搜索到523篇“ 小牛胸腺DNA“的相关文章
- 三种糖基化中间产物与小牛胸腺DNA相互作用的多光谱和分子动力学模拟
- 2023年
- 三种α-二羰基化合物:丙酮醛(MGO)、丁二酮(DA)和乙二醛(GO)作为常见的高反应活性的糖基化中间体,会对体内的生物大分子(如DNA)造成损伤。MGO、DA和GO与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用特性通过多光谱方法结合计算机模拟技术进行测定。紫外光谱分析表明,范德华力和氢键驱动MGO、DA和GO与ctDNA发生自发结合,分子动力学模拟中的各能量分布佐证了这一结论。在25℃下,MGO、DA和GO与ctDNA的结合常数接近经典的凹槽结合剂,其值分别为2.99×103、1.96×103和1.05×103L·mol-1。NaCl、单双链DNA、热变性、粘度和园二色谱实验证明了MGO、DA和GO与ctDNA均通过凹槽方式结合。分子对接直观显示了MGO、DA和GO是结合在DNA富含AT的小沟区,其中DT7和DA18是结合的活性位点。分子动力学模拟显示MGO-ctDNA复合物较游离ctDNA有更高的均方根偏差(RMSD)、回旋半径(Rg)和均方根波动(RMSF)值,说明MGO的结合使DNA结构部分松散,稳定性减弱。凝胶电泳实验表明,在赖氨酸和Cu2+存在下,MGO、DA和GO均能损伤质粒DNA,MGO和GO甚至会完全破坏DNA的超螺旋形态。
- 吴健妹张国文
- 关键词:小牛胸腺DNA相互作用分子动力学模拟
- 咪唑喹啉衍生物与小牛胸腺DNA作用机理研究被引量:1
- 2022年
- 对于咪唑喹啉衍生物(IQDs)与小牛胸腺脱氧核糖核酸(CT-DNA)的相互作用机理,采用荧光光谱法、黏度法、热变性研究和琼脂糖凝胶电泳法等实验技术进行研究。实验结果显示,咪唑喹啉衍生物Ⅰ以嵌插模式与CT-DNA作用,衍生物Ⅱ以沟槽模式与CT-DNA作用,且衍生物Ⅰ与CT-DNA的作用强于衍生物Ⅱ,而衍生物Ⅲ几乎不与CT-DNA发生作用。利用Gaussian 98量子化学程序包构建并优化3种衍生物分子模型,在HF/6-31G基组水平上进行计算,量子化学理论计算结果表明大环C9位上的取代基对结合模式和强度起着关键作用,与实验结果一致。
- 王炜祺陈昌云许小青鲍真真钟嫄吴洁
- 关键词:小牛胸腺DNA荧光光谱琼脂糖凝胶电泳量子化学计算
- 光谱法研究替诺昔康与小牛胸腺DNA相互作用被引量:1
- 2020年
- 目的研究替诺昔康与小牛胸腺DNA(ctDNA)之间的相互作用。方法借助紫外光谱和荧光光谱考察了替诺昔康与ctDNA之间的相互作用,同时通过热变性研究、黏度法试验考察了替诺昔康与ctDNA的相互作用模式。结果ctDNA加入使替诺昔康紫外光谱出现轻微减色效应,且随着ctDNA浓度的增大,减色效应变强;替诺昔康的加入使ctDNA-盐酸小檗碱发生荧光猝灭,且其猝灭程度具有浓度相关性。替诺昔康对于ctDNA溶液的黏度和热变性温度影响不大。结论替诺昔康与ctDNA是以沟槽方式结合,并且替诺昔康可以使ctDNA-盐酸小檗碱发生静态荧光猝灭。
- 马喆
- 关键词:替诺昔康小牛胸腺DNA相互作用
- 三唑联嘧啶脲类衍生物的合成、除草活性及其与小牛胸腺DNA相互作用的研究
