方法，涉及生物技术领域。本发明的鉴定转基因元件插入位点的方法不需要进行基因组片段化、接头连接或生物素标记，而是利用体外转录的方法，将插入位点的侧翼序列信息转换成RNA，然后通过DN...; 夏凡女贺雄雷刘科辉

一种农杆菌T-DNA在植物基因组上插入位点的检测方法: 本发明公开了一种农杆菌T‑DNA在植物基因组上插入位点的检测方法，包括以下步骤：将T‑DNA基因组和植物基因组进行序列合并，得到合并基因组G；对合并基因组G进行测序读段序列比对，得到具有比对结果的SAM文件；对具有比对结...; 倪帅孔华磊李瑞何峰阚科佳朱凤娇王玉珏侯宇宸王威吴宁

一种微生物基因组插入位点的筛选方法和应用: 本发明公开了微生物基因组插入位点的筛选方法和应用。通过所述方法本发明在嗜盐单胞菌基因组中筛选到了21个插入位点，可以用于外源基因的稳定整合及表达，特别是对高价值化合物生物合成途径的稳定整合及表达，具有很好的效果。本发明开...; 叶健文林艺娜陈婷婷李浩吕金艳司徒卫余柳松

用于分离Opie转座子插入位点基因组序列的引物组合和方法: 本发明属于分子生物学领域，提供一种用于分离Opie转座子插入位点基因组序列的引物组合和方法，具体为基于NGS测序的Opie全基因组位点高效检测引物和方法，所述引物是Opie1‑inner、Opie1‑outer和Opie...; 程溪柳刘君吕明杰

一种鉴定转基因植物T-DNA插入位点的方法: 本发明提供了一种鉴定转基因植物T‑DNA插入位点的方法，该方法包括：提取基因组DNA；利用Tn5转座酶切割基因组DNA；分别利用四对PCR引物和测序接头引物进行两轮PCR扩增；利用磁珠对第二轮扩增产物进行回收；利用高通量...; 徐盛春陶晓园冯守礼徐利芝杨淑琪杨翀

新EHV插入位点UL43: 本发明涉及(载体)疫苗领域，且尤其涉及新型EHV插入位点UL43。本发明还涉及相关的表达盒和载体，其适于表达感兴趣的基因，尤其是抗原编码序列。本发明的病毒载体可用于产生免疫原性组合物或疫苗。; A·蒙特A·加列K·雷米特

一种检测腺相关病毒插入位点的方法及其应用: 本发明涉及一种检测腺相关病毒插入位点的方法及其应用。所述方法包括文库构建、插入位点扩增和高通量测序，通过两轮PCR反应将目的片段扩增富集。本发明设计腺相关病毒插入位点的检测方法，包括设计插入位点富集扩增引物、扩增体系、反...; 张亚飞高扬庞震国于永娟王方杰

ISDT:一种基于高通量测序数据的外源序列插入位点检测工具: 2024年; 精准识别外源序列插入位点对于转基因研究、基因编辑研究及疾病机制探索等领域至关重要。随着高通量测序技术的快速发展和广泛应用,越来越多的研究者将高通量测序技术应用到插入位点分析研究中来,深入探索外源序列插入事件。基于这样的背景,本文开发一款基于高通量测序数据的外源序列插入位点精准识别检测工具(insertion sites detection tool,ISDT),该工具引入了一种新颖的外源序列插入位点精准识别算法,该算法的核心是基于滑动打断候选read的比对和4种模式检索(Forward-Reverse模式、Reverse-Forward模式、Forward-Forward模式和Reverse-Reverse模式)从而实现精准识别插入位点。为评估该插入位点检测工具的性能,我们不仅采用不同插入类型(包括单点插入类型、单个外源片段插入类型、外源性同源片段插入类型、不同染色体上的外源性片段插入类型、不同染色体上的外源性同源片段插入类型)的模拟数据和植物T-DNA、动物F8基因的真实数据进行了全面的测试,还将该检测工具和发表的分析方法进行了比较,本工具均展现了出色的准确性和灵敏度。本文开发的检测工具作为一种高效、准确的插入位点检测工具,其跨物种的适用性及对真实复杂数据的处理能力,为未来的转基因研究、基因编辑研究及疾病机制探索等提供了重要的支持,有着广阔的应用前景。; 张镇杨芊茹杜含笑李雨桐陆晨琪姜宁; 关键词：高通量测序插入位点

基于重测序鉴定GbTMEM214基因在陆地棉基因组的插入位点: 2024年; 【目的】利用农杆菌介导法获得了转GbTMEM214基因陆地棉品系,旨在明确转基因棉花株系中T-DNA插入位点的序列特征及检测方法,为其生物安全评价提供依据。【方法】基于基因组重测序技术,利用BLASTn将测序数据与陆地棉TM-1基因组序列进行比对分析,设计特异性引物通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)验证插入位点。【结果】携带目标基因GbTMEM214的T-DNA整合在陆地棉基因组D13号染色体57019068~57019106 bp,T-DNA插入导致受体基因组37 bp的片段缺失;通过PCR扩增获得携带GbTMEM214基因的T-DNA插入位点的侧翼序列,由此建立了转GbTMEM214基因棉花的特异性检测方法。【结论】基于基因组重测序技术获得了转GbTMEM214基因棉花的T-DNA插入位点及侧翼序列信息,可为转基因棉花的生物安全评价提供技术参考。; 程俊凌赵亮徐剑文刘剑光徐鹏徐珍珍郭琪王月平赵君沈新莲陈全家肖松华; 关键词：转基因棉花插入位点侧翼序列

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