搜索到4000篇“ 分子克隆“的相关文章
- 大肠杆菌多酚氧化酶的分子克隆及异源高效表达
- 2024年
- 菜籽粕、棉籽粕等非粮饲料资源存在的酚类化合物芥子碱、棉酚等抗营养因子,严重影响了其饲喂价值。本课题组筛选出的一株大肠杆菌属芥子碱降解菌SDB2已被证实能通过分泌多酚氧化酶来降解芥子碱和棉酚,本试验旨在运用基因工程技术克隆SDB2多酚氧化酶基因,实现其高效表达,为SDB2多酚氧化酶在饲料工业上的规模化应用奠定基础。从大肠杆菌SDB2中克隆出多酚氧化酶基因,将其与质粒pET28a连接后转化至大肠杆菌BL21感受态细胞中培养,通过PCR鉴定及质粒酶切验证方法构建重组菌株,同时对重组克隆基因进行生物信息学分析。采用“2×2”交叉试验设计,以温度和诱导剂IPTG浓度两个影响因素诱导SDB2多酚氧化酶基因在重组菌株中高效表达,经SDS-PAGE和WB双重验证后,确立最佳诱导条件,最终纯化出目标酶蛋白。结果表明:(1)成功克隆SDB2多酚氧化酶基因,构建出异源表达重组菌株。(2)克隆出的SDB2重组多酚氧化酶基因含目标核苷酸741个,总编码氨基酸263个(含标签氨基酸20个),氨基酸组成的蛋白相对分子质量为28499.0,理论等电点为6.94,据此预测出SDB2重组多酚氧化酶三维结构模型。(3)确立SDB2多酚氧化酶异源高效表达的最佳诱导条件为温度37℃,IPTG浓度1 mmol,该条件下表达出大量可溶性酶蛋白,有利于工业化生产。本试验条件下,大肠杆菌SDB2多酚氧化酶成功实现了分子克隆及异源高效表达,为我国非粮饲料资源实现高效利用提供了技术参考。
- 邓卉余丹邹成义范景胜李斌屈东倪青松郑钰嘉陈瑾
- 关键词:大肠杆菌多酚氧化酶克隆
- 掌叶大黄4个MYB转录因子的分子克隆及胁迫表达
- 2024年
- 旨在克隆获得 RpMYB2、 RpMYB3、 RpMYB5、 RpMYB6基因ORF,并对其理化特性、系统进化关系、不同组织表达、激素与非生物胁迫下的表达等展开分析。研究结果表明, RpMYB2、 RpMYB3、 RpMYB5、 RpMYB6依次编码333、275、293、291个氨基酸,分子质量分别为34.781、30.525、31.243、33.313 ku, 4个RpMYBs蛋白均为亲水性蛋白并具有较高的热稳定性,除 RpMYB2外其余3个基因结构主要为α-螺旋和无规则卷曲,且均定位于细胞核。由蛋白结构域和保守基序分析发现, RpMYB2、 RpMYB5含有1个HTH-MYB结构域, RpMYB3、 RpMYB6含有2个HTH-MYB结构域,且不同MYB转录因子包含的保守元件数量及种类存在差异,系统进化分析显示 RpMYB2、 RpMYB5属于R1-MYB亚家族, RpMYB3、 RpMYB6属于R2R3-MYB亚家族,与其结构域分类一致。实时荧光定量结果显示,根中 RpMYB2、 RpMYB6转录本丰度最高, RpMYB3、 RpMYB5基因分别在叶片、叶柄中高表达。经200μmol·L^(-1)脱落酸(abscisic acid, ABA)处理, RpMYB5于24 h达峰值;200μmol·L^(-1)茉莉酸甲酯(methyl jasmonate, MeJA)诱导 RpMYB6表达,表达量随时间推移呈逐渐上升趋势且于24 h最高(为0 h的10.30倍),抑制 RpMYB3表达;200μmol·L^(-1)水杨酸(salicylic acid, SA)诱导 RpMYB6表达最为明显,3 h表达量上调至0 h的21.84倍。RpMYBs在非生物胁迫处理下表达也各有差异, RpMYB2受高温胁迫诱导表达, RpMYB3在损伤、高温胁迫下表达下调, RpMYB5在损伤胁迫下表达受抑制, RpMYB6响应高温、盐胁迫。
- 赵霞李元敏李依民胡晓晨高静高静张岗
- 关键词:掌叶大黄MYB胁迫实时荧光定量PCR