- 三唑及嘧啶类衍生物自然界范围很广,很多药物中间体的骨架都有它们的结构。它们具有广泛的生物活性和药理活性,如除草、抗病毒、抗菌、抗肿瘤等。因此,有关三唑和嘧啶化合物的合成和生物活性研究长期以来一直是化学界和生物界学者们研究...
- 熊超鹏
- 关键词:除草活性小牛胸腺DNA乙酰乳酸合成酶
- 文献传递
- 原儿茶酸与小牛胸腺DNA的沟槽结合
- 2019年
- 利用荧光光谱法和分子模拟技术,并结合DNA单双链、盐效应、熔点和粘度测量等实验,研究了生理酸度条件下(pH7.4)原儿茶酸与小牛胸腺DNA(ctDNA)的结合性质和结合模式。结果表明,ctDNA能够结合原儿茶酸,并通过静态方式猝灭原儿茶酸的内源荧光,两者的结合常数在103 L·mol^-1数量级,氢键和疏水作用是原儿茶酸与ctDNA结合的主要驱动力。原儿茶酸的加入没有明显改变ctDNA的熔点和粘度,单链ctDNA猝灭原儿茶酸荧光的能力大于双链ctDNA,并且NaCl浓度的增加对原儿茶酸-ctDNA复合物的荧光强度没有明显的影响,表明原儿茶酸与ctDNA主要通过沟槽模式结合。分子模拟显示原儿茶酸的结合位点在ctDNA的小沟区,且与碱基胸腺嘧啶(T)形成氢键。分子模拟结果进一步确证了二者之间的沟槽作用模式。
- 洪鑫月周智圣杨晨曦黄德辉杨春华梁恩霞张国文
- 关键词:原儿茶酸小牛胸腺DNA分子模拟
- 苯磺酰三唑联嘧啶衍生物的合成、除草活性及其与小牛胸腺DNA相互作用的研究
- 三唑及嘧啶类衍生物广泛存在于自然界中,众多的药物中间体都有这样的骨架。它们具有广泛的生物活性和药理活性,如杀虫、杀菌、除草、抗代谢、抗肿瘤等。因此,有关三唑和嘧啶化合物的合成及生物活性研究一直是化学界和生物界学者们关注的...
- 孙毅
- 关键词:小牛胸腺DNA除草活性
- 文献传递
- 邻菲啰啉并1,2,4-三嗪钴(Ⅲ)配合物的合成及其对小牛胸腺DNA的荧光识别被引量:3
- 2019年
- 在4个邻菲啰啉并1,2,4-三嗪新型配体分子(ARTP1~ARTP4)合成的基础上,通过ARTP1~ARTP4与Co^(3+)配位,制备了4个钴(Ⅲ)配合物(Co-ARTP1~Co-ARTP4)。通过傅里叶变换红外光谱仪(FT-IR)、核磁共振波谱仪(NMR)和高分辨质谱(HRMS)仪和紫外-可见分光计(UV-Vis)等技术手段表征了ARTP1~ARTP4和Co-ARTP1~Co-ARTP4的结构和性能。结果表明,配合物的紫外吸收峰中出现减色效应,最大吸收峰红移。配合物以插入的方式与小牛胸腺DNA结合,结合常数Kb分别为4. 78×10~5、6. 52×10~5、5. 97×10~5和6. 01×10~5L/mol,表明配合物可作为潜在的CT-DNA荧光探针,为探索DNA与有机小分子的作用提供了重要的参考。
- 张成路王静李静怡于向坤杨敬怡柴金华李益政王华玉宫荣庆
- 关键词:邻菲啰啉1,2,4-三嗪小牛胸腺DNA荧光探针钴配合物
- 光谱法探究苯乳酸与小牛胸腺DNA的作用机制被引量:1
- 2018年
- 为深入研究苯乳酸的防腐作用机制,采用紫外-可见光谱法和荧光光谱法研究苯乳酸与小牛胸腺DNA(Thymus DNA,ct-DNA)的相互作用。紫外光谱法测定ct-DNA在苯乳酸浓度逐渐增加的情况下呈现增色效应和微小的蓝移(3 nm),紫外结合常数为Kb=8.4×10~3 M^(-1)(R=0.98849);在苯乳酸存在的情况下ct-DNA的激发波长280 nm,发射波长(300~500)nm下荧光强度明显增加,同时EB-DNA复合体系的荧光强度逐渐减弱,发生荧光猝灭;根据Sterm-Volmer方程得到PLA与EB属于静态和动态混合的猝灭方式。综合紫外和荧光光谱法分析苯乳酸与ct-DNA发生了静电结合和嵌插结合的作用。将光谱学应用于天然抑菌物质的抑菌机制研究中,为后续研究奠定一定的理论基础。
