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- 一种基于计算机视觉的猴脸亲缘关系分析方法
- 本发明公开一种基于计算机视觉的猴脸亲缘关系分析方法,包括基于手工标记的猴脸图像,运用Faster R‑CNN模型训练猴脸检测器;基于猴脸检测器获取猴脸坐标并保存猴脸图像,结合已有的猴子身份,种群信息,建立一个猴脸图像数据...
- 张嫚宁谢晓华龚文勇
- 提高基于DNA的亲缘关系分析的准确性的方法和组合物
- 本公开在某些方面涉及执行基于DNA的亲缘关系分析(包括一级、二级、三级、四级、五级或六级或更高级亲属)的改进方法,包括样品制备、测序技术和方法。在某些方面中,本公开描述了利用本文所描述的染色体特异性亲缘关系概率和/或亚基...
- 琼·斯内德克尔蒂姆·芬内尔赛斯·斯塔迪克
- 基于SSR标记的148份玉米自交系亲缘关系分析
- 2024年
- 利用40对核心SSR标记分析148份玉米自交系的遗传多样性与亲缘关系。结果表明,40对核心SSR标记在148份玉米自交系中共检测出136个等位变异,每个SSR标记得出的等位变异总数为2~6个,平均3.4个;有效等位基因数(Ne)变幅为1.2323~5.0050,平均2.3939;基因多样性变幅为0.1885~0.8002,平均为0.5252;引物的多态性信息含量(PIC)变幅为0.1781~0.7705,平均0.4617。利用UPGMA聚类法将148份玉米自交系划分为Reid、旅大红骨、PB、Lancaster、塘四平头、中间类群,共6个类群,其中,主要以Reid、旅大红骨、PB、Lancaster和塘四平头这5个类群为主,种群的划分与系谱基本吻合。
- 李庆锋任雪娇许赢叶春旺王瑞鑫张淼慈佳宾姜良宇杨伟光
- 关键词:玉米SSR标记亲缘关系分析聚类分析
- 一种可用于山茶亚属近缘种亲缘关系分析的cpDNA基因间隔区分子标记
- 本发明涉及分子标记技术领域,具体涉及一种可用于山茶亚属近缘种亲缘关系分析的cpDNA基因间隔区分子标记;包括山茶属近缘种(浙江红山茶、南山茶、小果油茶和短柱茶)叶绿体基因组的测序与比较,叶绿体基因组高变异基因间隔区的获取...
- 温强殷鑫刘丽婷黄彬万承永王波查康汪雁楠朱恒李晓辉龚春徐立安
- 陈旧骨骼牙齿进行复杂亲缘关系分析
- 2024年
- 目的 通过提取陈旧骨骼、牙齿中的DNA进行复杂亲缘关系鉴定。方法 对1-4号遗骸的股骨、牙齿进行预处理,在大体系疑难检材DNA提取仪上提取,并进行定量;血样采用96道全自动工作站提取;所有样本均采用VeriFiler Plus等5种不同试剂盒进行扩增检测;对1号遗骸、孙1进行线粒体全基因组测序;根据检验结果进行亲缘关系分析。结果 根据常染色体STR分型,1号与2号遗骸存在亲缘关系,1号遗骸与贾1、贾2、贾3、孙1存在祖孙关系;根据Y染色体STR分型,2号、3号遗骸与贾1、贾2、贾3倾向来自同一父系,4号遗骸与贾1等Y-STR分型不一致,不符合同一父系遗传特征;根据mtDNA全基因组检测结果,不排除1号遗骸与孙1来自同一母系。结论 通过优化预处理、提取方法以及多种检测技术联合应用,并运用多种亲缘评判标准,能够对陈旧的骨骼、牙齿等疑难检材进行复杂亲缘分析。
- 王雅楠张庆霞王洁
- 关键词:法医物证学DNA测序陈旧骨骼
- 89份香蕉种质资源SRAP分子标记亲缘关系分析
- 2024年