- 意大利蜜蜂AmMETTL3基因的分子克隆与表达模式
- 2024年
- 为克隆意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica)的AmMETTL3基因,解析AmMETTL3蛋白的分子特性,并测定AmMETTL3在工蜂不同组织及发育时期的表达谱。通过PCR扩增AmMETTL3的CDS并进行Sanger测序验证;使用相关生物信息学软件预测AmMETTL3的理化性质和分子特性,鉴定METTL3的结构域和保守基序,并构建系统进化树;采用RT-qPCR检测AmMETTL3在工蜂7个组织及5个不同发育时期的相对表达量。结果表明:成功克隆到AmMETTL3的CDS并发现AmMETTL3不含典型的跨膜结构域和信号肽;METTL3在各种昆虫中高度保守且含1个MT-A70结构域和3个相同的保守基序;AmMETTL3与东方蜜蜂METTL3的亲缘关系最近;相较于触角中的表达量,AmMETTL3的表达量在咽下腺中极显著上调(P<0.01),在中肠中极显著下调(P<0.01);AmMETTL3在3日龄幼虫中的表达量极显著(P<0.01)低于卵中的表达量,在12日龄蛹中的表达量极显著(P<0.01)高于卵中的表达量,在2、6、12、15和18日龄工蜂体内的表达量极显著(P<0.01)低于1日龄工蜂体内的表达量。研究结果为深入探究AmMETTL3的功能及其参与的表观调控机制提供了参考和依据。
- 刘小玉刘治滩荆欣冯佩林高旭泽吴鹰李琪明樊念陈大福付中民郭睿
- 关键词:意大利蜜蜂分子特性
- 一种快速分子克隆方法
- 本文提供了一种基于T7 DNA聚合酶的快速不依赖于序列和连接酶的分子克隆(T7‑rSLIC)方法及应用。传统不依赖于序列和链接酶的克隆方法过程长并且步骤复杂,此方法设计简洁,成本低廉,过程简单,耗时短并且可用于多片段组装...
- 王成王锡衍王端阳
- 东方蜜蜂微孢子虫RCDP42基因的分子克隆与生物信息学分析
- 2023年
- 对东方蜜蜂微孢子虫RCDP 42基因进行分子克隆,并通过生物信息学解析RCDP 42蛋白的分子特性,进而对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RCDP 42蛋白进行保守基序和结构域预测及分析。结果表明,成功克隆到东方蜜蜂微孢子虫RCDP 42基因的CDS区,RCDP 42基因在孢子中真实表达,含有540个核苷酸,可编码179个氨基酸;RCDP 42蛋白的分子质量约为20.3 ku,分子式为C_(915)H_(1416)N_(230)O_(274)S_(10),脂溶系数为86.03,等电点为6.57;包含的亲水氨基酸数量多于疏水氨基酸,但不含信号肽与跨膜结构域,说明RCDP 42可能为亲水性蛋白、胞内蛋白和非跨膜蛋白,可能包含16个磷酸化位点、63个α-螺旋、43条延长链、11个β-转角及62个无规则卷曲。在东方蜜蜂微孢子虫、蚱蜢脑炎微孢子虫和肠脑炎微孢子虫的RCDP 42蛋白中均鉴定到3个保守基序(motif 1、motif 2和motif 3)与1个结构域(Rho)。
- 郭睿张凯遥张佳欣郭思佳张浩宇何旭江赵红霞付中民陈大福
- 关键词:分子克隆分子特性系统进化
- “虚拟仿真”实验在《DNA重组与分子克隆实训》的教学应用
- 2023年
- 虚拟仿真实验是以信息技术为基础结合相关领域的知识,利用计算机创建模拟真实环境的实验平台。文章分别从实验前、实验中、实验后三个过程介绍虚拟仿真实验在《DNA重组与分子克隆实训》课程授课中的应用情况,以期为《DNA重组与分子克隆实训》实验教学改革提供参考。
- 徐璐卢明晓顾志良郁建锋冀宏
- 关键词:分子生物学
- 日本三角涡虫hsp60基因的分子克隆和功能研究
- 2023年