- 黄云坡孙晶梅红霞罗仕园刘建春
- 关键词:苯乳酸小牛胸腺DNA紫外光谱荧光光谱
- 典型塑化剂对小牛胸腺DNA毒性作用机理的研究被引量:1
- 2018年
- 本文利用光谱技术探讨了邻苯二甲酸和典型塑化剂邻苯二甲酸二甲酯(DMP)、邻苯二甲酸二乙酯(DEP)、邻苯二甲酸二丁酯(DBP)对小牛胸腺脱氧核糖核酸(ct DNA)的毒性作用机制。实验结果表明,塑化剂邻苯二甲酸二甲酯、邻苯二甲酸二乙酯、邻苯二甲酸二丁酯与DNA作用后,塑化剂的特征荧光峰强度随着DNA浓度的升高而降低。利用计算出的猝灭常数与结合位点数,结合单双链差异实验,判断该猝灭过程低温状态下为动态猝灭与静态猝灭共存,高温状态下为静态猝灭; DNA与塑化剂以静电结合为主,同时具有嵌插结合等多种结合方式。综上所述,塑化剂对小牛胸腺DNA具有基因毒性,且随着塑化剂浓度升高基因毒性作用增强。
- 孙晓晶刘汝涛宗万松
- 关键词:塑化剂小牛胸腺DNA毒性作用荧光光谱分子模拟
- 光谱法及分子模拟研究青蒿素与小牛胸腺DNA的相互作用被引量:6
- 2018年
- 在pH7.4的Tris-HCl缓冲溶液中,采用紫外吸收光谱、荧光光谱结合溴化乙锭(EB)荧光探针、共振散射光谱以及DNA熔点(T_m)实验和分子模拟等技术,研究了青蒿素(QHS)与小牛胸腺DNA(ctDNA)分子间结合位点与结合机制。光谱实验结果显示,QHS与DNA发生减色效应,QHS的加入使EB-DNA体系发生静态荧光猝灭,QHS与DNA作用后其467nm处共振散射峰锐增,与QHS作用引起DNA的T_m值升高5℃,说明QHS竞争性地嵌插入DNA的碱基对中。通过计算获得QHS与DNA间结合常数Ka为1.43×10~3L/mol(298K)、0.99×10~3L/mol(304K)。分子模拟结果表明,QHS吡喃环部分结构嵌插到DNA小沟区域GA碱基对间,氢键和范德华力是两者间结合的主要非共价作用方式,该结论与光谱法和热力学所得结果一致。
- 金丽虹王梦欣周雅静朱海焕刘美慧张善凯顾锡辉申炳俊
- 关键词:青蒿素小牛胸腺DNA分子模拟
相关作者
- 张国文

- 作品数:214被引量:982H指数:17
- 供职机构:南昌大学
- 研究主题:相互作用 小牛胸腺DNA 荧光猝灭 分子模拟 光谱法
- 陈欢

- 作品数:278被引量:279H指数:10
- 供职机构:国家烟草质量监督检验中心
- 研究主题:烟碱 串联质谱法 气溶胶 手性柱 固相萃取净化
- 侯宏卫

- 作品数:439被引量:434H指数:10
- 供职机构:国家烟草质量监督检验中心
- 研究主题:吸烟机 烟碱 捕集装置 捕集器 挥发性有机化合物
- 胡清源

- 作品数:534被引量:1,353H指数:18
- 供职机构:国家烟草质量监督检验中心
- 研究主题:吸烟机 烟碱 串联质谱法 捕集装置 烟草
- 李来生

- 作品数:159被引量:794H指数:14
- 供职机构:南昌大学
- 研究主题:高效液相色谱法 键合 高效液相色谱 荧光法 SBA-15