- 香蕉分类是一个难题,利用形态学特征进行分类已无法满足需要。分子标记技术逐渐被应用到香蕉品种(系)的种群鉴定与分类、亲缘关系分析和遗传多样性研究等方面。本研究采用SRAP分子标记技术对89份香蕉种质资源的亲缘关系进行分析。利用10对正反引物两两组合成100对引物组合,从中筛选出扩增条带易于识别、带型清晰、多态性高的13对SRAP引物,共扩增出170条可辨认条带,平均每对引物扩增13.08条,其中表现出多态性的条带有140条,多态性比率为79.00%。89份香蕉种质资源的相似系数的变化范围在0.241~1.000之间,遗传多样性非常丰富,来源于同一个地方或者来源不同地方的同一类型的野生蕉的相似性系数较高。当相似性系数为0.49时可以将这89份香蕉资源分成六大类,包括香牙蕉、贡蕉和龙牙蕉为主的第一大类(AAA、AA、AAB基因型),粉大蕉、粉蕉和BB类野蕉为主的第二大类(ABB、BB基因型),大蕉、阿宽蕉类野蕉为主的第三大类,以及红花蕉、地涌金莲、蝎尾蕉分别所属的第四、五、六类群。其结果与现行的经典分类结论基本一致,只有部分香蕉种质分类地位有差异,说明用SRAP标记对香蕉种质资源进行分类是可行的。同时,栽培类香牙蕉、贡蕉和龙牙蕉具有相同的祖先,与AA基因型野蕉亲缘关系近,粉蕉、粉大蕉与BB基因型的野蕉亲缘关系较近,不同基因组的香蕉种质资源聚到一起,说明香蕉种质资源的起源影响后代的亲缘关系,单一的分类方法无法将香蕉种质资源完全区分。此外,大蕉与阿宽蕉亲缘关系较近,但是无法分辨大蕉是否含有A和B基因组,因此大蕉基因型和遗传背景有待进一步研究。
- 周海琪夏玲吕顺曾莉莎王芳黄晓彦陈东仪刘文清梁少丽刘丽琴
- 关键词:香蕉SRAP亲缘关系
- 基于EST-SSR分子标记的萱草亲缘关系分析
- 2024年
- 萱草是极具观赏价值的多年生宿根草本植物,在我国具有悠久的栽种历史。为了探明36个萱草品种间的亲缘关系,利用毛细管电泳荧光标记技术对36个萱草品种进行了EST-SSR分子标记检测,利用11对多态性良好的引物对36份供试萱草材料进行PCR扩增。结果显示:11对引物共获得40个多态性位点,样本平均有效等位基因数为2.58个,平均Shannon多样性指数为1.00,平均期望杂合度为0.57,平均观察杂合度为0.52;以遗传距离矩阵为分析对象,36个萱草品种间的遗传距离为0.05~0.70,利用NTSYS软件按UPGMA法聚类结果显示,遗传距离0.48为阈值时,36种萱草品种分为2个大类,遗传距离0.414为阈值时,可进一步将第1大类分为4个亚类。综上,供试的36个萱草品种之间具有较高的遗传多样性和较为丰富的遗传背景,为今后培养萱草优良新品种提供了一定的理论依据。
- 赵玉帆储博彦刘素素赵丽红李金霞尹新彦
- 关键词:萱草亲缘关系
- 谷子四大名米品种群农艺及品质性状评价与亲缘关系分析被引量:1
- 2024年
- 对谷子四大名米(沁州黄、桃花米、龙山小米及金米)原始地方品种及其同名品种共计179份开展为期两年的农艺性状调查并对其进行基于SNP标记的亲缘关系分析,从中选择51份进行营养品质测定。结果表明:从农艺性状来看,四类名米品种在数量性状上具有明显差异,而质量性状在不同类品种间差异不大。相关性分析表明,穗重与穗粒重、草重与穗重呈极显著正相关。主成分分析表明前3个主成分解释了累积变异的89.414%,基于主成分分析结果计算了综合得分F值,菠菜根-30的综合得分最高(F=7.42),阴天旱-27的综合得分最低(F=-9.17)。亲缘关系结果表明,各同名品种间存在多样的进化关系,不同名品种间可能存在基因交流。基于农艺性状对179份材料进行聚类分析,发现材料划归4个类群,同名品种内聚集相对集中,农艺性状相似度较大。从营养品质上看,四类名米间营养品质差异较小,除粗纤维外其余营养品质指标差异均不显著。相关性分析发现粗蛋白与粗脂肪呈现显著的正相关;淀粉与蛋白质、脂肪之间呈现显著的负相关。主成分分析表明前6个主要成分解释了累积变异的88.414%,能够基本涵盖10个营养品质的信息,基于主成分分析,结合不同品种谷子的综合得分,对小米品质进行排名,排名靠前的品种有菠菜根-77、菠菜根-33、菠菜根-44、爬坡糙-15、九根齐-25和阴天旱-13。本研究对四大名米品种群的农艺性状、品质性状和亲缘关系的鉴定和研究,对种质资源保护和利用,以及优异资源的挖掘具有重要意义。
- 薛亚鹏王蓉柴小娇王若楠王倩刘少雄王瑞云王瑞云
- 关键词:营养品质亲缘关系