- 以日本三角涡虫Dugesia japonica为研究对象,通过cDNA末端快速扩增技术首次获得涡虫hsp60基因,cDNA全长1851 bp,编码575个氨基酸的蛋白质,命名为DjHSP60。生物信息学分析表明,DjHSP60含有HSP60家族的标签序列和末端重复序列GGM,亚细胞定位分析显示该蛋白定位于线粒体,属于线粒体HSP60家族。整体原位杂交和双荧光原位杂交显示,Djhsp60阳性细胞主要分布在实质组织中,具有干细胞的特征。涡虫切割后再生1 d,Djhsp60在伤口处的组织中表达显著增强,但随着再生进行,表达量逐渐降低。采用RNAi技术敲除Djhsp60导致涡虫头部逐渐退化,失去再生能力。原位杂交和qPCR研究结果证明,RNAi-Djhsp60下调干细胞相关基因的表达。上述结果揭示Djhsp60在涡虫再生中可能发挥重要作用,为进一步研究Djhsp60调控涡虫干细胞增殖的分子机制奠定了良好基础。
- 陆琼李睿宋鸽鸽马克学
- 关键词:日本三角涡虫分子克隆RNA干扰
- 东方蜜蜂微孢子虫20sPS基因的分子克隆与生物信息学分析
- 2023年
- 为解析东方蜜蜂微孢子虫Nosemaceranae的20s蛋白酶体亚基(20sproteinsomesubmit,20sPS)基因20s PS的分子特性,鉴定东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的20sPS蛋白的保守基序和结构域并进行系统进化分析,通过常规PCR扩增20sPS的CDS区并进行TA克隆。通过Expasy网站上的相关软件预测和分析20sPS的理化性质、跨膜螺旋域、信号肽、磷酸化位点、二级结构和三级结构。采用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种20s PS的保守基序。利用TBtools软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种20sPS的结构域。使用Mega11.0软件构建东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的20s PS的系统进化树。成功克隆到东方蜜蜂微孢子虫20s PS的CDS区,20s PS在孢子中真实表达。20sPS基因含有618个核苷酸,可编码205个氨基酸;20sPS蛋白的分子式为C_(1022)H_(1582)N_(26)0_(O316)S_(12),分子量约为22.95 kDa,脂溶系数为78.93,等电点为5.00,平均亲水系数为-0.157;不含跨膜螺旋域和典型信号肽;包含14个丝氨酸酸化位点,5个络氨酸酸化位点及6个苏氨酸磷酸化位点;包含73个α-螺旋,46个延长链,21个β-转角和65个无规-则卷曲;可同时定位于细胞质、细胞核和线粒体;与模板5mp9.1.J之间的同源性为37.75%。东方蜜蜂微孢子虫、蚱蜢脑炎微孢子虫Encephalitozoon romaleae和肠脑炎微胞子虫Encephalitozoon intestinalis等7个物种的20s PS中均含有5个相同的保守基序(motif1,motif2,motif3,motif4和motif5)。东方蜜蜂微孢子虫、蜜蜂微孢子虫Nosema apis、杀线虫spNematocidasp、泛孢虫Pancytosporaphilotis和毕氏肠微孢子虫Pancytosporaphilotis的20sPS中均包含Ntn_hydrolase superfamily结构域。东方蜜蜂微孢子虫20sPS(XP_024330780.1)与蜜蜂微孢子虫20sPS(EQB61106.1)聚为一支,进化距离最近。研究结果丰富了东方蜜蜂微孢子虫20sPS的信息,并揭示20sPS可能是亲水性蛋白、胞内蛋白和非跨膜蛋白,东方蜜蜂微孢子虫与蜜蜂微孢子
