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一种中国枪乌贼微卫星位点及其应用: 本发明涉及一种生中国枪乌贼微卫星位点及其应用，15个微卫星位点，其核苷酸序列分别为SEQ ID NO：1‑15。从这些微卫星位点上设计的引物对的序列为SEQ ID NO：16‑45。本发明从中国枪乌贼基因组DNA中筛选出...; 徐磊王雪辉杜飞雁宁加佳王亮根李亚芳刘双双黄德练唐鹊辉

预测MSI状态的微卫星位点、系统及试剂盒: 本发明公开了一种预测MSI总体状态的标记微卫星位点、系统及试剂盒，属于MSI检测技术领域。本发明通过已知微卫星位点建立回归模型，预测22个标记微卫星位点的稳定性，进一步建立机器学习模型建立MSI总体状态。利用本发明，通过...; 裘迈宁陈丽衫郎秋蕾韩斐然

一种用于二代测序数据的微卫星位点筛选装置: 本发明涉及微卫星检测技术领域，尤其涉及一种用于二代测序数据的微卫星位点筛选装置。其技术方案包括底板、承载筒、调节结构、转运结构和夹持结构，所述转运结构包括电机，所述电机上端设置有转盘，所述转盘上方设置有承载筒，所述夹持结...; 王思振

一种构建标记微卫星位点稳定性预测模型的方法: 本发明公开了一种构建标记微卫星位点稳定性预测模型的方法，属于MSI检测技术领域。本发明通过已知微卫星位点建立回归模型，预测22个标记微卫星位点的稳定性。利用本发明的方法获得标记微卫星位点的稳定性数据，可进一步建立机器学习...; 裘迈宁陈丽衫郎秋蕾韩斐然

蒙古莸叶绿体基因组微卫星位点分析及引物筛选: 2024年; 本研究旨在为蒙古莸在分子水平上提供理论依据,以便对濒危稀有种制定科学的保护策略。本研究下载GenBank数据库公布的蒙古莸叶绿体基因组信息,利用生物信息学对蒙古莸叶绿体基因组进行cpSSR分析。利用MISA软件全面搜索蒙古莸叶绿体基因组SSR分子标记,并对其分析;运用Primer Premier 3.0设计并筛选多态性较好的引物用于后续研究。在全长151 707 bp的蒙古莸叶绿体基因组中,共鉴定出31个cpSSR位点,位点间平均分布距离为4 893.77 bp,其中以单核苷酸重复为主,且主要分布于LSC区,占SSR位点总数的74.19%;其次是四核苷酸重复,分布于LSC及SSC两区,占SSR位点总数的19.35%,分布最少为三核苷酸,仅占总位点数的3.23%。将所有31个位点合成31对叶绿体微卫星引物,通过毛细管电泳检测,最终筛选出8对多态性引物。此外,挑选多态性好的马鞭草EST-SSR引物,扩增结果产生非特异性条带,且与马鞭草扩增片段范围相差较大。基于软件的参数设置,单核苷酸重复数量占比最多,三核苷酸重复占比最少;从31对引物筛选出8对多态性引物,扩增率达100%,多态率为26%;此外,马鞭草与蒙古莸的扩增条带范围相差较大,说明二者有较大差异的遗传背景。在此基础上,本研究为后续蒙古莸的种质鉴定、系统发育、群体遗传进化分析提供理论依据。; 刘雅璐叶冬梅包文泉林涛范宇阳张素毓; 关键词：叶绿体基因组 SSR分子标记微卫星引物

中国虎纹蛙多碱基重复微卫星位点的多态性: 2024年; [目的]筛选出中国虎纹蛙高质量多态性的微卫星标记,用于该物种的鉴定以及遗传多样性、种群结构、遗传连锁图谱分析。[方法]利用新一代测序技术,从中国虎纹蛙部分基因组中筛选出33个三核苷酸重复、42个四核苷酸重复和1个五核苷酸重复微卫星位点,共76个多碱基重复微卫星位点。所有位点对浙江丽水学院两栖爬行动物实验室人工饲养的种群(n=30)进行了扩增和基因型分析。[结果]每个位点观察到的等位基因数和多态信息含量(PIC)的平均值分别为4个(2~7个)和0.514(0.164~0.822),观测杂合度(H_(O))和期望杂合度(H_(E))分别为0.00~0.97和0.18~0.82。有2个位点(THC141和THC377)显著偏离哈迪温伯格平衡,在11个位点中发现了显著的连锁不平衡。[结论]这些新筛选的多态性微卫星标记有助于进一步研究中国虎纹蛙的遗传多样性和开展遗传育种,为制定有效的保护策略和开展分子辅助选择提供依据。; 乔芬邵伟伟马力林植华韦力; 关键词：分子标记多态性

一种微卫星位点筛选分析方法、系统、计算机设备及介质: 本发明提供了一种微卫星位点筛选分析方法、系统、计算机设备及介质，所述方法为根据预设基因组组装级别获取目标物种的若干个基因组数据，通过trf软件对其中的参考基因组数据进行处理，得到预处理参考基因组数据后，采用预设脚本程序进...; 孙宏钰乌日嘎李燃刘佳俊耿姣姣

一种解脂耶氏酵母微卫星位点及其检测方法和应用: 本公开涉及一种解脂耶氏酵母微卫星位点及其检测方法和应用。具体地，涉及一种解脂耶氏酵母微卫星位点、一种用于扩增解脂耶氏酵母微卫星位点的引物组、一种用于检测解脂耶氏酵母微卫星位点的试剂盒、解脂耶氏酵母微卫星位点及其检测方法在...; 郁谨菡赵颖徐英春郭莉娜罗征宇李琰冰康巍

应用微卫星位点分析3个封闭群比格犬群体遗传结构: 2024年; 目的采用比格犬微卫星位点对多地小型比格犬群体进行遗传检测和群体结构分析,并评价所选位点是否适用于封闭群比格犬遗传质量控制。方法选取前期验证的微卫星位点20个,采用其已优化的PCR条件,对来自3个公司(西安、北京和江苏)的小型比格犬群体进行PCR扩增和STR扫描,经基因分型后计算群体遗传参数并进行群体遗传结构分析。结果西安、北京和江苏三地小型比格犬群体在20个微卫星位点的平均有效等位基因数分别为5.45、6.80、6.10,平均杂合度为0.5852、0.6538、0.6631,香农指数为1.1774、1.3844、1.3498,多态性信息含量分别为0.5397、0.6147、0.6181,说明三群体遗传多态性信息丰富,群体遗传多样性高。所选20个微卫星位点既能反映群体多态性,又能体现各群体的特征。结论3个比格犬群体的多态性较高,达到了封闭群要求。所选20个微卫星位点比较适合用于比格犬遗传质量检测。; 蒋辉李银银李长龙霍学云郭萌陈振文李胜利吕建祎杜小燕; 关键词：比格犬微卫星DNA 群体遗传结构遗传信息

林麝微卫星位点组合、引物组合、试剂盒及亲权鉴定应用: 本发明涉及林麝微卫星标记技术，具体涉及一种林麝引物组合、试剂盒及亲权鉴定应用，其目的是解决现有采用微卫星标记位点技术进行林麝基因鉴定中存在鉴定结果不够准确的技术问题，提供一种林麝引物组合、试剂盒及亲权鉴定应用，通过采用四...; 郭松涛马酉寅钟凌贺树军吴帆吴晓英藏旭峰高淇

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