- 14种酢浆草属植物花粉形态及其亲缘关系分析
- 2024年
- 利用扫描电镜对14种酢浆草属植物花粉形态及表面纹饰进行观测,对其花粉形态进行聚类分析,并基于孢粉学聚类结果,探讨其种间亲缘关系。结果表明:(1)所观测的14种植物花粉粒为近球形或扁球形,极面观均为三裂圆形,多数为3沟花粉粒,稀2沟(星星酢浆草)和4沟(黄花酢浆草);其中,96.3%花粉粒为中等大小,3.7%为小花粉粒;不同花柱类型都表现为长雄蕊花粉比短雄蕊花粉大;外壁纹饰可分为复网状和网状两类。(2)首次发现3种存在异常花粉粒,分别为桃之辉酢浆草、一片心酢浆草及黄花酢浆草,花粉的异常表现为萌发沟数目和排列异常,其外壁纹饰结构与正常花粉粒未有明显不同。(3)根据外壁纹饰可将14种划分为2大类。一类为复网状花粉,仅构巢酢浆草和果香酢浆草为该类纹饰,二者亲缘关系较近。另一类为网状花粉,对12种具网状花粉酢浆草进行聚类分析可划分为4个类型,其中桃之辉酢浆草、双色冰淇淋酢浆草、藤双色冰淇淋酢浆草亲缘关系较近;扁平酢浆草、黄花酢浆草、纳马夸纳酢浆草及兔耳酢浆草亲缘关系较近;大花酢浆草、星星酢浆草、乳白蝴蝶叶酢浆草亲缘关系较近;吉氏酢浆草和一片心酢浆草与其他酢浆草亲缘关系较远。该研究结果表明,花粉形态相近的物种在植株形态上有一定的相似性,花粉形态特征可作为种间亲缘关系研究和分类划分依据,进一步为酢浆草属植物杂交育种亲本选择提供理论基础。
- 陈生煜唐小云肖云韩茹翟俊文吴沙沙
- 关键词:花粉形态亲缘关系
- 基于SSR的云南野生猕猴桃种质资源亲缘关系分析
- 2024年
- 为探讨云南猕猴桃属种质资源的亲缘关系,采用SSR分子标记方法对70份云南野生猕猴桃种质资源的亲缘关系进行分析。UPGMA聚类分析结果表明,70份猕猴桃种质资源在遗传相似系数0.17水平上可分为4个类群,类群Ⅰ共6份材料,包括滇东南麻栗坡的中越猕猴桃MLP001和MLP010、西畴的中越猕猴桃TSH-1和TSH-4,以及滇南屏边的中越猕猴桃PB001和PB005;类群Ⅱ共31份材料,主要包括滇东北的18份材料,滇西北的3份紫果猕猴桃TC-8、TC-1、TC-10,以及5份贡山猕猴桃CJ-11、CJ-13、CJ-7、CJ-3、CJ-2;类群Ⅲ共14份材料,主要包括滇东北的10份美味猕猴桃和中华猕猴桃系列材料,滇东的JZS-5、JZS-9及JZS-7,以及滇东南西畴的黄毛猕猴桃XPS-1;类群Ⅳ共19份材料,主要包括滇东北的16份材料,滇东南西畴的京梨猕猴桃XCFD-1及革叶猕猴桃XCFD-3,果实无被毛且果皮带斑点,果实较小,与其他类群具有较远的亲缘关系。SSR分子标记反映了云南猕猴桃属70份种质资源间的遗传亲缘关系,其中一些材料按种类、资源分布地及形态学性状特征形成明显有规律的聚类关系。
- 王连润万红陶磅陈霞李坤明沙毓沧丁仁展
- 关键词:野生猕猴桃亲缘关系种质资源SSR分子标记
相关作者
- 徐育海

- 作品数:61被引量:140H指数:8
- 供职机构:湖北省农业科学院
- 研究主题:板栗 湖北海棠 板栗品种 亲缘关系分析 选育
- 陈亮

- 作品数:563被引量:2,784H指数:32
- 供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
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- 孙中海

- 作品数:116被引量:834H指数:18
- 供职机构:湖北省农业科学院
- 研究主题:柑橘 柑桔 抗寒性 原生质体 板栗
- 王春琳

- 作品数:542被引量:1,250H指数:20
- 供职机构:宁波大学
- 研究主题:三疣梭子蟹 曼氏无针乌贼 拟穴青蟹 养殖 青蟹
- 张安世

- 作品数:68被引量:319H指数:9
- 供职机构:焦作师范高等专科学校
- 研究主题:苔藓植物 遗传多样性分析 SRAP 苔藓 DNA指纹图谱