- 王思懿张艺琼高旭泽荆欣冯佩林刘小玉朱乐冉陈大福郭睿徐国钧
- 关键词:分子克隆系统进化
- 凡纳滨对虾过氧化物还原酶3基因的分子克隆与功能分析被引量:2
- 2023年
- 【目的】探究凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)过氧化物还原酶3(Peroxiredoxin 3,Prx3)基因(LvPrx3)的结构特征、组织分布和抗胁迫能力,为揭示凡纳滨对虾抗环境胁迫的应答机制提供理论依据。【方法】通过RACE克隆技术取得LvPrx3基因的全长cDNA序列,应用Clustal X、EditSeq、ExPASy、MEGA 6.0、SignalP 5.0和TMHMM 2.0等多个软件开展Prx3的生物信息学分析。运用半定量PCR和qRT-PCR技术检测分析LvPrx3基因在多种组织和不同胁迫条件下的表达响应情况。【结果】LvPrx3基因cDNA全长序列962 bp,内含45 bp 5′端非编码区(5′-UTR)、233 bp 3′端非编码区(3′-UTR)和684 bp开放阅读框(ORF),可编码227个氨基酸残基。LvPrx3的蛋白分子质量为25.09 ku,理论等电点(pI)为6.22,属于典型的2-Cys Prx,包含高度保守的“FYPLDFTFVCPTE”N端和“GEVCPA”C端。进化树分析显示,LvPrx3与节肢动物门的Prx亲缘关系较近,与斑节对虾(Penaeus monodon)的Prx氨基酸序列相似性最高,为98%。LvPrx3在眼柄中的表达量最高,肠道次之,在其他组织中的表达量无明显区别。脂多糖(LPS)注射后,眼柄中LvPrx3的表达分别在胁迫3 h和12~48 h时显著上调,而肠道中,LvPrx3表达量在胁迫3~24 h时均显著下调;在4-壬基酚(4-NP)胁迫后,眼柄中LvPrx3表达量在胁迫6~24 h后显著上调,24 h时最高,为对照组的4.11倍;肠道中的LvPrx3表达量在胁迫12 h时显著上调,在胁迫48 h时显著下调;以上显著性水平α均为0.05。【结论】LvPrx3基因属典型的2-Cys Prx,主要在凡纳滨对虾眼柄和肠道中高表达。脂多糖LPS刺激和4-NP胁迫可明显诱导凡纳滨对虾LvPrx3基因的表达水平,表明LvPrx3在对虾抵御病原菌感染及抗逆境胁迫的调控中发挥重要作用。
- 郭慧李腾张秀霞鲁耀鹏张泽龙李军涛李军涛冼健安
- 关键词:凡纳滨对虾脂多糖
- 高黎贡山猪繁殖相关基因FKBP4、NPM2和FZD2的分子克隆、组织表达、多态性及关联分析
- 母猪繁殖力在猪生产养殖中起着至关重要的作用,FKBP4、NPM2和FZD2基因是与繁殖相关的重要基因。本研究以高黎贡山猪为试验材料,通过RACE-PCR克隆高黎贡山猪的FKBP4、NPM2和FZD2基因。利用生物信息学工...
- 杨圆圆
- 关键词:分子克隆多态性
相关作者
- 童光志

- 作品数:879被引量:3,785H指数:30
- 供职机构:中国农业科学院上海兽医研究所
- 研究主题:猪繁殖与呼吸综合征病毒 PRRSV 传染性喉气管炎病毒 单克隆抗体 重组鸡痘病毒
- 汪铭书

- 作品数:895被引量:1,711H指数:25
- 供职机构:四川农业大学
- 研究主题:鸭瘟病毒 鸭疫里默氏杆菌 病毒 鸭瘟 DPV
- 程安春

- 作品数:1,071被引量:2,136H指数:26
- 供职机构:四川农业大学
- 研究主题:鸭瘟病毒 鸭疫里默氏杆菌 病毒 鸭瘟 DPV
- 陈舜

- 作品数:162被引量:63H指数:5
- 供职机构:四川农业大学
- 研究主题:鸭疫里默氏杆菌 病毒 鸭瘟病毒 分子克隆 原核表达
- 邓志辉

- 作品数:211被引量:688H指数:13
- 供职机构:深圳市血液中心
- 研究主题:人类白细胞抗原 测序分型 等位基因 HLA 遗传多态性